RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000349984.6

CCR6-202, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 2,980 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-202ENST00000349984 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa9.3□□□□□ -0.92
CCR6-202ENST00000349984 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa9.3□□□□□ -0.92
CCR6-202ENST00000349984 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
CCR6-202ENST00000349984 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
CCR6-202ENST00000349984 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
CCR6-202ENST00000349984 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
CCR6-202ENST00000349984 WWC1Q8IX03 1113 aa9.29□□□□□ -0.92
CCR6-202ENST00000349984 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
CCR6-202ENST00000349984 AXIN2Q9Y2T1 843 aa9.29□□□□□ -0.92
CCR6-202ENST00000349984 SLIT3O75094 1523 aa9.29□□□□□ -0.92
CCR6-202ENST00000349984 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
CCR6-202ENST00000349984 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
CCR6-202ENST00000349984 A0A0G2JS52 829 aa9.28□□□□□ -0.92
CCR6-202ENST00000349984 GCP02774 474 aa9.28□□□□□ -0.92
CCR6-202ENST00000349984 MAP7D2Q96T17 732 aa9.28□□□□□ -0.92
CCR6-202ENST00000349984 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
CCR6-202ENST00000349984 LTN1O94822 1766 aa9.28□□□□□ -0.92
CCR6-202ENST00000349984 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.92
CCR6-202ENST00000349984 DMTNQ08495 405 aa9.27□□□□□ -0.92
CCR6-202ENST00000349984 USP19O94966 1318 aa9.27□□□□□ -0.93
CCR6-202ENST00000349984 COL18A1P39060 1754 aa9.27□□□□□ -0.93
CCR6-202ENST00000349984 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP9.27□□□□□ -0.93
CCR6-202ENST00000349984 ATAD2Q6PL18 1390 aa9.26□□□□□ -0.93
CCR6-202ENST00000349984 KIF20BQ96Q89 1820 aa9.26□□□□□ -0.93
CCR6-202ENST00000349984 MMP14P50281 582 aa9.26□□□□□ -0.93
CCR6-202ENST00000349984 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
CCR6-202ENST00000349984 NFAT5O94916 1531 aa9.26□□□□□ -0.93
CCR6-202ENST00000349984 RGPD2P0DJD1 1756 aa9.25□□□□□ -0.93
CCR6-202ENST00000349984 SEPT12Q8IYM1 358 aa9.25□□□□□ -0.93
CCR6-202ENST00000349984 CARD14Q9BXL6 1004 aa9.25□□□□□ -0.93
CCR6-202ENST00000349984 PRDM10Q9NQV6 1147 aa9.25□□□□□ -0.93
CCR6-202ENST00000349984 VPS72Q15906 364 aa9.24□□□□□ -0.93
CCR6-202ENST00000349984 GGNBP2Q9H3C7 697 aa9.24□□□□□ -0.93
CCR6-202ENST00000349984 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
CCR6-202ENST00000349984 NLRP13Q86W25 1043 aa9.24□□□□□ -0.93
CCR6-202ENST00000349984 CLGNO14967 610 aa9.24□□□□□ -0.93
CCR6-202ENST00000349984 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
CCR6-202ENST00000349984 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
CCR6-202ENST00000349984 TMF1P82094 1093 aa9.23□□□□□ -0.93
CCR6-202ENST00000349984 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa9.23□□□□□ -0.93
CCR6-202ENST00000349984 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa9.23□□□□□ -0.93
CCR6-202ENST00000349984 KIF20AO95235 890 aa9.23□□□□□ -0.93
CCR6-202ENST00000349984 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
CCR6-202ENST00000349984 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa9.22□□□□□ -0.93
CCR6-202ENST00000349984 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa9.22□□□□□ -0.93
CCR6-202ENST00000349984 EVA1CP58658 441 aa9.22□□□□□ -0.93
CCR6-202ENST00000349984 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
CCR6-202ENST00000349984 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
