RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297107.10

GALNT10-201, Transcript of polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 10, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GALNT10, Length 5,961 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALNT10-201ENST00000297107 ANKRD1Q15327 319 aa22.26■■□□□ 1.15
GALNT10-201ENST00000297107 ERC1Q8IUD2 1116 aa22.26■■□□□ 1.15
GALNT10-201ENST00000297107 JMYQ8N9B5 988 aa22.25■■□□□ 1.15
GALNT10-201ENST00000297107 URI1O94763 535 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
GALNT10-201ENST00000297107 DNA2P51530 1060 aa22.24■■□□□ 1.15
GALNT10-201ENST00000297107 MYO6Q9UM54 1294 aa22.24■■□□□ 1.15
GALNT10-201ENST00000297107 CDK19Q9BWU1 502 aa22.24■■□□□ 1.15
GALNT10-201ENST00000297107 ZMYND15Q9H091 742 aa22.24■■□□□ 1.15
GALNT10-201ENST00000297107 TMCO3Q6UWJ1 677 aa22.24■■□□□ 1.15
GALNT10-201ENST00000297107 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP22.24■■□□□ 1.15
GALNT10-201ENST00000297107 KLHL10Q6JEL2 608 aa22.23■■□□□ 1.15
GALNT10-201ENST00000297107 CBFA2T2O43439 604 aa22.23■■□□□ 1.15
GALNT10-201ENST00000297107 SYCP1Q15431 976 aa22.22■■□□□ 1.15
GALNT10-201ENST00000297107 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.22■■□□□ 1.15
GALNT10-201ENST00000297107 ERBINQ96RT1 1412 aa22.22■■□□□ 1.15
GALNT10-201ENST00000297107 KLHL34Q8N239 644 aa22.22■■□□□ 1.15
GALNT10-201ENST00000297107 PANK2Q9BZ23 570 aa22.22■■□□□ 1.15
GALNT10-201ENST00000297107 CLIP2Q9UDT6 1046 aa22.22■■□□□ 1.15
GALNT10-201ENST00000297107 RBM25P49756 843 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
GALNT10-201ENST00000297107 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.21■■□□□ 1.15
GALNT10-201ENST00000297107 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP22.21■■□□□ 1.15
GALNT10-201ENST00000297107 TRIM22Q8IYM9 498 aa22.21■■□□□ 1.15
GALNT10-201ENST00000297107 TNNT1P13805 278 aa22.21■■□□□ 1.15
GALNT10-201ENST00000297107 KIAA1328Q86T90 577 aa22.21■■□□□ 1.15
GALNT10-201ENST00000297107 CFAP45Q9UL16 551 aa22.21■■□□□ 1.15
GALNT10-201ENST00000297107 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa22.21■■□□□ 1.15
GALNT10-201ENST00000297107 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
GALNT10-201ENST00000297107 TSHZ3Q63HK5 1081 aa22.21■■□□□ 1.15
GALNT10-201ENST00000297107 MCM10Q7L590 875 aa22.21■■□□□ 1.15
GALNT10-201ENST00000297107 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.2■■□□□ 1.15
GALNT10-201ENST00000297107 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
GALNT10-201ENST00000297107 CPLX3Q8WVH0 158 aa22.2■■□□□ 1.14
GALNT10-201ENST00000297107 SSH1Q8WYL5 1049 aa22.2■■□□□ 1.14
GALNT10-201ENST00000297107 TMEM132AQ24JP5 1023 aa22.2■■□□□ 1.14
GALNT10-201ENST00000297107 DACH1Q9UI36 760 aa22.2■■□□□ 1.14
GALNT10-201ENST00000297107 IGHDP01880 384 aa22.19■■□□□ 1.14
GALNT10-201ENST00000297107 ESCO1Q5FWF5 840 aa22.19■■□□□ 1.14
GALNT10-201ENST00000297107 ISM2Q6H9L7 571 aa22.19■■□□□ 1.14
GALNT10-201ENST00000297107 PPP6R1Q9UPN7 881 aa22.19■■□□□ 1.14
GALNT10-201ENST00000297107 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.19■■□□□ 1.14
GALNT10-201ENST00000297107 CCDC183Q5T5S1 534 aa22.19■■□□□ 1.14
GALNT10-201ENST00000297107 ERLIN2O94905 339 aa22.18■■□□□ 1.14
GALNT10-201ENST00000297107 TMPOP42166 694 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
GALNT10-201ENST00000297107 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
GALNT10-201ENST00000297107 RARSP54136 660 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
GALNT10-201ENST00000297107 F6X3S4 739 aa22.18■■□□□ 1.14
GALNT10-201ENST00000297107 BIN1O00499 593 aa22.18■■□□□ 1.14
GALNT10-201ENST00000297107 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP22.18■■□□□ 1.14
GALNT10-201ENST00000297107 ADCY5O95622 1261 aa22.17■■□□□ 1.14
GALNT10-201ENST00000297107 KIF6Q6ZMV9 814 aa22.17■■□□□ 1.14
GALNT10-201ENST00000297107 CCDC82Q8N4S0 544 aa22.17■■□□□ 1.14
