RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000322060.9

PUS1-201, Transcript of pseudouridylate synthase 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene PUS1, Length 1,206 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS1-201ENST00000322060 NBPF6Q5VWK0 638 aa26.03■■□□□ 1.76
PUS1-201ENST00000322060 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
PUS1-201ENST00000322060 NBPF4Q96M43 638 aa26.03■■□□□ 1.76
PUS1-201ENST00000322060 GGNBP2Q9H3C7 697 aa26.03■■□□□ 1.76
PUS1-201ENST00000322060 USP47Q96K76 1375 aa26.03■■□□□ 1.76
PUS1-201ENST00000322060 NSD2O96028 1365 aa26.02■■□□□ 1.76
PUS1-201ENST00000322060 MEGF6O75095 1541 aa26.02■■□□□ 1.76
PUS1-201ENST00000322060 QSER1Q2KHR3 1735 aa26.01■■□□□ 1.75
PUS1-201ENST00000322060 KIF24Q5T7B8 1368 aa26■■□□□ 1.75
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PUS1-201ENST00000322060 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa26■■□□□ 1.75
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PUS1-201ENST00000322060 RGPD2P0DJD1 1756 aa25.98■■□□□ 1.75
PUS1-201ENST00000322060 SHANK3Q9BYB0 1731 aa25.97■■□□□ 1.75
PUS1-201ENST00000322060 POLD1P28340 1107 aa25.97■■□□□ 1.75
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PUS1-201ENST00000322060 LY75O60449 1722 aa25.97■■□□□ 1.75
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PUS1-201ENST00000322060 COL24A1Q17RW2 1714 aa25.96■■□□□ 1.75
PUS1-201ENST00000322060 DOT1LQ8TEK3 1739 aa25.96■■□□□ 1.75
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PUS1-201ENST00000322060 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
PUS1-201ENST00000322060 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
PUS1-201ENST00000322060 FLT4P35916 1363 aa25.95■■□□□ 1.74
PUS1-201ENST00000322060 USHBP1Q8N6Y0 703 aa25.93■■□□□ 1.74
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PUS1-201ENST00000322060 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa25.92■■□□□ 1.74
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PUS1-201ENST00000322060 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa25.91■■□□□ 1.74
PUS1-201ENST00000322060 UTRNP46939 3433 aa25.89■■□□□ 1.74
PUS1-201ENST00000322060 CHD4Q14839 1912 aa25.89■■□□□ 1.74
PUS1-201ENST00000322060 GPR162Q16538 588 aa25.89■■□□□ 1.74
PUS1-201ENST00000322060 KIF20BQ96Q89 1820 aa25.86■■□□□ 1.73
PUS1-201ENST00000322060 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa25.86■■□□□ 1.73
PUS1-201ENST00000322060 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
PUS1-201ENST00000322060 CYP27B1O15528 508 aa25.85■■□□□ 1.73
PUS1-201ENST00000322060 NCAPD2Q15021 1401 aa25.84■■□□□ 1.73
PUS1-201ENST00000322060 FLAD1Q8NFF5 587 aa25.84■■□□□ 1.73
PUS1-201ENST00000322060 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa25.84■■□□□ 1.73
PUS1-201ENST00000322060 NSD3Q9BZ95 1437 aa25.83■■□□□ 1.73
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PUS1-201ENST00000322060 KLHL34Q8N239 644 aa25.82■■□□□ 1.72
PUS1-201ENST00000322060 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
PUS1-201ENST00000322060 WASHC2AQ641Q2 1341 aa25.82■■□□□ 1.72
PUS1-201ENST00000322060 PALLDQ8WX93 1383 aa25.82■■□□□ 1.72
PUS1-201ENST00000322060 MSH5O43196 834 aa25.81■■□□□ 1.72
PUS1-201ENST00000322060 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa25.81■■□□□ 1.72
PUS1-201ENST00000322060 NLGN2Q8NFZ4 835 aa25.8■■□□□ 1.72
PUS1-201ENST00000322060 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP25.8■■□□□ 1.72
PUS1-201ENST00000322060 SPG7Q9UQ90 795 aa25.79■■□□□ 1.72
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PUS1-201ENST00000322060 C5P01031 1676 aa25.76■■□□□ 1.71
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PUS1-201ENST00000322060 ITGB4P16144 1822 aa25.72■■□□□ 1.71
PUS1-201ENST00000322060 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa25.71■■□□□ 1.71
PUS1-201ENST00000322060 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa25.71■■□□□ 1.71
PUS1-201ENST00000322060 AK7Q96M32 723 aa25.71■■□□□ 1.71
PUS1-201ENST00000322060 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP25.7■■□□□ 1.7
PUS1-201ENST00000322060 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa25.69■■□□□ 1.7
PUS1-201ENST00000322060 SIK1P57059 783 aa25.69■■□□□ 1.7
PUS1-201ENST00000322060 IFNL2Q8IZJ0 200 aa25.69■■□□□ 1.7
PUS1-201ENST00000322060 C4BP0C0L5 1744 aa25.68■■□□□ 1.7
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PUS1-201ENST00000322060 PHKG2P15735 406 aa25.67■■□□□ 1.7
PUS1-201ENST00000322060 SSFA2P28290 1259 aa25.67■■□□□ 1.7
PUS1-201ENST00000322060 TMOD3Q9NYL9 352 aa25.67■■□□□ 1.7
PUS1-201ENST00000322060 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
PUS1-201ENST00000322060 AMIGO3Q86WK7 504 aa25.66■■□□□ 1.7
PUS1-201ENST00000322060 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
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PUS1-201ENST00000322060 LINC00116Q8NCU8 138 aa25.63■■□□□ 1.69
PUS1-201ENST00000322060 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
PUS1-201ENST00000322060 UBR3Q6ZT12 1888 aa25.62■■□□□ 1.69
PUS1-201ENST00000322060 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP25.61■■□□□ 1.69
PUS1-201ENST00000322060 ATG3Q9NT62 314 aa25.61■■□□□ 1.69
PUS1-201ENST00000322060 IGSF1Q8N6C5 1336 aa25.61■■□□□ 1.69
PUS1-201ENST00000322060 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa25.6■■□□□ 1.69
PUS1-201ENST00000322060 PHF14O94880 888 aa25.6■■□□□ 1.69
PUS1-201ENST00000322060 ITPK1Q13572 414 aa25.6■■□□□ 1.69
PUS1-201ENST00000322060 ERVV-2B6SEH9 535 aa25.59■■□□□ 1.69
PUS1-201ENST00000322060 ATP6V1AP38606 617 aa25.59■■□□□ 1.69
PUS1-201ENST00000322060 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
PUS1-201ENST00000322060 POLR3GLQ9BT43 218 aa25.59■■□□□ 1.69
PUS1-201ENST00000322060 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
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