RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258398.8

TTLL4-201, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene TTLL4, Length 4,730 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL4-201ENST00000258398 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
TTLL4-201ENST00000258398 DNAJC5BQ9UF47 199 aa10.74□□□□□ -0.69
TTLL4-201ENST00000258398 PLXNC1O60486 1568 aa10.74□□□□□ -0.69
TTLL4-201ENST00000258398 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
TTLL4-201ENST00000258398 CHMP3Q9Y3E7 222 aa10.74□□□□□ -0.69
TTLL4-201ENST00000258398 ADCY10Q96PN6 1610 aa10.74□□□□□ -0.69
TTLL4-201ENST00000258398 TTC37Q6PGP7 1564 aa10.73□□□□□ -0.69
TTLL4-201ENST00000258398 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
TTLL4-201ENST00000258398 KRT32Q14532 448 aa10.73□□□□□ -0.69
TTLL4-201ENST00000258398 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
TTLL4-201ENST00000258398 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
TTLL4-201ENST00000258398 PDRG1Q9NUG6 133 aa10.73□□□□□ -0.69
TTLL4-201ENST00000258398 UBE2HP62256 183 aa10.73□□□□□ -0.69
TTLL4-201ENST00000258398 SULT6B1Q6IMI4 303 aa10.73□□□□□ -0.69
TTLL4-201ENST00000258398 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
TTLL4-201ENST00000258398 ANKRD44Q8N8A2 993 aa10.73□□□□□ -0.69
TTLL4-201ENST00000258398 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
TTLL4-201ENST00000258398 CFAP45Q9UL16 551 aa10.73□□□□□ -0.69
TTLL4-201ENST00000258398 FANCAO15360 1455 aa10.73□□□□□ -0.69
TTLL4-201ENST00000258398 LMOD2Q6P5Q4 547 aa10.72□□□□□ -0.69
TTLL4-201ENST00000258398 KIF24Q5T7B8 1368 aa10.72□□□□□ -0.69
TTLL4-201ENST00000258398 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
TTLL4-201ENST00000258398 CARD14Q9BXL6 1004 aa10.72□□□□□ -0.69
TTLL4-201ENST00000258398 SPC24Q8NBT2 197 aa10.72□□□□□ -0.69
TTLL4-201ENST00000258398 MAGI2Q86UL8 1455 aa10.72□□□□□ -0.69
TTLL4-201ENST00000258398 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa10.72□□□□□ -0.69
TTLL4-201ENST00000258398 LAMC1P11047 1609 aa10.72□□□□□ -0.69
TTLL4-201ENST00000258398 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP10.72□□□□□ -0.69
TTLL4-201ENST00000258398 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
TTLL4-201ENST00000258398 CCDC70Q6NSX1 233 aa10.72□□□□□ -0.69
TTLL4-201ENST00000258398 FSD1Q9BTV5 496 aa10.72□□□□□ -0.69
TTLL4-201ENST00000258398 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa10.72□□□□□ -0.69
TTLL4-201ENST00000258398 TRIM29Q14134 588 aa10.71□□□□□ -0.69
TTLL4-201ENST00000258398 KIF1BPQ96EK5 621 aa10.71□□□□□ -0.69
TTLL4-201ENST00000258398 PPP1R9BQ96SB3 815 aa10.71□□□□□ -0.69
TTLL4-201ENST00000258398 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa10.71□□□□□ -0.69
TTLL4-201ENST00000258398 CPLX1O14810 134 aa10.71□□□□□ -0.69
TTLL4-201ENST00000258398 DCTPP1Q9H773 170 aa10.71□□□□□ -0.69
TTLL4-201ENST00000258398 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
TTLL4-201ENST00000258398 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa10.71□□□□□ -0.7
TTLL4-201ENST00000258398 SPATA32Q96LK8 384 aa10.71□□□□□ -0.7
TTLL4-201ENST00000258398 ANTXR1Q9H6X2 564 aa10.71□□□□□ -0.7
TTLL4-201ENST00000258398 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
TTLL4-201ENST00000258398 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
TTLL4-201ENST00000258398 SDF4Q9BRK5 362 aa10.7□□□□□ -0.7