GALNT10-201ENST00000297107 EIF5P55010 431 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
GALNT10-201ENST00000297107 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
GALNT10-201ENST00000297107 PDCL3Q9H2J4 239 aa22.17■■□□□ 1.14
GALNT10-201ENST00000297107 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
GALNT10-201ENST00000297107 STRN4Q9NRL3 753 aa22.17■■□□□ 1.14
GALNT10-201ENST00000297107 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
GALNT10-201ENST00000297107 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
GALNT10-201ENST00000297107 CASQ1P31415 396 aa22.16■■□□□ 1.14
GALNT10-201ENST00000297107 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
GALNT10-201ENST00000297107 MX1P20591 662 aa22.16■■□□□ 1.14
GALNT10-201ENST00000297107 STIM1Q13586 685 aa22.16■■□□□ 1.14
GALNT10-201ENST00000297107 BOLA2Q9H3K6 86 aa22.16■■□□□ 1.14
GALNT10-201ENST00000297107 RAI14Q9P0K7 980 aa22.16■■□□□ 1.14
GALNT10-201ENST00000297107 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP22.15■■□□□ 1.14
GALNT10-201ENST00000297107 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.15■■□□□ 1.14
GALNT10-201ENST00000297107 SMARCA4P51532 1647 aa22.15■■□□□ 1.14
GALNT10-201ENST00000297107 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa22.15■■□□□ 1.14
GALNT10-201ENST00000297107 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
GALNT10-201ENST00000297107 CCDC113Q9H0I3 377 aa22.14■■□□□ 1.14
GALNT10-201ENST00000297107 GPATCH11Q8N954 259 aa22.14■■□□□ 1.13
GALNT10-201ENST00000297107 KIF18AQ8NI77 898 aa22.14■■□□□ 1.13
GALNT10-201ENST00000297107 SMTNL1A8MU46 457 aa22.14■■□□□ 1.13
GALNT10-201ENST00000297107 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
GALNT10-201ENST00000297107 SPG7Q9UQ90 795 aa22.13■■□□□ 1.13
GALNT10-201ENST00000297107 TDO2P48775 406 aa22.12■■□□□ 1.13
GALNT10-201ENST00000297107 CRACR2AQ9BSW2 395 aa22.12■■□□□ 1.13
GALNT10-201ENST00000297107 IDH1O75874 414 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
GALNT10-201ENST00000297107 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa22.12■■□□□ 1.13
GALNT10-201ENST00000297107 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.12■■□□□ 1.13
GALNT10-201ENST00000297107 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.12■■□□□ 1.13
GALNT10-201ENST00000297107 CCT2P78371 535 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
GALNT10-201ENST00000297107 TICAM2Q86XR7 235 aa22.12■■□□□ 1.13
GALNT10-201ENST00000297107 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa22.11■■□□□ 1.13
GALNT10-201ENST00000297107 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
GALNT10-201ENST00000297107 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.11■■□□□ 1.13
GALNT10-201ENST00000297107 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.11■■□□□ 1.13
GALNT10-201ENST00000297107 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
GALNT10-201ENST00000297107 NSD3Q9BZ95 1437 aa22.11■■□□□ 1.13
GALNT10-201ENST00000297107 BAG4O95429 457 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
GALNT10-201ENST00000297107 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
GALNT10-201ENST00000297107 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa22.1■■□□□ 1.13
GALNT10-201ENST00000297107 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP22.1■■□□□ 1.13
GALNT10-201ENST00000297107 IGSF3O75054 1194 aa22.1■■□□□ 1.13
GALNT10-201ENST00000297107 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa22.1■■□□□ 1.13
GALNT10-201ENST00000297107 GPRASP1Q5JY77 1395 aa22.1■■□□□ 1.13
GALNT10-201ENST00000297107 BTBD11A6QL63 1104 aa22.1■■□□□ 1.13
GALNT10-201ENST00000297107 CCDC57Q2TAC2 916 aa22.1■■□□□ 1.13
GALNT10-201ENST00000297107 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
GALNT10-201ENST00000297107 TMC6Q7Z403 805 aa22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.2 ms