RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 THSD4Q6ZMP0 1018 aa13.4□□□□□ -0.26
RABGGTB-201ENST00000319942 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
RABGGTB-201ENST00000319942 NGEFQ8N5V2 710 aa13.4□□□□□ -0.26
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
RABGGTB-201ENST00000319942 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.27
RABGGTB-201ENST00000319942 NEFLP07196 543 aa13.38□□□□□ -0.27
RABGGTB-201ENST00000319942 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa13.37□□□□□ -0.27
RABGGTB-201ENST00000319942 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa13.37□□□□□ -0.27
RABGGTB-201ENST00000319942 NME9Q86XW9 330 aa13.36□□□□□ -0.27
RABGGTB-201ENST00000319942 USP32Q8NFA0 1604 aa13.36□□□□□ -0.27
RABGGTB-201ENST00000319942 HSPA2P54652 639 aa13.36□□□□□ -0.27
RABGGTB-201ENST00000319942 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
RABGGTB-201ENST00000319942 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
RABGGTB-201ENST00000319942 TTC21AQ8NDW8 1320 aa13.35□□□□□ -0.27
RABGGTB-201ENST00000319942 ANKARQ7Z5J8 1434 aa13.35□□□□□ -0.27
RABGGTB-201ENST00000319942 C19orf44Q9H6X5 657 aa13.35□□□□□ -0.27
RABGGTB-201ENST00000319942 BCL2L12Q9HB09 334 aa13.35□□□□□ -0.27
RABGGTB-201ENST00000319942 ADGRB2O60241 1585 aa13.34□□□□□ -0.27
RABGGTB-201ENST00000319942 GOLGA8CPA6NN73 597 aa13.34□□□□□ -0.27
RABGGTB-201ENST00000319942 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
RABGGTB-201ENST00000319942 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
RABGGTB-201ENST00000319942 DSG2Q14126 1118 aa13.34□□□□□ -0.27
RABGGTB-201ENST00000319942 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.27
RABGGTB-201ENST00000319942 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.28
RABGGTB-201ENST00000319942 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.28
RABGGTB-201ENST00000319942 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP13.33□□□□□ -0.281e-7■□□□□ 10.6
RABGGTB-201ENST00000319942 RUNDC1Q96C34 613 aa13.33□□□□□ -0.28
RABGGTB-201ENST00000319942 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
RABGGTB-201ENST00000319942 POLKQ9UBT6 870 aa13.33□□□□□ -0.28
RABGGTB-201ENST00000319942 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.28
RABGGTB-201ENST00000319942 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa13.32□□□□□ -0.28
RABGGTB-201ENST00000319942 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
RABGGTB-201ENST00000319942 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
RABGGTB-201ENST00000319942 AATKQ6ZMQ8 1374 aa13.31□□□□□ -0.28
RABGGTB-201ENST00000319942 APAF1O14727 1248 aa13.31□□□□□ -0.28
RABGGTB-201ENST00000319942 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
RABGGTB-201ENST00000319942 PSME1Q06323 249 aa13.31□□□□□ -0.28
RABGGTB-201ENST00000319942 ESCO1Q5FWF5 840 aa13.31□□□□□ -0.28
RABGGTB-201ENST00000319942 CCDC146Q8IYE0 955 aa13.31□□□□□ -0.28
RABGGTB-201ENST00000319942 WNT2BQ93097 391 aa13.31□□□□□ -0.28
RABGGTB-201ENST00000319942 USP6P35125 1406 aa13.31□□□□□ -0.28
RABGGTB-201ENST00000319942 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa13.31□□□□□ -0.28
RABGGTB-201ENST00000319942 ATF3P18847 181 aa13.3□□□□□ -0.28
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF454Q8N9F8 522 aa13.3□□□□□ -0.28
RABGGTB-201ENST00000319942 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
RABGGTB-201ENST00000319942 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa13.3□□□□□ -0.28
RABGGTB-201ENST00000319942 PNPLA6Q8IY17 1366 aa13.29□□□□□ -0.28
RABGGTB-201ENST00000319942 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa13.29□□□□□ -0.28
