RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295718.6

PTPRN-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRN, Length 3,784 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-201ENST00000295718 CKAP2LQ8IYA6 745 aa17.4■□□□□ 0.38
PTPRN-201ENST00000295718 KIF3AQ9Y496 699 aa17.4■□□□□ 0.38
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP17.39■□□□□ 0.38
PTPRN-201ENST00000295718 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa17.39■□□□□ 0.37
PTPRN-201ENST00000295718 DCTPP1Q9H773 170 aa17.39■□□□□ 0.37
PTPRN-201ENST00000295718 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.37
PTPRN-201ENST00000295718 ADGBQ8N7X0 1667 aa17.38■□□□□ 0.37
PTPRN-201ENST00000295718 BECN2A8MW95 431 aa17.38■□□□□ 0.37
PTPRN-201ENST00000295718 H3BQV1 296 aa17.38■□□□□ 0.37
PTPRN-201ENST00000295718 IFFO2Q5TF58 517 aa17.38■□□□□ 0.37
PTPRN-201ENST00000295718 TCEANC2Q96MN5 208 aa17.38■□□□□ 0.37
PTPRN-201ENST00000295718 PODXL2Q9NZ53 605 aa17.38■□□□□ 0.37
PTPRN-201ENST00000295718 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa17.38■□□□□ 0.37
PTPRN-201ENST00000295718 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa17.38■□□□□ 0.37
PTPRN-201ENST00000295718 PDE1AP54750 535 aa17.38■□□□□ 0.37
PTPRN-201ENST00000295718 MCM2P49736 904 aa17.37■□□□□ 0.37
PTPRN-201ENST00000295718 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
PTPRN-201ENST00000295718 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
PTPRN-201ENST00000295718 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
PTPRN-201ENST00000295718 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
PTPRN-201ENST00000295718 CASTP20810 708 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
PTPRN-201ENST00000295718 ANKRD44Q8N8A2 993 aa17.37■□□□□ 0.37
PTPRN-201ENST00000295718 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
PTPRN-201ENST00000295718 ERVK-7P63135 1459 aa17.37■□□□□ 0.37
PTPRN-201ENST00000295718 IL16Q14005 1332 aa17.37■□□□□ 0.37
PTPRN-201ENST00000295718 CEP85Q6P2H3 762 aa17.37■□□□□ 0.37
PTPRN-201ENST00000295718 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
PTPRN-201ENST00000295718 PBRM1Q86U86 1689 aa17.36■□□□□ 0.37
PTPRN-201ENST00000295718 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
PTPRN-201ENST00000295718 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
PTPRN-201ENST00000295718 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
PTPRN-201ENST00000295718 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
PTPRN-201ENST00000295718 DUOX2Q9NRD8 1548 aa17.36■□□□□ 0.37
PTPRN-201ENST00000295718 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
PTPRN-201ENST00000295718 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
PTPRN-201ENST00000295718 PDCL2Q8N4E4 241 aa17.36■□□□□ 0.37
PTPRN-201ENST00000295718 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
PTPRN-201ENST00000295718 UGGT1Q9NYU2 1555 aa17.36■□□□□ 0.37
PTPRN-201ENST00000295718 SRGAP3O43295 1099 aa17.36■□□□□ 0.37
PTPRN-201ENST00000295718 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
PTPRN-201ENST00000295718 FOXO3O43524 673 aa17.35■□□□□ 0.37
PTPRN-201ENST00000295718 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP17.35■□□□□ 0.37
PTPRN-201ENST00000295718 G2E3Q7L622 706 aa17.35■□□□□ 0.37
PTPRN-201ENST00000295718 FMNL2Q96PY5 1086 aa17.35■□□□□ 0.37
PTPRN-201ENST00000295718 PPP1R9BQ96SB3 815 aa17.35■□□□□ 0.37
PTPRN-201ENST00000295718 KIF2CQ99661 725 aa17.35■□□□□ 0.37
PTPRN-201ENST00000295718 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP17.35■□□□□ 0.37
PTPRN-201ENST00000295718 GNAI3P08754 354 aa17.35■□□□□ 0.37
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF445P59923 1031 aa17.35■□□□□ 0.37
