RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000288616.7

CABP1-201, Transcript of calcium binding protein 1, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene CABP1, Length 1,369 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP1-201ENST00000288616 DOT1LQ8TEK3 1739 aa24.79■■□□□ 1.56
CABP1-201ENST00000288616 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa24.79■■□□□ 1.56
CABP1-201ENST00000288616 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa24.79■■□□□ 1.56
CABP1-201ENST00000288616 NBPF6Q5VWK0 638 aa24.79■■□□□ 1.56
CABP1-201ENST00000288616 NBPF4Q96M43 638 aa24.79■■□□□ 1.56
CABP1-201ENST00000288616 MEGF6O75095 1541 aa24.78■■□□□ 1.56
CABP1-201ENST00000288616 POLD1P28340 1107 aa24.78■■□□□ 1.56
CABP1-201ENST00000288616 GPR162Q16538 588 aa24.78■■□□□ 1.56
CABP1-201ENST00000288616 SLC16A10Q8TF71 515 aa24.78■■□□□ 1.56
CABP1-201ENST00000288616 CHD4Q14839 1912 aa24.78■■□□□ 1.56
CABP1-201ENST00000288616 FYB1O15117 783 aa24.77■■□□□ 1.56
CABP1-201ENST00000288616 SLC24A1O60721 1099 aa24.77■■□□□ 1.56
CABP1-201ENST00000288616 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
CABP1-201ENST00000288616 SHANK3Q9BYB0 1731 aa24.75■■□□□ 1.55
CABP1-201ENST00000288616 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
CABP1-201ENST00000288616 NSD2O96028 1365 aa24.75■■□□□ 1.55
CABP1-201ENST00000288616 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa24.74■■□□□ 1.55
CABP1-201ENST00000288616 MSH5O43196 834 aa24.74■■□□□ 1.55
CABP1-201ENST00000288616 TMF1P82094 1093 aa24.74■■□□□ 1.55
CABP1-201ENST00000288616 MAP3K5Q99683 1374 aa24.74■■□□□ 1.55
CABP1-201ENST00000288616 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa24.73■■□□□ 1.55
CABP1-201ENST00000288616 QSER1Q2KHR3 1735 aa24.73■■□□□ 1.55
CABP1-201ENST00000288616 RTL1A6NKG5 1358 aa24.72■■□□□ 1.55
CABP1-201ENST00000288616 LY75O60449 1722 aa24.71■■□□□ 1.55
CABP1-201ENST00000288616 USP47Q96K76 1375 aa24.7■■□□□ 1.55
CABP1-201ENST00000288616 TATP17735 454 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.55
CABP1-201ENST00000288616 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa24.7■■□□□ 1.55
CABP1-201ENST00000288616 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
CABP1-201ENST00000288616 NLGN2Q8NFZ4 835 aa24.68■■□□□ 1.54
CABP1-201ENST00000288616 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
CABP1-201ENST00000288616 CGNL1Q0VF96 1302 aa24.66■■□□□ 1.54
CABP1-201ENST00000288616 MSL1Q68DK7 614 aa24.66■■□□□ 1.54
CABP1-201ENST00000288616 COL24A1Q17RW2 1714 aa24.65■■□□□ 1.54
CABP1-201ENST00000288616 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa24.64■■□□□ 1.53
CABP1-201ENST00000288616 INSRP06213 1382 aa24.63■■□□□ 1.53
CABP1-201ENST00000288616 KIF20BQ96Q89 1820 aa24.63■■□□□ 1.53
CABP1-201ENST00000288616 CDCA8Q53HL2 280 aa24.62■■□□□ 1.53
CABP1-201ENST00000288616 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa24.62■■□□□ 1.53
CABP1-201ENST00000288616 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa24.62■■□□□ 1.53
CABP1-201ENST00000288616 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa24.62■■□□□ 1.53
CABP1-201ENST00000288616 FLT4P35916 1363 aa24.62■■□□□ 1.53
CABP1-201ENST00000288616 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
CABP1-201ENST00000288616 CARD14Q9BXL6 1004 aa24.61■■□□□ 1.53
CABP1-201ENST00000288616 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa24.6■■□□□ 1.53
CABP1-201ENST00000288616 C1QTNF8P60827 252 aa24.6■■□□□ 1.53
CABP1-201ENST00000288616 CYP27B1O15528 508 aa24.59■■□□□ 1.53
CABP1-201ENST00000288616 PALLDQ8WX93 1383 aa24.58■■□□□ 1.53
