RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000354833.7

SERF1A-202, Transcript of small EDRK-rich factor 1A, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SERF1A, Length 1,889 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERF1A-202ENST00000354833 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP31.2■■■□□ 2.58
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SERF1A-202ENST00000354833 NCAPD2Q15021 1401 aa31.18■■■□□ 2.58
SERF1A-202ENST00000354833 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP31.18■■■□□ 2.58
SERF1A-202ENST00000354833 AXIN2Q9Y2T1 843 aa31.18■■■□□ 2.58
SERF1A-202ENST00000354833 GNAT3A8MTJ3 354 aa31.17■■■□□ 2.58
SERF1A-202ENST00000354833 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP31.17■■■□□ 2.58
SERF1A-202ENST00000354833 AAMPQ13685 434 aa31.17■■■□□ 2.58
SERF1A-202ENST00000354833 C8orf58Q8NAV2 365 aa31.17■■■□□ 2.58
SERF1A-202ENST00000354833 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP31.17■■■□□ 2.58
SERF1A-202ENST00000354833 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP31.16■■■□□ 2.58
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SERF1A-202ENST00000354833 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa31.16■■■□□ 2.58
SERF1A-202ENST00000354833 CLUAP1Q96AJ1 413 aa31.16■■■□□ 2.58
SERF1A-202ENST00000354833 MAP3K5Q99683 1374 aa31.16■■■□□ 2.58
SERF1A-202ENST00000354833 TRIM27P14373 513 aa31.15■■■□□ 2.58
SERF1A-202ENST00000354833 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP31.14■■■□□ 2.58
SERF1A-202ENST00000354833 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP31.14■■■□□ 2.58
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SERF1A-202ENST00000354833 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP31.13■■■□□ 2.57
SERF1A-202ENST00000354833 KIAA0232Q92628 1395 aa31.13■■■□□ 2.57
SERF1A-202ENST00000354833 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa31.13■■■□□ 2.57
SERF1A-202ENST00000354833 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP31.13■■■□□ 2.57
SERF1A-202ENST00000354833 LRRC37A3O60309 1634 aa31.13■■■□□ 2.57
SERF1A-202ENST00000354833 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP31.12■■■□□ 2.57
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SERF1A-202ENST00000354833 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa31.12■■■□□ 2.57
SERF1A-202ENST00000354833 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP31.11■■■□□ 2.57
SERF1A-202ENST00000354833 CABLES1Q8TDN4 633 aa31.11■■■□□ 2.57
SERF1A-202ENST00000354833 ERBB3P21860 1342 aa31.11■■■□□ 2.57
SERF1A-202ENST00000354833 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP31.1■■■□□ 2.57
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SERF1A-202ENST00000354833 IL17REQ8NFR9 667 aa31.07■■■□□ 2.56
SERF1A-202ENST00000354833 CPDO75976 1380 aa31.07■■■□□ 2.56
SERF1A-202ENST00000354833 ARHGAP45Q92619 1136 aa31.06■■■□□ 2.56
SERF1A-202ENST00000354833 COL18A1P39060 1754 aa31.06■■■□□ 2.56
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SERF1A-202ENST00000354833 AMOTQ4VCS5 1084 aa31.05■■■□□ 2.56
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SERF1A-202ENST00000354833 KRT24Q2M2I5 525 aa31.04■■■□□ 2.56
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SERF1A-202ENST00000354833 ABCC4O15439 1325 aa30.93■■■□□ 2.54
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SERF1A-202ENST00000354833 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa30.89■■■□□ 2.54
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SERF1A-202ENST00000354833 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP30.87■■■□□ 2.53
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SERF1A-202ENST00000354833 WDR17Q8IZU2 1322 aa30.81■■■□□ 2.52
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SERF1A-202ENST00000354833 KDM3BQ7LBC6 1761 aa30.81■■■□□ 2.52
SERF1A-202ENST00000354833 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa30.8■■■□□ 2.52
SERF1A-202ENST00000354833 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP30.8■■■□□ 2.52
SERF1A-202ENST00000354833 STK31Q9BXU1 1019 aa30.8■■■□□ 2.52
SERF1A-202ENST00000354833 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP30.79■■■□□ 2.52
SERF1A-202ENST00000354833 BTBD11A6QL63 1104 aa30.79■■■□□ 2.52
SERF1A-202ENST00000354833 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP30.79■■■□□ 2.52
SERF1A-202ENST00000354833 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP30.78■■■□□ 2.52
SERF1A-202ENST00000354833 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP30.77■■■□□ 2.52
SERF1A-202ENST00000354833 PHKG2P15735 406 aa30.76■■■□□ 2.52
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