RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 CHRDL2Q6WN34 429 aa11.26□□□□□ -0.61
PGGT1B-201ENST00000296642 NLGN2Q8NFZ4 835 aa11.26□□□□□ -0.61
PGGT1B-201ENST00000296642 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
PGGT1B-201ENST00000296642 APLP1P51693 650 aa11.25□□□□□ -0.61
PGGT1B-201ENST00000296642 ANKRD24Q8TF21 1146 aa11.25□□□□□ -0.61
PGGT1B-201ENST00000296642 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
PGGT1B-201ENST00000296642 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
PGGT1B-201ENST00000296642 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP11.24□□□□□ -0.61
PGGT1B-201ENST00000296642 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa11.24□□□□□ -0.61
PGGT1B-201ENST00000296642 USP47Q96K76 1375 aa11.24□□□□□ -0.61
PGGT1B-201ENST00000296642 NFAT5O94916 1531 aa11.24□□□□□ -0.61
PGGT1B-201ENST00000296642 COL24A1Q17RW2 1714 aa11.23□□□□□ -0.61
PGGT1B-201ENST00000296642 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
PGGT1B-201ENST00000296642 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
PGGT1B-201ENST00000296642 USP31Q70CQ4 1352 aa11.22□□□□□ -0.61
PGGT1B-201ENST00000296642 NSD3Q9BZ95 1437 aa11.21□□□□□ -0.61
PGGT1B-201ENST00000296642 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP11.21□□□□□ -0.61
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
PGGT1B-201ENST00000296642 CGNL1Q0VF96 1302 aa11.19□□□□□ -0.62
PGGT1B-201ENST00000296642 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
PGGT1B-201ENST00000296642 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
PGGT1B-201ENST00000296642 IP6K1Q92551 441 aa11.19□□□□□ -0.62
PGGT1B-201ENST00000296642 TERF2IPQ9NYB0 399 aa11.19□□□□□ -0.62
PGGT1B-201ENST00000296642 LTN1O94822 1766 aa11.18□□□□□ -0.62
PGGT1B-201ENST00000296642 ADCY9O60503 1353 aa11.18□□□□□ -0.62
PGGT1B-201ENST00000296642 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
PGGT1B-201ENST00000296642 TOMM70O94826 608 aa11.18□□□□□ -0.62
PGGT1B-201ENST00000296642 MSL1Q68DK7 614 aa11.18□□□□□ -0.62
PGGT1B-201ENST00000296642 TMC1Q8TDI8 760 aa11.18□□□□□ -0.62
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC4A2P04920 1241 aa11.17□□□□□ -0.62
PGGT1B-201ENST00000296642 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
PGGT1B-201ENST00000296642 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
PGGT1B-201ENST00000296642 AK7Q96M32 723 aa11.17□□□□□ -0.62
PGGT1B-201ENST00000296642 LY75O60449 1722 aa11.17□□□□□ -0.62
PGGT1B-201ENST00000296642 IGSF1Q8N6C5 1336 aa11.16□□□□□ -0.62
PGGT1B-201ENST00000296642 MON2Q7Z3U7 1717 aa11.16□□□□□ -0.62
PGGT1B-201ENST00000296642 AMPHP49418 695 aa11.16□□□□□ -0.62
PGGT1B-201ENST00000296642 KCNQ4P56696 695 aa11.16□□□□□ -0.62
PGGT1B-201ENST00000296642 NME9Q86XW9 330 aa11.16□□□□□ -0.62
PGGT1B-201ENST00000296642 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
PGGT1B-201ENST00000296642 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa11.16□□□□□ -0.62
PGGT1B-201ENST00000296642 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
PGGT1B-201ENST00000296642 USP54Q70EL1 1684 aa11.16□□□□□ -0.62
PGGT1B-201ENST00000296642 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
PGGT1B-201ENST00000296642 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa11.15□□□□□ -0.62
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PGGT1B-201ENST00000296642 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
