RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
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RABGGTB-201ENST00000319942 C19orf44Q9H6X5 657 aa13.35□□□□□ -0.27
RABGGTB-201ENST00000319942 BCL2L12Q9HB09 334 aa13.35□□□□□ -0.27
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RABGGTB-201ENST00000319942 POLKQ9UBT6 870 aa13.33□□□□□ -0.28
RABGGTB-201ENST00000319942 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.28
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RABGGTB-201ENST00000319942 WDR63Q8IWG1 891 aa13.23□□□□□ -0.29
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RABGGTB-201ENST00000319942 PLEKHF1Q96S99 279 aa13.22□□□□□ -0.29
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RABGGTB-201ENST00000319942 OVOS2Q6IE36 1432 aa13.2□□□□□ -0.3
RABGGTB-201ENST00000319942 NUTM2GQ5VZR2 741 aa13.2□□□□□ -0.3
RABGGTB-201ENST00000319942 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
RABGGTB-201ENST00000319942 TMPOP42166 694 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
RABGGTB-201ENST00000319942 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
RABGGTB-201ENST00000319942 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP13.19□□□□□ -0.3
RABGGTB-201ENST00000319942 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
RABGGTB-201ENST00000319942 DCCP43146 1447 aa13.19□□□□□ -0.3
RABGGTB-201ENST00000319942 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa13.19□□□□□ -0.3
RABGGTB-201ENST00000319942 MAP3K19Q56UN5 1328 aa13.18□□□□□ -0.3
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