RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376303.6

SYP-202, Transcript of synaptophysin, humanhuman

TSL 2

Gene SYP, Length 858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-202ENST00000376303 PAPPAQ13219 1627 aa24.43■■□□□ 1.5
SYP-202ENST00000376303 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa24.43■■□□□ 1.5
SYP-202ENST00000376303 DOT1LQ8TEK3 1739 aa24.43■■□□□ 1.5
SYP-202ENST00000376303 ZBTB7AO95365 584 aa24.41■■□□□ 1.5
SYP-202ENST00000376303 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa24.41■■□□□ 1.5
SYP-202ENST00000376303 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
SYP-202ENST00000376303 SLC27A3Q5K4L6 730 aa24.4■■□□□ 1.5
SYP-202ENST00000376303 USHBP1Q8N6Y0 703 aa24.4■■□□□ 1.5
SYP-202ENST00000376303 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
SYP-202ENST00000376303 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
SYP-202ENST00000376303 LRRC4BQ9NT99 713 aa24.39■■□□□ 1.49
SYP-202ENST00000376303 TATP17735 454 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
SYP-202ENST00000376303 PTGER2P43116 358 aa24.37■■□□□ 1.49
SYP-202ENST00000376303 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP24.37■■□□□ 1.49
SYP-202ENST00000376303 MTFR1LQ9H019 292 aa24.37■■□□□ 1.49
SYP-202ENST00000376303 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
SYP-202ENST00000376303 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa24.37■■□□□ 1.49
SYP-202ENST00000376303 LY75O60449 1722 aa24.36■■□□□ 1.49
SYP-202ENST00000376303 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa24.36■■□□□ 1.49
SYP-202ENST00000376303 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
SYP-202ENST00000376303 POLR3GLQ9BT43 218 aa24.35■■□□□ 1.49
SYP-202ENST00000376303 QSER1Q2KHR3 1735 aa24.35■■□□□ 1.49
SYP-202ENST00000376303 NSD2O96028 1365 aa24.34■■□□□ 1.49
SYP-202ENST00000376303 DCAF8L1A6NGE4 600 aa24.34■■□□□ 1.49
SYP-202ENST00000376303 ZNF827Q17R98 1081 aa24.34■■□□□ 1.49
SYP-202ENST00000376303 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa24.33■■□□□ 1.48
SYP-202ENST00000376303 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa24.33■■□□□ 1.48
SYP-202ENST00000376303 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
SYP-202ENST00000376303 AKT1S1Q96B36 256 aa24.32■■□□□ 1.48
SYP-202ENST00000376303 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
SYP-202ENST00000376303 WASHC2AQ641Q2 1341 aa24.31■■□□□ 1.48
SYP-202ENST00000376303 SGIP1Q9BQI5 828 aa24.3■■□□□ 1.48
SYP-202ENST00000376303 PKD1L3Q7Z443 1732 aa24.29■■□□□ 1.48
SYP-202ENST00000376303 NCAPD2Q15021 1401 aa24.28■■□□□ 1.48
SYP-202ENST00000376303 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa24.28■■□□□ 1.48
SYP-202ENST00000376303 SLC16A10Q8TF71 515 aa24.27■■□□□ 1.48
SYP-202ENST00000376303 POLKQ9UBT6 870 aa24.27■■□□□ 1.48
SYP-202ENST00000376303 KCNQ4P56696 695 aa24.26■■□□□ 1.47
SYP-202ENST00000376303 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa24.26■■□□□ 1.47
SYP-202ENST00000376303 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
SYP-202ENST00000376303 ITGB4P16144 1822 aa24.26■■□□□ 1.47
SYP-202ENST00000376303 CYP27B1O15528 508 aa24.25■■□□□ 1.47
SYP-202ENST00000376303 SYT17Q9BSW7 474 aa24.25■■□□□ 1.47
SYP-202ENST00000376303 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
SYP-202ENST00000376303 ARXQ96QS3 562 aa24.24■■□□□ 1.47