PTPRN-201ENST00000295718 KDM4AO75164 1064 aa17.34■□□□□ 0.37
PTPRN-201ENST00000295718 PLEKHF1Q96S99 279 aa17.34■□□□□ 0.37
PTPRN-201ENST00000295718 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa17.34■□□□□ 0.37
PTPRN-201ENST00000295718 DYNC1I1O14576 645 aa17.34■□□□□ 0.37
PTPRN-201ENST00000295718 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
PTPRN-201ENST00000295718 ANXA1P04083 346 aa17.34■□□□□ 0.37
PTPRN-201ENST00000295718 FAM184AQ8NB25 1140 aa17.34■□□□□ 0.37
PTPRN-201ENST00000295718 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
PTPRN-201ENST00000295718 NECAB1Q8N987 351 aa17.34■□□□□ 0.37
PTPRN-201ENST00000295718 SIL1Q9H173 461 aa17.34■□□□□ 0.37
PTPRN-201ENST00000295718 PALD1Q9ULE6 856 aa17.34■□□□□ 0.37
PTPRN-201ENST00000295718 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa17.33■□□□□ 0.37
PTPRN-201ENST00000295718 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.36
PTPRN-201ENST00000295718 ABCC2Q92887 1545 aa17.33■□□□□ 0.36
PTPRN-201ENST00000295718 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa17.33■□□□□ 0.36
PTPRN-201ENST00000295718 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa17.33■□□□□ 0.36
PTPRN-201ENST00000295718 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa17.32■□□□□ 0.36
PTPRN-201ENST00000295718 FAM173BQ6P4H8 233 aa17.32■□□□□ 0.36
PTPRN-201ENST00000295718 ARHGAP45Q92619 1136 aa17.32■□□□□ 0.36
PTPRN-201ENST00000295718 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa17.32■□□□□ 0.36
PTPRN-201ENST00000295718 PLCH2O75038 1416 aa17.32■□□□□ 0.36
PTPRN-201ENST00000295718 CCDC183Q5T5S1 534 aa17.32■□□□□ 0.36
PTPRN-201ENST00000295718 CNTROBQ8N137 903 aa17.32■□□□□ 0.36
PTPRN-201ENST00000295718 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP17.32■□□□□ 0.36
PTPRN-201ENST00000295718 GPATCH3Q96I76 525 aa17.32■□□□□ 0.36
PTPRN-201ENST00000295718 CCT4P50991 539 aaKnown RBP17.31■□□□□ 0.36
PTPRN-201ENST00000295718 GORABQ5T7V8 394 aa17.31■□□□□ 0.36
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP17.31■□□□□ 0.36
PTPRN-201ENST00000295718 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa17.31■□□□□ 0.36
PTPRN-201ENST00000295718 CCDC192P0DO97 292 aa17.31■□□□□ 0.36
PTPRN-201ENST00000295718 DDX11Q96FC9 970 aa17.31■□□□□ 0.36
PTPRN-201ENST00000295718 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP17.3■□□□□ 0.36
PTPRN-201ENST00000295718 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP17.3■□□□□ 0.36
PTPRN-201ENST00000295718 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP17.3■□□□□ 0.36
PTPRN-201ENST00000295718 TNMDQ9H2S6 317 aa17.3■□□□□ 0.36
PTPRN-201ENST00000295718 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP17.3■□□□□ 0.36
PTPRN-201ENST00000295718 V9GYY5 206 aaPredicted RBP17.3■□□□□ 0.36
PTPRN-201ENST00000295718 RUFY2Q8WXA3 655 aa17.3■□□□□ 0.36
PTPRN-201ENST00000295718 CCDC30Q5VVM6 783 aa17.29■□□□□ 0.36
PTPRN-201ENST00000295718 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP17.29■□□□□ 0.36
PTPRN-201ENST00000295718 STX6O43752 255 aa17.29■□□□□ 0.36
PTPRN-201ENST00000295718 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP17.29■□□□□ 0.36
PTPRN-201ENST00000295718 PDRG1Q9NUG6 133 aa17.29■□□□□ 0.36
PTPRN-201ENST00000295718 ADGRL1O94910 1474 aa17.29■□□□□ 0.36
PTPRN-201ENST00000295718 A0A0G2JS52 829 aa17.29■□□□□ 0.36
PTPRN-201ENST00000295718 NLRP6P59044 892 aa17.29■□□□□ 0.36
PTPRN-201ENST00000295718 TEFQ10587 303 aa17.29■□□□□ 0.36
PTPRN-201ENST00000295718 ZBTB9Q96C00 473 aa17.29■□□□□ 0.36
PTPRN-201ENST00000295718 ERICH4A6NGS2 130 aa17.28■□□□□ 0.36
PTPRN-201ENST00000295718 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa17.28■□□□□ 0.36
PTPRN-201ENST00000295718 USHBP1Q8N6Y0 703 aa17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms