RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000353437.10

GABRB2-202, Transcript of gamma-aminobutyric acid type A receptor beta2 subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GABRB2, Length 1,963 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2-202ENST00000353437 SSH1Q8WYL5 1049 aa22.31■■□□□ 1.16
GABRB2-202ENST00000353437 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
GABRB2-202ENST00000353437 NLRP2Q9NX02 1062 aa22.31■■□□□ 1.16
GABRB2-202ENST00000353437 CHL1O00533 1208 aa22.3■■□□□ 1.16
GABRB2-202ENST00000353437 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
GABRB2-202ENST00000353437 C8orf58Q8NAV2 365 aa22.3■■□□□ 1.16
GABRB2-202ENST00000353437 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
GABRB2-202ENST00000353437 PRDM11Q9NQV5 511 aa22.3■■□□□ 1.16
GABRB2-202ENST00000353437 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
GABRB2-202ENST00000353437 KRT24Q2M2I5 525 aa22.29■■□□□ 1.16
GABRB2-202ENST00000353437 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa22.29■■□□□ 1.16
GABRB2-202ENST00000353437 VAMP4O75379 141 aa22.29■■□□□ 1.16
GABRB2-202ENST00000353437 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
GABRB2-202ENST00000353437 ABCA3Q99758 1704 aa22.28■■□□□ 1.16
GABRB2-202ENST00000353437 LMO7Q8WWI1 1683 aa22.28■■□□□ 1.16
GABRB2-202ENST00000353437 MAP3K5Q99683 1374 aa22.27■■□□□ 1.16
GABRB2-202ENST00000353437 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
GABRB2-202ENST00000353437 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa22.27■■□□□ 1.16
GABRB2-202ENST00000353437 PANK1Q8TE04 598 aa22.27■■□□□ 1.15
GABRB2-202ENST00000353437 LGR6Q9HBX8 967 aa22.27■■□□□ 1.15
GABRB2-202ENST00000353437 SMC4Q9NTJ3 1288 aa22.26■■□□□ 1.15
GABRB2-202ENST00000353437 PIP4K2BP78356 416 aa22.25■■□□□ 1.15
GABRB2-202ENST00000353437 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
GABRB2-202ENST00000353437 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
GABRB2-202ENST00000353437 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
GABRB2-202ENST00000353437 RLBP1P12271 317 aa22.24■■□□□ 1.15
GABRB2-202ENST00000353437 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
GABRB2-202ENST00000353437 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
GABRB2-202ENST00000353437 CANXP27824 592 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
GABRB2-202ENST00000353437 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.23■■□□□ 1.15
GABRB2-202ENST00000353437 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
GABRB2-202ENST00000353437 ABCC6O95255 1503 aa22.22■■□□□ 1.15
GABRB2-202ENST00000353437 PDE3AQ14432 1141 aa22.21■■□□□ 1.15
GABRB2-202ENST00000353437 AMOTQ4VCS5 1084 aa22.21■■□□□ 1.15
GABRB2-202ENST00000353437 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa22.21■■□□□ 1.15
GABRB2-202ENST00000353437 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
GABRB2-202ENST00000353437 CLUAP1Q96AJ1 413 aa22.21■■□□□ 1.15
GABRB2-202ENST00000353437 TSPYL4Q9UJ04 414 aa22.21■■□□□ 1.15
GABRB2-202ENST00000353437 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
GABRB2-202ENST00000353437 AKAP4Q5JQC9 854 aa22.2■■□□□ 1.14
GABRB2-202ENST00000353437 COG6Q9Y2V7 657 aa22.2■■□□□ 1.14
GABRB2-202ENST00000353437 LRRC37A3O60309 1634 aa22.2■■□□□ 1.14
GABRB2-202ENST00000353437 TOM1O60784 492 aa22.19■■□□□ 1.14
GABRB2-202ENST00000353437 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa22.19■■□□□ 1.14
GABRB2-202ENST00000353437 MEGF6O75095 1541 aa22.19■■□□□ 1.14
GABRB2-202ENST00000353437 ALDH1L2Q3SY69 923 aa22.19■■□□□ 1.14
GABRB2-202ENST00000353437 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa22.18■■□□□ 1.14
GABRB2-202ENST00000353437 WDR17Q8IZU2 1322 aa22.18■■□□□ 1.14
GABRB2-202ENST00000353437 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
