RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000351328.7

CS-201, Transcript of citrate synthase, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 2,975 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-201ENST00000351328 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
CS-201ENST00000351328 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
CS-201ENST00000351328 LMO7Q8WWI1 1683 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-201ENST00000351328 PEAK1Q9H792 1746 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-201ENST00000351328 SLIT2O94813 1529 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-201ENST00000351328 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-201ENST00000351328 EVA1CP58658 441 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-201ENST00000351328 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
CS-201ENST00000351328 ANKRD24Q8TF21 1146 aa9.06□□□□□ -0.96
CS-201ENST00000351328 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
CS-201ENST00000351328 ERBB3P21860 1342 aa9.06□□□□□ -0.96
CS-201ENST00000351328 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
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CS-201ENST00000351328 UNC5CLQ8IV45 518 aa9.06□□□□□ -0.96
CS-201ENST00000351328 IL13P35225 146 aa9.06□□□□□ -0.96
CS-201ENST00000351328 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
CS-201ENST00000351328 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
CS-201ENST00000351328 NWD2Q9ULI1 1742 aa9.05□□□□□ -0.96
CS-201ENST00000351328 AFF2P51816 1311 aa9.05□□□□□ -0.96
CS-201ENST00000351328 CCER2I3L3R5 266 aa9.05□□□□□ -0.96
CS-201ENST00000351328 PTMAP06454 111 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
CS-201ENST00000351328 NEFMP07197 916 aa9.05□□□□□ -0.96
CS-201ENST00000351328 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
CS-201ENST00000351328 STRN4Q9NRL3 753 aa9.05□□□□□ -0.96
CS-201ENST00000351328 USP21Q9UK80 565 aa9.05□□□□□ -0.96
CS-201ENST00000351328 RGPD5Q99666 1765 aa9.05□□□□□ -0.96
CS-201ENST00000351328 BCL9LQ86UU0 1499 aa9.05□□□□□ -0.96
CS-201ENST00000351328 WDR17Q8IZU2 1322 aa9.05□□□□□ -0.96
CS-201ENST00000351328 PLCH1Q4KWH8 1693 aa9.05□□□□□ -0.96
CS-201ENST00000351328 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
CS-201ENST00000351328 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-201ENST00000351328 NUDCQ9Y266 331 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-201ENST00000351328 ADRA2BP18089 450 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-201ENST00000351328 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
CS-201ENST00000351328 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
CS-201ENST00000351328 VPS72Q15906 364 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-201ENST00000351328 GRIPAP1Q4V328 841 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-201ENST00000351328 CCDC184Q52MB2 194 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-201ENST00000351328 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
CS-201ENST00000351328 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-201ENST00000351328 MRS2Q9HD23 443 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-201ENST00000351328 NBPF6Q5VWK0 638 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-201ENST00000351328 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
CS-201ENST00000351328 NBPF4Q96M43 638 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-201ENST00000351328 EYA1Q99502 592 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-201ENST00000351328 CARD10Q9BWT7 1032 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-201ENST00000351328 CRB1P82279 1406 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-201ENST00000351328 NLRP2Q9NX02 1062 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-201ENST00000351328 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
CS-201ENST00000351328 NRAPQ86VF7 1730 aa9.02□□□□□ -0.96
CS-201ENST00000351328 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
CS-201ENST00000351328 IGSF1Q8N6C5 1336 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-201ENST00000351328 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-201ENST00000351328 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-201ENST00000351328 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
CS-201ENST00000351328 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
CS-201ENST00000351328 MCCP23508 829 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-201ENST00000351328 CNPY4Q8N129 248 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-201ENST00000351328 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
CS-201ENST00000351328 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
CS-201ENST00000351328 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-201ENST00000351328 CLGNO14967 610 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-201ENST00000351328 ATRNO75882 1429 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-201ENST00000351328 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
CS-201ENST00000351328 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP9□□□□□ -0.97
CS-201ENST00000351328 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP9□□□□□ -0.97
CS-201ENST00000351328 TCP11L2Q8N4U5 519 aa9□□□□□ -0.97
CS-201ENST00000351328 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
CS-201ENST00000351328 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
CS-201ENST00000351328 NCAPD2Q15021 1401 aa9□□□□□ -0.97
CS-201ENST00000351328 PTMSP20962 102 aa9□□□□□ -0.97
CS-201ENST00000351328 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
CS-201ENST00000351328 RGPD1P0DJD0 1748 aa9□□□□□ -0.97
CS-201ENST00000351328 FCHSD2O94868 740 aa9□□□□□ -0.97
CS-201ENST00000351328 FKBP8Q14318 412 aa9□□□□□ -0.97
CS-201ENST00000351328 SULT6B1Q6IMI4 303 aa9□□□□□ -0.97
CS-201ENST00000351328 KDRP35968 1356 aa8.99□□□□□ -0.97
CS-201ENST00000351328 RGPD2P0DJD1 1756 aa8.99□□□□□ -0.97
CS-201ENST00000351328 BARGINQ6ZT62 677 aa8.99□□□□□ -0.97
CS-201ENST00000351328 USHBP1Q8N6Y0 703 aa8.99□□□□□ -0.97
CS-201ENST00000351328 ADAMTS8Q9UP79 889 aa8.99□□□□□ -0.97
CS-201ENST00000351328 HMOX1P09601 288 aa8.98□□□□□ -0.97
CS-201ENST00000351328 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
CS-201ENST00000351328 SETQ01105 290 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
CS-201ENST00000351328 AEBP1Q8IUX7 1158 aa8.98□□□□□ -0.97
CS-201ENST00000351328 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
CS-201ENST00000351328 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
CS-201ENST00000351328 IL2RBP14784 551 aa8.98□□□□□ -0.97
CS-201ENST00000351328 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa8.98□□□□□ -0.97
CS-201ENST00000351328 PLCD4Q9BRC7 762 aa8.98□□□□□ -0.97
CS-201ENST00000351328 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
CS-201ENST00000351328 IGSF3O75054 1194 aa8.97□□□□□ -0.97
CS-201ENST00000351328 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
CS-201ENST00000351328 TATP17735 454 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
CS-201ENST00000351328 PDCL3Q9H2J4 239 aa8.97□□□□□ -0.97
CS-201ENST00000351328 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa8.97□□□□□ -0.97
CS-201ENST00000351328 POTEAQ6S8J7 498 aa8.97□□□□□ -0.97
CS-201ENST00000351328 DISP2A7MBM2 1401 aa8.96□□□□□ -0.97
CS-201ENST00000351328 RXRBP28702 533 aa8.96□□□□□ -0.97
CS-201ENST00000351328 PRKAR2BP31323 418 aa8.96□□□□□ -0.97
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