RABGGTB-201ENST00000319942 NEFMP07197 916 aa13.29□□□□□ -0.28
RABGGTB-201ENST00000319942 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
RABGGTB-201ENST00000319942 OXER1Q8TDS5 423 aa13.29□□□□□ -0.28
RABGGTB-201ENST00000319942 RGL2O15211 777 aa13.28□□□□□ -0.28
RABGGTB-201ENST00000319942 FCHSD2O94868 740 aa13.28□□□□□ -0.28
RABGGTB-201ENST00000319942 PTPREP23469 700 aa13.28□□□□□ -0.28
RABGGTB-201ENST00000319942 FBLN1P23142 703 aa13.27□□□□□ -0.29
RABGGTB-201ENST00000319942 TCP11L2Q8N4U5 519 aa13.27□□□□□ -0.29
RABGGTB-201ENST00000319942 ABTB2Q8N961 1025 aa13.27□□□□□ -0.29
RABGGTB-201ENST00000319942 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa13.27□□□□□ -0.29
RABGGTB-201ENST00000319942 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
RABGGTB-201ENST00000319942 SSH2Q76I76 1423 aa13.26□□□□□ -0.29
RABGGTB-201ENST00000319942 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
RABGGTB-201ENST00000319942 CADPS2Q86UW7 1296 aa13.26□□□□□ -0.29
RABGGTB-201ENST00000319942 ZBED2Q9BTP6 218 aa13.26□□□□□ -0.29
RABGGTB-201ENST00000319942 NBPF3Q9H094 633 aa13.25□□□□□ -0.29
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM94Q12767 1356 aa13.25□□□□□ -0.29
RABGGTB-201ENST00000319942 USP31Q70CQ4 1352 aa13.25□□□□□ -0.29
RABGGTB-201ENST00000319942 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
RABGGTB-201ENST00000319942 CCDC27Q2M243 656 aa13.24□□□□□ -0.29
RABGGTB-201ENST00000319942 ERICH6BQ5W0A0 696 aa13.24□□□□□ -0.29
RABGGTB-201ENST00000319942 CDCA7LQ96GN5 454 aa13.24□□□□□ -0.29
RABGGTB-201ENST00000319942 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa13.24□□□□□ -0.29
RABGGTB-201ENST00000319942 E9PSI1 815 aa13.23□□□□□ -0.29
RABGGTB-201ENST00000319942 FOXO3O43524 673 aa13.23□□□□□ -0.29
RABGGTB-201ENST00000319942 FOSBP53539 338 aa13.23□□□□□ -0.29
RABGGTB-201ENST00000319942 WDR63Q8IWG1 891 aa13.23□□□□□ -0.29
RABGGTB-201ENST00000319942 ORAI2Q96SN7 254 aa13.23□□□□□ -0.29
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF521Q96K83 1311 aa13.23□□□□□ -0.29
RABGGTB-201ENST00000319942 IL13P35225 146 aa13.23□□□□□ -0.29
RABGGTB-201ENST00000319942 NEUROD2Q15784 382 aa13.23□□□□□ -0.29
RABGGTB-201ENST00000319942 WWC1Q8IX03 1113 aa13.23□□□□□ -0.29
RABGGTB-201ENST00000319942 LMTK3Q96Q04 1460 aa13.22□□□□□ -0.29
RABGGTB-201ENST00000319942 AMPHP49418 695 aa13.22□□□□□ -0.29
RABGGTB-201ENST00000319942 SLFN5Q08AF3 891 aa13.22□□□□□ -0.29
RABGGTB-201ENST00000319942 PLEKHF1Q96S99 279 aa13.22□□□□□ -0.29
RABGGTB-201ENST00000319942 RCAN3Q9UKA8 241 aa13.22□□□□□ -0.29
RABGGTB-201ENST00000319942 MSH6P52701 1360 aa13.21□□□□□ -0.29
RABGGTB-201ENST00000319942 KRT28Q7Z3Y7 464 aa13.21□□□□□ -0.3
RABGGTB-201ENST00000319942 KCNH5Q8NCM2 988 aa13.21□□□□□ -0.3
RABGGTB-201ENST00000319942 NWD1Q149M9 1564 aa13.2□□□□□ -0.3
RABGGTB-201ENST00000319942 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa13.2□□□□□ -0.3
RABGGTB-201ENST00000319942 OVOS2Q6IE36 1432 aa13.2□□□□□ -0.3
RABGGTB-201ENST00000319942 NUTM2GQ5VZR2 741 aa13.2□□□□□ -0.3
RABGGTB-201ENST00000319942 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
RABGGTB-201ENST00000319942 TMPOP42166 694 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
RABGGTB-201ENST00000319942 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
RABGGTB-201ENST00000319942 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP13.19□□□□□ -0.3
RABGGTB-201ENST00000319942 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
RABGGTB-201ENST00000319942 DCCP43146 1447 aa13.19□□□□□ -0.3
RABGGTB-201ENST00000319942 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa13.19□□□□□ -0.3
RABGGTB-201ENST00000319942 MAP3K19Q56UN5 1328 aa13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms