RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 CRB1P82279 1406 aa22.92■■□□□ 1.26
ACTB-201ENST00000331789 MSH6P52701 1360 aa22.91■■□□□ 1.26
ACTB-201ENST00000331789 IGHDP01880 384 aa22.91■■□□□ 1.26
ACTB-201ENST00000331789 NBPF6Q5VWK0 638 aa22.91■■□□□ 1.26
ACTB-201ENST00000331789 NBPF4Q96M43 638 aa22.91■■□□□ 1.26
ACTB-201ENST00000331789 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
ACTB-201ENST00000331789 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
ACTB-201ENST00000331789 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
ACTB-201ENST00000331789 KIF16BQ96L93 1317 aa22.9■■□□□ 1.26
ACTB-201ENST00000331789 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
ACTB-201ENST00000331789 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
ACTB-201ENST00000331789 AAMPQ13685 434 aa22.88■■□□□ 1.25
ACTB-201ENST00000331789 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
ACTB-201ENST00000331789 KRT24Q2M2I5 525 aa22.87■■□□□ 1.25
ACTB-201ENST00000331789 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
ACTB-201ENST00000331789 MIS18AQ9NYP9 233 aa22.87■■□□□ 1.25
ACTB-201ENST00000331789 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa22.87■■□□□ 1.25
ACTB-201ENST00000331789 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
ACTB-201ENST00000331789 TMEM57Q8N5G2 664 aa22.86■■□□□ 1.25
ACTB-201ENST00000331789 RGPD5Q99666 1765 aa22.86■■□□□ 1.25
ACTB-201ENST00000331789 GNAT3A8MTJ3 354 aa22.85■■□□□ 1.25
ACTB-201ENST00000331789 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
ACTB-201ENST00000331789 ITPRIPQ8IWB1 547 aa22.84■■□□□ 1.25
ACTB-201ENST00000331789 AXIN2Q9Y2T1 843 aa22.84■■□□□ 1.25
ACTB-201ENST00000331789 NPHP3Q7Z494 1330 aa22.84■■□□□ 1.25
ACTB-201ENST00000331789 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
ACTB-201ENST00000331789 ANKRD24Q8TF21 1146 aa22.83■■□□□ 1.25
ACTB-201ENST00000331789 MAP3K5Q99683 1374 aa22.82■■□□□ 1.24
ACTB-201ENST00000331789 DDX19BQ9UMR2 479 aa22.82■■□□□ 1.24
ACTB-201ENST00000331789 KIAA0232Q92628 1395 aa22.82■■□□□ 1.24
ACTB-201ENST00000331789 LRRC37A3O60309 1634 aa22.81■■□□□ 1.24
ACTB-201ENST00000331789 IL17REQ8NFR9 667 aa22.81■■□□□ 1.24
ACTB-201ENST00000331789 TSPYL4Q9UJ04 414 aa22.81■■□□□ 1.24
ACTB-201ENST00000331789 PXDNQ92626 1479 aa22.81■■□□□ 1.24
ACTB-201ENST00000331789 ARHGAP45Q92619 1136 aa22.8■■□□□ 1.24
ACTB-201ENST00000331789 BRINP3Q76B58 766 aa22.8■■□□□ 1.24
ACTB-201ENST00000331789 CABLES1Q8TDN4 633 aa22.8■■□□□ 1.24
ACTB-201ENST00000331789 TNS3Q68CZ2 1445 aa22.79■■□□□ 1.24
ACTB-201ENST00000331789 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa22.77■■□□□ 1.24
ACTB-201ENST00000331789 PDE4AP27815 886 aa22.76■■□□□ 1.23
ACTB-201ENST00000331789 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
ACTB-201ENST00000331789 SLAIN2Q9P270 581 aa22.76■■□□□ 1.23
ACTB-201ENST00000331789 NCAPD2Q15021 1401 aa22.76■■□□□ 1.23
ACTB-201ENST00000331789 RGS3P49796 1198 aa22.75■■□□□ 1.23
ACTB-201ENST00000331789 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa22.75■■□□□ 1.23
ACTB-201ENST00000331789 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa22.75■■□□□ 1.23
ACTB-201ENST00000331789 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
ACTB-201ENST00000331789 COL18A1P39060 1754 aa22.74■■□□□ 1.23
ACTB-201ENST00000331789 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa22.74■■□□□ 1.23
ACTB-201ENST00000331789 ABCC4O15439 1325 aa22.73■■□□□ 1.23
ACTB-201ENST00000331789 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