CABP1-201ENST00000288616 C5P01031 1676 aa24.57■■□□□ 1.52
CABP1-201ENST00000288616 NSD3Q9BZ95 1437 aa24.57■■□□□ 1.52
CABP1-201ENST00000288616 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP24.56■■□□□ 1.52
CABP1-201ENST00000288616 KIF24Q5T7B8 1368 aa24.55■■□□□ 1.52
CABP1-201ENST00000288616 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
CABP1-201ENST00000288616 ITGB4P16144 1822 aa24.54■■□□□ 1.52
CABP1-201ENST00000288616 SMIM5Q71RC9 77 aa24.54■■□□□ 1.52
CABP1-201ENST00000288616 TAF1LQ8IZX4 1826 aa24.53■■□□□ 1.52
CABP1-201ENST00000288616 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
CABP1-201ENST00000288616 FLAD1Q8NFF5 587 aa24.53■■□□□ 1.52
CABP1-201ENST00000288616 GRIN3BO60391 1043 aa24.52■■□□□ 1.52
CABP1-201ENST00000288616 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
CABP1-201ENST00000288616 PIGBQ92521 554 aa24.52■■□□□ 1.52
CABP1-201ENST00000288616 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
CABP1-201ENST00000288616 AK7Q96M32 723 aa24.52■■□□□ 1.52
CABP1-201ENST00000288616 POLR3GLQ9BT43 218 aa24.52■■□□□ 1.52
CABP1-201ENST00000288616 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa24.52■■□□□ 1.52
CABP1-201ENST00000288616 PHF14O94880 888 aa24.51■■□□□ 1.51
CABP1-201ENST00000288616 AMIGO3Q86WK7 504 aa24.51■■□□□ 1.51
CABP1-201ENST00000288616 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
CABP1-201ENST00000288616 SPG7Q9UQ90 795 aa24.5■■□□□ 1.51
CABP1-201ENST00000288616 EYA1Q99502 592 aa24.49■■□□□ 1.51
CABP1-201ENST00000288616 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
CABP1-201ENST00000288616 C4BP0C0L5 1744 aa24.48■■□□□ 1.51
CABP1-201ENST00000288616 PKD1L3Q7Z443 1732 aa24.47■■□□□ 1.51
CABP1-201ENST00000288616 CD2APQ9Y5K6 639 aa24.47■■□□□ 1.51
CABP1-201ENST00000288616 WASHC2AQ641Q2 1341 aa24.47■■□□□ 1.51
CABP1-201ENST00000288616 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
CABP1-201ENST00000288616 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
CABP1-201ENST00000288616 WWC3Q9ULE0 1092 aa24.46■■□□□ 1.51
CABP1-201ENST00000288616 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
CABP1-201ENST00000288616 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa24.44■■□□□ 1.5
CABP1-201ENST00000288616 SIK1P57059 783 aa24.44■■□□□ 1.5
CABP1-201ENST00000288616 TMOD3Q9NYL9 352 aa24.44■■□□□ 1.5
CABP1-201ENST00000288616 POLKQ9UBT6 870 aa24.44■■□□□ 1.5
CABP1-201ENST00000288616 LINC00116Q8NCU8 138 aa24.43■■□□□ 1.5
CABP1-201ENST00000288616 ASAP1Q9ULH1 1129 aa24.43■■□□□ 1.5
CABP1-201ENST00000288616 NCAPD2Q15021 1401 aa24.43■■□□□ 1.5
CABP1-201ENST00000288616 UBR3Q6ZT12 1888 aa24.42■■□□□ 1.5
CABP1-201ENST00000288616 PHKG2P15735 406 aa24.41■■□□□ 1.5
CABP1-201ENST00000288616 IFNL2Q8IZJ0 200 aa24.41■■□□□ 1.5
CABP1-201ENST00000288616 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa24.4■■□□□ 1.5
CABP1-201ENST00000288616 ATP6V1AP38606 617 aa24.4■■□□□ 1.5
CABP1-201ENST00000288616 ITPK1Q13572 414 aa24.4■■□□□ 1.5
CABP1-201ENST00000288616 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP24.4■■□□□ 1.5
CABP1-201ENST00000288616 GNPATO15228 680 aa24.39■■□□□ 1.49
CABP1-201ENST00000288616 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
CABP1-201ENST00000288616 ATP10DQ9P241 1426 aa24.38■■□□□ 1.49
CABP1-201ENST00000288616 SSFA2P28290 1259 aa24.38■■□□□ 1.49
CABP1-201ENST00000288616 IGSF1Q8N6C5 1336 aa24.38■■□□□ 1.49
CABP1-201ENST00000288616 PCGF6Q9BYE7 350 aa24.37■■□□□ 1.49
CABP1-201ENST00000288616 ATG3Q9NT62 314 aa24.37■■□□□ 1.49
CABP1-201ENST00000288616 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.4 ms