SYP-202ENST00000376303 PANK3Q9H999 370 aa24.24■■□□□ 1.47
SYP-202ENST00000376303 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa24.24■■□□□ 1.47
SYP-202ENST00000376303 EYA1Q99502 592 aa24.23■■□□□ 1.47
SYP-202ENST00000376303 COL24A1Q17RW2 1714 aa24.22■■□□□ 1.47
SYP-202ENST00000376303 YY1P25490 414 aa24.22■■□□□ 1.47
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SYP-202ENST00000376303 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa24.21■■□□□ 1.47
SYP-202ENST00000376303 UTRNP46939 3433 aa24.21■■□□□ 1.47
SYP-202ENST00000376303 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
SYP-202ENST00000376303 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa24.21■■□□□ 1.47
SYP-202ENST00000376303 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP24.21■■□□□ 1.47
SYP-202ENST00000376303 TAF1LQ8IZX4 1826 aa24.2■■□□□ 1.46
SYP-202ENST00000376303 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
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SYP-202ENST00000376303 MAP3K5Q99683 1374 aa24.18■■□□□ 1.46
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SYP-202ENST00000376303 POLD1P28340 1107 aa24.17■■□□□ 1.46
SYP-202ENST00000376303 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
SYP-202ENST00000376303 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa24.16■■□□□ 1.46
SYP-202ENST00000376303 IFNL2Q8IZJ0 200 aa24.14■■□□□ 1.45
SYP-202ENST00000376303 PIGBQ92521 554 aa24.14■■□□□ 1.45
SYP-202ENST00000376303 CHD4Q14839 1912 aa24.13■■□□□ 1.45
SYP-202ENST00000376303 PHKG2P15735 406 aa24.12■■□□□ 1.45
SYP-202ENST00000376303 MORC1Q86VD1 984 aa24.12■■□□□ 1.45
SYP-202ENST00000376303 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
SYP-202ENST00000376303 KNSTRNQ9Y448 316 aa24.12■■□□□ 1.45
SYP-202ENST00000376303 IGSF1Q8N6C5 1336 aa24.11■■□□□ 1.45
SYP-202ENST00000376303 MSH5O43196 834 aa24.11■■□□□ 1.45
SYP-202ENST00000376303 FLAD1Q8NFF5 587 aa24.11■■□□□ 1.45
SYP-202ENST00000376303 TMOD3Q9NYL9 352 aa24.1■■□□□ 1.45
SYP-202ENST00000376303 C4BP0C0L5 1744 aa24.1■■□□□ 1.45
SYP-202ENST00000376303 KLHL34Q8N239 644 aa24.07■■□□□ 1.44
SYP-202ENST00000376303 UBR3Q6ZT12 1888 aa24.07■■□□□ 1.44
SYP-202ENST00000376303 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa24.05■■□□□ 1.44
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SYP-202ENST00000376303 AK7Q96M32 723 aa24.05■■□□□ 1.44
SYP-202ENST00000376303 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
SYP-202ENST00000376303 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
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SYP-202ENST00000376303 ASAP1Q9ULH1 1129 aa24.03■■□□□ 1.44
SYP-202ENST00000376303 ERVV-2B6SEH9 535 aa24.02■■□□□ 1.44
SYP-202ENST00000376303 GPR162Q16538 588 aa24.02■■□□□ 1.44
SYP-202ENST00000376303 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
SYP-202ENST00000376303 MSL1Q68DK7 614 aa24.01■■□□□ 1.43
SYP-202ENST00000376303 DCAF5Q96JK2 942 aa24.01■■□□□ 1.43
SYP-202ENST00000376303 ATG3Q9NT62 314 aa24■■□□□ 1.43
SYP-202ENST00000376303 SSFA2P28290 1259 aa23.99■■□□□ 1.43
SYP-202ENST00000376303 ATP6V1AP38606 617 aa23.99■■□□□ 1.43
SYP-202ENST00000376303 LINC00116Q8NCU8 138 aa23.99■■□□□ 1.43
SYP-202ENST00000376303 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
SYP-202ENST00000376303 NLGN2Q8NFZ4 835 aa23.98■■□□□ 1.43
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