ACTB-201ENST00000331789 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
ACTB-201ENST00000331789 BACH2Q9BYV9 841 aa22.72■■□□□ 1.23
ACTB-201ENST00000331789 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
ACTB-201ENST00000331789 LGR6Q9HBX8 967 aa22.72■■□□□ 1.23
ACTB-201ENST00000331789 ERBB3P21860 1342 aa22.72■■□□□ 1.23
ACTB-201ENST00000331789 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
ACTB-201ENST00000331789 LMO7Q8WWI1 1683 aa22.72■■□□□ 1.23
ACTB-201ENST00000331789 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa22.7■■□□□ 1.22
ACTB-201ENST00000331789 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
ACTB-201ENST00000331789 CHRNA2Q15822 529 aa22.7■■□□□ 1.22
ACTB-201ENST00000331789 AMOTQ4VCS5 1084 aa22.7■■□□□ 1.22
ACTB-201ENST00000331789 AKAP4Q5JQC9 854 aa22.69■■□□□ 1.22
ACTB-201ENST00000331789 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
ACTB-201ENST00000331789 SLC4A2P04920 1241 aa22.69■■□□□ 1.22
ACTB-201ENST00000331789 BABAM1Q9NWV8 329 aa22.69■■□□□ 1.22
ACTB-201ENST00000331789 NLRP2Q9NX02 1062 aa22.68■■□□□ 1.22
ACTB-201ENST00000331789 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
ACTB-201ENST00000331789 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa22.67■■□□□ 1.22
ACTB-201ENST00000331789 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa22.67■■□□□ 1.22
ACTB-201ENST00000331789 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
ACTB-201ENST00000331789 RGS12O14924 1447 aa22.66■■□□□ 1.22
ACTB-201ENST00000331789 C1orf141Q5JVX7 400 aa22.65■■□□□ 1.22
ACTB-201ENST00000331789 G2E3Q7L622 706 aa22.65■■□□□ 1.22
ACTB-201ENST00000331789 RNMTO43148 476 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
ACTB-201ENST00000331789 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa22.64■■□□□ 1.21
ACTB-201ENST00000331789 PTPRCP08575 1304 aa22.64■■□□□ 1.21
ACTB-201ENST00000331789 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
ACTB-201ENST00000331789 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
ACTB-201ENST00000331789 C1orf115Q9H7X2 142 aa22.63■■□□□ 1.21
ACTB-201ENST00000331789 KDM3BQ7LBC6 1761 aa22.63■■□□□ 1.21
ACTB-201ENST00000331789 CPDO75976 1380 aa22.63■■□□□ 1.21
ACTB-201ENST00000331789 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
ACTB-201ENST00000331789 NECTIN2Q92692 538 aa22.63■■□□□ 1.21
ACTB-201ENST00000331789 TEFQ10587 303 aa22.61■■□□□ 1.21
ACTB-201ENST00000331789 ABCC6O95255 1503 aa22.61■■□□□ 1.21
ACTB-201ENST00000331789 CCDC30Q5VVM6 783 aa22.61■■□□□ 1.21
ACTB-201ENST00000331789 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa22.61■■□□□ 1.21
ACTB-201ENST00000331789 STK31Q9BXU1 1019 aa22.61■■□□□ 1.21
ACTB-201ENST00000331789 KCNQ3O43525 872 aa22.6■■□□□ 1.21
ACTB-201ENST00000331789 FAM161AQ3B820 660 aa22.6■■□□□ 1.21
ACTB-201ENST00000331789 C8orf34Q49A92 452 aa22.59■■□□□ 1.21
ACTB-201ENST00000331789 CACNA1FO60840 1977 aa22.59■■□□□ 1.21
ACTB-201ENST00000331789 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
ACTB-201ENST00000331789 BTBD11A6QL63 1104 aa22.59■■□□□ 1.21
ACTB-201ENST00000331789 MSH5O43196 834 aa22.59■■□□□ 1.21
ACTB-201ENST00000331789 TATP17735 454 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
ACTB-201ENST00000331789 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
ACTB-201ENST00000331789 SMC5Q8IY18 1101 aa22.58■■□□□ 1.21
ACTB-201ENST00000331789 MEGF6O75095 1541 aa22.57■■□□□ 1.2
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