CCR6-202ENST00000349984 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa9.22□□□□□ -0.93
CCR6-202ENST00000349984 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.93
CCR6-202ENST00000349984 GRIPAP1Q4V328 841 aa9.21□□□□□ -0.93
CCR6-202ENST00000349984 DEFB132Q7Z7B7 95 aa9.21□□□□□ -0.93
CCR6-202ENST00000349984 KIF24Q5T7B8 1368 aa9.21□□□□□ -0.93
CCR6-202ENST00000349984 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa9.21□□□□□ -0.93
CCR6-202ENST00000349984 OVOS2Q6IE36 1432 aa9.21□□□□□ -0.93
CCR6-202ENST00000349984 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
CCR6-202ENST00000349984 PTF1AQ7RTS3 328 aa9.21□□□□□ -0.94
CCR6-202ENST00000349984 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
CCR6-202ENST00000349984 PEAK1Q9H792 1746 aa9.21□□□□□ -0.94
CCR6-202ENST00000349984 INSRP06213 1382 aa9.21□□□□□ -0.94
CCR6-202ENST00000349984 NSD3Q9BZ95 1437 aa9.21□□□□□ -0.94
CCR6-202ENST00000349984 ARHGEF25Q86VW2 580 aa9.21□□□□□ -0.94
CCR6-202ENST00000349984 CPDO75976 1380 aa9.2□□□□□ -0.94
CCR6-202ENST00000349984 FAM193AP78312 1265 aa9.2□□□□□ -0.94
CCR6-202ENST00000349984 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP9.2□□□□□ -0.94
CCR6-202ENST00000349984 TPRNQ4KMQ1 711 aa9.2□□□□□ -0.94
CCR6-202ENST00000349984 TICAM2Q86XR7 235 aa9.2□□□□□ -0.94
CCR6-202ENST00000349984 HDAC5Q9UQL6 1122 aa9.2□□□□□ -0.94
CCR6-202ENST00000349984 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa9.2□□□□□ -0.94
CCR6-202ENST00000349984 FYB1O15117 783 aa9.2□□□□□ -0.94
CCR6-202ENST00000349984 TERF2IPQ9NYB0 399 aa9.2□□□□□ -0.94
CCR6-202ENST00000349984 TAF3Q5VWG9 929 aa9.19□□□□□ -0.94
CCR6-202ENST00000349984 FAM9BQ8IZU0 186 aa9.19□□□□□ -0.94
CCR6-202ENST00000349984 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa9.19□□□□□ -0.94
CCR6-202ENST00000349984 BCL9O00512 1426 aa9.19□□□□□ -0.94
CCR6-202ENST00000349984 NCAPD2Q15021 1401 aa9.19□□□□□ -0.94
CCR6-202ENST00000349984 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
CCR6-202ENST00000349984 USHBP1Q8N6Y0 703 aa9.19□□□□□ -0.94
CCR6-202ENST00000349984 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
CCR6-202ENST00000349984 TTC21AQ8NDW8 1320 aa9.19□□□□□ -0.94
CCR6-202ENST00000349984 LRRC37A3O60309 1634 aa9.19□□□□□ -0.94
CCR6-202ENST00000349984 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa9.18□□□□□ -0.94
CCR6-202ENST00000349984 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
CCR6-202ENST00000349984 PTMAP06454 111 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
CCR6-202ENST00000349984 CCDC184Q52MB2 194 aa9.18□□□□□ -0.94
CCR6-202ENST00000349984 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
CCR6-202ENST00000349984 KRT27Q7Z3Y8 459 aa9.18□□□□□ -0.94
CCR6-202ENST00000349984 MAP3K19Q56UN5 1328 aa9.18□□□□□ -0.94
CCR6-202ENST00000349984 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa9.18□□□□□ -0.94
CCR6-202ENST00000349984 PSEN1P49768 467 aa9.18□□□□□ -0.94
CCR6-202ENST00000349984 AATKQ6ZMQ8 1374 aa9.17□□□□□ -0.94
CCR6-202ENST00000349984 KIF7Q2M1P5 1343 aa9.17□□□□□ -0.94
CCR6-202ENST00000349984 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
CCR6-202ENST00000349984 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
CCR6-202ENST00000349984 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
CCR6-202ENST00000349984 PANK3Q9H999 370 aa9.17□□□□□ -0.94
CCR6-202ENST00000349984 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa9.17□□□□□ -0.94
CCR6-202ENST00000349984 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
CCR6-202ENST00000349984 KAT6BQ8WYB5 2073 aa9.17□□□□□ -0.94
CCR6-202ENST00000349984 USP31Q70CQ4 1352 aa9.17□□□□□ -0.94
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