GABRB2-202ENST00000353437 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
GABRB2-202ENST00000353437 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
GABRB2-202ENST00000353437 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa22.18■■□□□ 1.14
GABRB2-202ENST00000353437 STRN4Q9NRL3 753 aa22.18■■□□□ 1.14
GABRB2-202ENST00000353437 UBAP1LF5GYI3 381 aa22.17■■□□□ 1.14
GABRB2-202ENST00000353437 TATP17735 454 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
GABRB2-202ENST00000353437 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
GABRB2-202ENST00000353437 TRIM27P14373 513 aa22.16■■□□□ 1.14
GABRB2-202ENST00000353437 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa22.16■■□□□ 1.14
GABRB2-202ENST00000353437 RNMTO43148 476 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
GABRB2-202ENST00000353437 C1orf141Q5JVX7 400 aa22.16■■□□□ 1.14
GABRB2-202ENST00000353437 ZNF428Q96B54 188 aa22.16■■□□□ 1.14
GABRB2-202ENST00000353437 PHLPP1O60346 1717 aa22.15■■□□□ 1.14
GABRB2-202ENST00000353437 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
GABRB2-202ENST00000353437 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
GABRB2-202ENST00000353437 EVA1CP58658 441 aa22.14■■□□□ 1.13
GABRB2-202ENST00000353437 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa22.14■■□□□ 1.13
GABRB2-202ENST00000353437 KCNQ3O43525 872 aa22.13■■□□□ 1.13
GABRB2-202ENST00000353437 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
GABRB2-202ENST00000353437 BTG4Q9NY30 223 aa22.13■■□□□ 1.13
GABRB2-202ENST00000353437 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
GABRB2-202ENST00000353437 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
GABRB2-202ENST00000353437 CYP27B1O15528 508 aa22.11■■□□□ 1.13
GABRB2-202ENST00000353437 CARD10Q9BWT7 1032 aa22.11■■□□□ 1.13
GABRB2-202ENST00000353437 PHKG2P15735 406 aa22.1■■□□□ 1.13
GABRB2-202ENST00000353437 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP22.1■■□□□ 1.13
GABRB2-202ENST00000353437 SPG7Q9UQ90 795 aa22.1■■□□□ 1.13
GABRB2-202ENST00000353437 ADAMTS2O95450 1211 aa22.09■■□□□ 1.13
GABRB2-202ENST00000353437 TEFQ10587 303 aa22.09■■□□□ 1.13
GABRB2-202ENST00000353437 KIF16BQ96L93 1317 aa22.09■■□□□ 1.13
GABRB2-202ENST00000353437 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
GABRB2-202ENST00000353437 BABAM1Q9NWV8 329 aa22.08■■□□□ 1.13
GABRB2-202ENST00000353437 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
GABRB2-202ENST00000353437 USP35Q9P2H5 1018 aa22.08■■□□□ 1.12
GABRB2-202ENST00000353437 TMEM57Q8N5G2 664 aa22.07■■□□□ 1.12
GABRB2-202ENST00000353437 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
GABRB2-202ENST00000353437 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
GABRB2-202ENST00000353437 BTBD11A6QL63 1104 aa22.07■■□□□ 1.12
GABRB2-202ENST00000353437 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
GABRB2-202ENST00000353437 MVPQ14764 893 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
GABRB2-202ENST00000353437 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
GABRB2-202ENST00000353437 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa22.06■■□□□ 1.12
GABRB2-202ENST00000353437 IFNL2Q8IZJ0 200 aa22.06■■□□□ 1.12
GABRB2-202ENST00000353437 NECTIN2Q92692 538 aa22.06■■□□□ 1.12
GABRB2-202ENST00000353437 PKD1L3Q7Z443 1732 aa22.05■■□□□ 1.12
GABRB2-202ENST00000353437 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
GABRB2-202ENST00000353437 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa22.05■■□□□ 1.12
GABRB2-202ENST00000353437 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
GABRB2-202ENST00000353437 SLC4A2P04920 1241 aa22.04■■□□□ 1.12
GABRB2-202ENST00000353437 G2E3Q7L622 706 aa22.04■■□□□ 1.12
GABRB2-202ENST00000353437 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms