RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000363143.1

RNU6-623P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 623, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-623P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-623P-201ENST00000363143 A0A1W2PRU2 124 aa9.6□□□□□ -0.87
RNU6-623P-201ENST00000363143 RHOQP17081 205 aa9.6□□□□□ -0.87
RNU6-623P-201ENST00000363143 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa9.6□□□□□ -0.87
RNU6-623P-201ENST00000363143 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa9.6□□□□□ -0.87
RNU6-623P-201ENST00000363143 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa9.6□□□□□ -0.87
RNU6-623P-201ENST00000363143 IRF5Q13568 498 aa9.59□□□□□ -0.87
RNU6-623P-201ENST00000363143 OSBPL3Q9H4L5 887 aa9.59□□□□□ -0.87
RNU6-623P-201ENST00000363143 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa9.59□□□□□ -0.87
RNU6-623P-201ENST00000363143 CDC14CA4D256 554 aa9.58□□□□□ -0.88
RNU6-623P-201ENST00000363143 FAM181BA6NEQ2 426 aa9.58□□□□□ -0.88
RNU6-623P-201ENST00000363143 MEN1O00255 615 aa9.58□□□□□ -0.88
RNU6-623P-201ENST00000363143 TRAK2O60296 914 aa9.58□□□□□ -0.88
RNU6-623P-201ENST00000363143 RNF20Q5VTR2 975 aa9.58□□□□□ -0.88
RNU6-623P-201ENST00000363143 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
RNU6-623P-201ENST00000363143 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
RNU6-623P-201ENST00000363143 CEP126Q9P2H0 1117 aa9.58□□□□□ -0.88
RNU6-623P-201ENST00000363143 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
RNU6-623P-201ENST00000363143 TSGA10IPQ3SY00 556 aa9.57□□□□□ -0.88
RNU6-623P-201ENST00000363143 SV2AQ7L0J3 742 aa9.55□□□□□ -0.88
RNU6-623P-201ENST00000363143 CCDC125Q86Z20 511 aa9.55□□□□□ -0.88
RNU6-623P-201ENST00000363143 WHAMMQ8TF30 809 aa9.55□□□□□ -0.88
RNU6-623P-201ENST00000363143 POU4F2Q12837 409 aa9.54□□□□□ -0.88
RNU6-623P-201ENST00000363143 GRIP2Q9C0E4 1043 aa9.54□□□□□ -0.88
RNU6-623P-201ENST00000363143 GPC1P35052 558 aa9.53□□□□□ -0.88
RNU6-623P-201ENST00000363143 CLN3Q13286 438 aa9.53□□□□□ -0.88
RNU6-623P-201ENST00000363143 PHTF2Q8N3S3 785 aa9.53□□□□□ -0.88
RNU6-623P-201ENST00000363143 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa9.53□□□□□ -0.88
RNU6-623P-201ENST00000363143 RAB6BQ9NRW1 208 aa9.53□□□□□ -0.88
RNU6-623P-201ENST00000363143 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
RNU6-623P-201ENST00000363143 APBB1O00213 710 aa9.52□□□□□ -0.89
RNU6-623P-201ENST00000363143 GAS6Q14393 721 aa9.52□□□□□ -0.89
RNU6-623P-201ENST00000363143 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
RNU6-623P-201ENST00000363143 CYP2U1Q7Z449 544 aa9.52□□□□□ -0.89
RNU6-623P-201ENST00000363143 GDPD2Q9HCC8 539 aa9.52□□□□□ -0.89
RNU6-623P-201ENST00000363143 IL2RAP01589 272 aa9.51□□□□□ -0.89
RNU6-623P-201ENST00000363143 GSK3AP49840 483 aa9.51□□□□□ -0.89
RNU6-623P-201ENST00000363143 SLURP2P0DP57 97 aa9.5□□□□□ -0.89
RNU6-623P-201ENST00000363143 DBN1Q16643 649 aa9.5□□□□□ -0.89
RNU6-623P-201ENST00000363143 STAU1O95793 577 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
RNU6-623P-201ENST00000363143 VAC14Q08AM6 782 aa9.49□□□□□ -0.89
RNU6-623P-201ENST00000363143 ZNF592Q92610 1267 aa9.49□□□□□ -0.89
RNU6-623P-201ENST00000363143 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
RNU6-623P-201ENST00000363143 NLRP3Q96P20 1036 aa9.49□□□□□ -0.89
RNU6-623P-201ENST00000363143 HRH3Q9Y5N1 445 aa9.49□□□□□ -0.89
RNU6-623P-201ENST00000363143 SLC27A3Q5K4L6 730 aa9.48□□□□□ -0.89
RNU6-623P-201ENST00000363143 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
RNU6-623P-201ENST00000363143 NBPF15Q8N660 670 aa9.48□□□□□ -0.89
RNU6-623P-201ENST00000363143 TRIM52Q96A61 297 aa9.48□□□□□ -0.89
RNU6-623P-201ENST00000363143 ADAMTS8Q9UP79 889 aa9.48□□□□□ -0.89
RNU6-623P-201ENST00000363143 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa9.47□□□□□ -0.89
RNU6-623P-201ENST00000363143 GPR25O00155 361 aa9.47□□□□□ -0.89
RNU6-623P-201ENST00000363143 GNRH1P01148 92 aa9.47□□□□□ -0.89
RNU6-623P-201ENST00000363143 TRIM22Q8IYM9 498 aa9.47□□□□□ -0.89
RNU6-623P-201ENST00000363143 CNKSR1Q969H4 720 aa9.47□□□□□ -0.89
RNU6-623P-201ENST00000363143 DYRK1BQ9Y463 629 aa9.47□□□□□ -0.89
RNU6-623P-201ENST00000363143 ABL2P42684 1182 aa9.46□□□□□ -0.9
RNU6-623P-201ENST00000363143 CENPCQ03188 943 aa9.46□□□□□ -0.9
RNU6-623P-201ENST00000363143 MCM6Q14566 821 aa9.46□□□□□ -0.9
RNU6-623P-201ENST00000363143 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa9.46□□□□□ -0.9
RNU6-623P-201ENST00000363143 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa9.46□□□□□ -0.9
RNU6-623P-201ENST00000363143 CHIC2Q9UKJ5 165 aa9.46□□□□□ -0.9
RNU6-623P-201ENST00000363143 ARHGEF15O94989 841 aa9.45□□□□□ -0.9
RNU6-623P-201ENST00000363143 ADAMTS2O95450 1211 aa9.45□□□□□ -0.9
RNU6-623P-201ENST00000363143 THBS1P07996 1170 aa9.45□□□□□ -0.9
RNU6-623P-201ENST00000363143 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP9.45□□□□□ -0.9
RNU6-623P-201ENST00000363143 XAGE2Q96GT9 111 aa9.45□□□□□ -0.9
RNU6-623P-201ENST00000363143 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
RNU6-623P-201ENST00000363143 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
RNU6-623P-201ENST00000363143 LYPD4Q6UWN0 246 aa9.44□□□□□ -0.9
RNU6-623P-201ENST00000363143 SVOPQ8N4V2 548 aa9.44□□□□□ -0.9
RNU6-623P-201ENST00000363143 WASLO00401 505 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
RNU6-623P-201ENST00000363143 KCNMA1Q12791 1236 aa9.43□□□□□ -0.9
RNU6-623P-201ENST00000363143 RNF135Q8IUD6 432 aa9.43□□□□□ -0.9
RNU6-623P-201ENST00000363143 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
RNU6-623P-201ENST00000363143 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
RNU6-623P-201ENST00000363143 DOLKQ9UPQ8 538 aa9.43□□□□□ -0.9
RNU6-623P-201ENST00000363143 MYCP01106 439 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
RNU6-623P-201ENST00000363143 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
RNU6-623P-201ENST00000363143 WDR44Q5JSH3 913 aa9.42□□□□□ -0.9
RNU6-623P-201ENST00000363143 TAS1R3Q7RTX0 852 aa9.42□□□□□ -0.9
RNU6-623P-201ENST00000363143 ETNK1Q9HBU6 452 aa9.42□□□□□ -0.9
RNU6-623P-201ENST00000363143 PRM3Q9NNZ6 103 aa9.42□□□□□ -0.9
RNU6-623P-201ENST00000363143 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa9.42□□□□□ -0.9
RNU6-623P-201ENST00000363143 PHKA2P46019 1235 aa9.41□□□□□ -0.9
RNU6-623P-201ENST00000363143 SLFNL1Q499Z3 407 aa9.41□□□□□ -0.9
RNU6-623P-201ENST00000363143 OXLD1Q5BKU9 147 aa9.41□□□□□ -0.9
RNU6-623P-201ENST00000363143 GMCL1Q96IK5 515 aa9.4□□□□□ -0.9
RNU6-623P-201ENST00000363143 COG6Q9Y2V7 657 aa9.4□□□□□ -0.9
RNU6-623P-201ENST00000363143 F11P03951 625 aa9.39□□□□□ -0.91
RNU6-623P-201ENST00000363143 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
RNU6-623P-201ENST00000363143 USP4Q13107 963 aa9.39□□□□□ -0.91
RNU6-623P-201ENST00000363143 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
RNU6-623P-201ENST00000363143 PIK3CDO00329 1044 aa9.38□□□□□ -0.91
RNU6-623P-201ENST00000363143 SCNN1DP51172 638 aa9.38□□□□□ -0.91
RNU6-623P-201ENST00000363143 C4orf17Q53FE4 359 aa9.38□□□□□ -0.91
RNU6-623P-201ENST00000363143 POM121Q96HA1 1249 aa9.38□□□□□ -0.91
RNU6-623P-201ENST00000363143 GPAMQ9HCL2 828 aa9.38□□□□□ -0.91
RNU6-623P-201ENST00000363143 IGF1RP08069 1367 aa9.37□□□□□ -0.91
RNU6-623P-201ENST00000363143 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
RNU6-623P-201ENST00000363143 WASHC4Q2M389 1173 aa9.37□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.9 ms