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PGGT1B-201ENST00000296642 KIF3CO14782 793 aa11.14□□□□□ -0.63
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC24A1O60721 1099 aa11.14□□□□□ -0.63
PGGT1B-201ENST00000296642 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa11.14□□□□□ -0.63
PGGT1B-201ENST00000296642 TATP17735 454 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
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PGGT1B-201ENST00000296642 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa11.12□□□□□ -0.63
PGGT1B-201ENST00000296642 SSFA2P28290 1259 aa11.12□□□□□ -0.63
PGGT1B-201ENST00000296642 PALLDQ8WX93 1383 aa11.12□□□□□ -0.63
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PGGT1B-201ENST00000296642 CEP350Q5VT06 3117 aa11.11□□□□□ -0.63
PGGT1B-201ENST00000296642 NSD2O96028 1365 aa11.11□□□□□ -0.63
PGGT1B-201ENST00000296642 PHF14O94880 888 aa11.1□□□□□ -0.63
PGGT1B-201ENST00000296642 HOXC9P31274 260 aa11.1□□□□□ -0.63
PGGT1B-201ENST00000296642 TGFB2P61812 414 aa11.1□□□□□ -0.63
PGGT1B-201ENST00000296642 FSTL1Q12841 308 aa11.1□□□□□ -0.63
PGGT1B-201ENST00000296642 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa11.1□□□□□ -0.63
PGGT1B-201ENST00000296642 TNS4Q8IZW8 715 aa11.1□□□□□ -0.63
PGGT1B-201ENST00000296642 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
PGGT1B-201ENST00000296642 RTL1A6NKG5 1358 aa11.1□□□□□ -0.63
PGGT1B-201ENST00000296642 KDM2BQ8NHM5 1336 aa11.09□□□□□ -0.63
PGGT1B-201ENST00000296642 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa11.09□□□□□ -0.63
PGGT1B-201ENST00000296642 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
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PGGT1B-201ENST00000296642 MAP3K19Q56UN5 1328 aa11.09□□□□□ -0.63
PGGT1B-201ENST00000296642 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa11.08□□□□□ -0.64
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa11.08□□□□□ -0.64
PGGT1B-201ENST00000296642 WWC3Q9ULE0 1092 aa11.08□□□□□ -0.64
PGGT1B-201ENST00000296642 BCS1LQ9Y276 419 aa11.08□□□□□ -0.64
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A1W2PP64 1363 aa11.07□□□□□ -0.64
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PGGT1B-201ENST00000296642 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa11.07□□□□□ -0.64
PGGT1B-201ENST00000296642 CARD11Q9BXL7 1154 aa11.07□□□□□ -0.64
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC87Q9NVE4 849 aa11.07□□□□□ -0.64
PGGT1B-201ENST00000296642 MEGF6O75095 1541 aa11.07□□□□□ -0.64
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PGGT1B-201ENST00000296642 NLGN1Q8N2Q7 840 aa11.06□□□□□ -0.64
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PGGT1B-201ENST00000296642 C4BP0C0L5 1744 aa11.06□□□□□ -0.64
PGGT1B-201ENST00000296642 CD163L1Q9NR16 1453 aa11.06□□□□□ -0.64
PGGT1B-201ENST00000296642 FCHSD2O94868 740 aa11.05□□□□□ -0.64
PGGT1B-201ENST00000296642 WDR90Q96KV7 1748 aa11.05□□□□□ -0.64
PGGT1B-201ENST00000296642 SPG7Q9UQ90 795 aa11.05□□□□□ -0.64
PGGT1B-201ENST00000296642 TAF1LQ8IZX4 1826 aa11.05□□□□□ -0.64
PGGT1B-201ENST00000296642 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa11.04□□□□□ -0.64
PGGT1B-201ENST00000296642 GNPATO15228 680 aa11.04□□□□□ -0.64
PGGT1B-201ENST00000296642 MMP10P09238 476 aa11.04□□□□□ -0.64
PGGT1B-201ENST00000296642 SIK1P57059 783 aa11.04□□□□□ -0.64
PGGT1B-201ENST00000296642 NBPF6Q5VWK0 638 aa11.04□□□□□ -0.64
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