RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261507.10

MSMO1-201, Transcript of methylsterol monooxygenase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MSMO1, Length 2,269 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMO1-201ENST00000261507 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa18.28■□□□□ 0.52
MSMO1-201ENST00000261507 NEUROD2Q15784 382 aa18.28■□□□□ 0.52
MSMO1-201ENST00000261507 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
MSMO1-201ENST00000261507 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
MSMO1-201ENST00000261507 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
MSMO1-201ENST00000261507 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
MSMO1-201ENST00000261507 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
MSMO1-201ENST00000261507 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
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MSMO1-201ENST00000261507 TCP11L2Q8N4U5 519 aa18.26■□□□□ 0.51
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MSMO1-201ENST00000261507 RGPD2P0DJD1 1756 aa18.25■□□□□ 0.51
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MSMO1-201ENST00000261507 WWC1Q8IX03 1113 aa18.21■□□□□ 0.51
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MSMO1-201ENST00000261507 IL2RBP14784 551 aa18.2■□□□□ 0.5
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MSMO1-201ENST00000261507 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP18.2■□□□□ 0.56e-12■□□□□ 11
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MSMO1-201ENST00000261507 SULT6B1Q6IMI4 303 aa18.19■□□□□ 0.5
MSMO1-201ENST00000261507 E9PSI1 815 aa18.19■□□□□ 0.5
MSMO1-201ENST00000261507 USP35Q9P2H5 1018 aa18.19■□□□□ 0.5
MSMO1-201ENST00000261507 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
MSMO1-201ENST00000261507 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
MSMO1-201ENST00000261507 ERICH6Q7L0X2 663 aa18.18■□□□□ 0.5
MSMO1-201ENST00000261507 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP18.18■□□□□ 0.56e-11■□□□□ 9.6
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MSMO1-201ENST00000261507 DISP2A7MBM2 1401 aa18.17■□□□□ 0.5
MSMO1-201ENST00000261507 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
MSMO1-201ENST00000261507 AMOTQ4VCS5 1084 aa18.16■□□□□ 0.5
MSMO1-201ENST00000261507 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa18.16■□□□□ 0.5
MSMO1-201ENST00000261507 PDE4AP27815 886 aa18.16■□□□□ 0.5
MSMO1-201ENST00000261507 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
MSMO1-201ENST00000261507 USHBP1Q8N6Y0 703 aa18.15■□□□□ 0.5
MSMO1-201ENST00000261507 SPG7Q9UQ90 795 aa18.15■□□□□ 0.5
MSMO1-201ENST00000261507 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa18.15■□□□□ 0.5
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MSMO1-201ENST00000261507 PKD1L3Q7Z443 1732 aa18.14■□□□□ 0.49
MSMO1-201ENST00000261507 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
MSMO1-201ENST00000261507 DDB1Q16531 1140 aa18.12■□□□□ 0.49
MSMO1-201ENST00000261507 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa18.12■□□□□ 0.49
MSMO1-201ENST00000261507 A0A0G2JS52 829 aa18.12■□□□□ 0.49
MSMO1-201ENST00000261507 AEBP1Q8IUX7 1158 aa18.12■□□□□ 0.49
MSMO1-201ENST00000261507 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
MSMO1-201ENST00000261507 MEGF6O75095 1541 aa18.11■□□□□ 0.49
MSMO1-201ENST00000261507 PRKAR2BP31323 418 aa18.11■□□□□ 0.49
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MSMO1-201ENST00000261507 TNS2Q63HR2 1409 aa18.11■□□□□ 0.49
MSMO1-201ENST00000261507 SEPT12Q8IYM1 358 aa18.11■□□□□ 0.49
MSMO1-201ENST00000261507 GAS2L2Q8NHY3 880 aa18.11■□□□□ 0.49
MSMO1-201ENST00000261507 LRRC37A3O60309 1634 aa18.1■□□□□ 0.49
MSMO1-201ENST00000261507 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa18.1■□□□□ 0.49
MSMO1-201ENST00000261507 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa18.1■□□□□ 0.49
MSMO1-201ENST00000261507 PANK1Q8TE04 598 aa18.1■□□□□ 0.49
MSMO1-201ENST00000261507 TNNQ9UQP3 1299 aa18.1■□□□□ 0.49
MSMO1-201ENST00000261507 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
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MSMO1-201ENST00000261507 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
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MSMO1-201ENST00000261507 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
MSMO1-201ENST00000261507 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
MSMO1-201ENST00000261507 BCL2L13Q9BXK5 485 aa18.08■□□□□ 0.48
MSMO1-201ENST00000261507 MS4A1P11836 297 aa18.07■□□□□ 0.48
MSMO1-201ENST00000261507 C1orf141Q5JVX7 400 aa18.07■□□□□ 0.48
MSMO1-201ENST00000261507 PLEKHF1Q96S99 279 aa18.07■□□□□ 0.48
MSMO1-201ENST00000261507 IFNL2Q8IZJ0 200 aa18.06■□□□□ 0.48
MSMO1-201ENST00000261507 COG6Q9Y2V7 657 aa18.06■□□□□ 0.48
MSMO1-201ENST00000261507 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
MSMO1-201ENST00000261507 RGS12O14924 1447 aa18.06■□□□□ 0.48
MSMO1-201ENST00000261507 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
MSMO1-201ENST00000261507 BRWD3Q6RI45 1802 aa18.05■□□□□ 0.48
MSMO1-201ENST00000261507 SHANK3Q9BYB0 1731 aa18.05■□□□□ 0.48
MSMO1-201ENST00000261507 IGHDP01880 384 aa18.05■□□□□ 0.48
MSMO1-201ENST00000261507 RARSP54136 660 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
MSMO1-201ENST00000261507 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
MSMO1-201ENST00000261507 KRT27Q7Z3Y8 459 aa18.05■□□□□ 0.48
MSMO1-201ENST00000261507 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
MSMO1-201ENST00000261507 CANXP27824 592 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
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