TTLL4-201ENST00000258398 WDR7Q9Y4E6 1490 aa10.7□□□□□ -0.7
TTLL4-201ENST00000258398 CROCC2H7BZ55 1655 aa10.7□□□□□ -0.7
TTLL4-201ENST00000258398 CEP57L1Q8IYX8 460 aa10.7□□□□□ -0.7
TTLL4-201ENST00000258398 TMX3Q96JJ7 454 aa10.7□□□□□ -0.7
TTLL4-201ENST00000258398 ATP10AO60312 1499 aa10.7□□□□□ -0.7
TTLL4-201ENST00000258398 CTAGE5O15320 804 aa10.7□□□□□ -0.7
TTLL4-201ENST00000258398 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa10.7□□□□□ -0.7
TTLL4-201ENST00000258398 OLFM4Q6UX06 510 aa10.7□□□□□ -0.7
TTLL4-201ENST00000258398 MBIPQ9NS73 344 aa10.7□□□□□ -0.7
TTLL4-201ENST00000258398 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa10.7□□□□□ -0.7
TTLL4-201ENST00000258398 TSPYL1Q9H0U9 437 aa10.7□□□□□ -0.7
TTLL4-201ENST00000258398 USP25Q9UHP3 1055 aa10.7□□□□□ -0.7
TTLL4-201ENST00000258398 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
TTLL4-201ENST00000258398 ADCY5O95622 1261 aa10.69□□□□□ -0.7
TTLL4-201ENST00000258398 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
TTLL4-201ENST00000258398 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
TTLL4-201ENST00000258398 SDSP20132 328 aa10.69□□□□□ -0.7
TTLL4-201ENST00000258398 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa10.69□□□□□ -0.7
TTLL4-201ENST00000258398 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
TTLL4-201ENST00000258398 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
TTLL4-201ENST00000258398 CBFA2T2O43439 604 aa10.69□□□□□ -0.7
TTLL4-201ENST00000258398 TAF7LQ5H9L4 462 aa10.69□□□□□ -0.7
TTLL4-201ENST00000258398 PTPRTO14522 1441 aa10.69□□□□□ -0.7
TTLL4-201ENST00000258398 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
TTLL4-201ENST00000258398 SETQ01105 290 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
TTLL4-201ENST00000258398 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
TTLL4-201ENST00000258398 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
TTLL4-201ENST00000258398 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa10.69□□□□□ -0.7
TTLL4-201ENST00000258398 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa10.69□□□□□ -0.7
TTLL4-201ENST00000258398 TNNQ9UQP3 1299 aa10.68□□□□□ -0.7
TTLL4-201ENST00000258398 STX6O43752 255 aa10.68□□□□□ -0.7
TTLL4-201ENST00000258398 NECTIN2Q92692 538 aa10.68□□□□□ -0.7
TTLL4-201ENST00000258398 TAOK2Q9UL54 1235 aa10.68□□□□□ -0.7
TTLL4-201ENST00000258398 CCDC61Q9Y6R9 512 aa10.68□□□□□ -0.7
TTLL4-201ENST00000258398 TRPM2O94759 1503 aa10.68□□□□□ -0.7
TTLL4-201ENST00000258398 MYOM2P54296 1465 aa10.68□□□□□ -0.7
TTLL4-201ENST00000258398 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
TTLL4-201ENST00000258398 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
TTLL4-201ENST00000258398 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP10.68□□□□□ -0.7
TTLL4-201ENST00000258398 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
TTLL4-201ENST00000258398 ABCA8O94911 1581 aa10.68□□□□□ -0.7
TTLL4-201ENST00000258398 TRDNQ13061 729 aa10.67□□□□□ -0.7
TTLL4-201ENST00000258398 JMYQ8N9B5 988 aa10.67□□□□□ -0.7
TTLL4-201ENST00000258398 USP26Q9BXU7 913 aa10.67□□□□□ -0.7
TTLL4-201ENST00000258398 HSP90B2PQ58FF3 399 aa10.67□□□□□ -0.7
TTLL4-201ENST00000258398 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa10.67□□□□□ -0.7
TTLL4-201ENST00000258398 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
TTLL4-201ENST00000258398 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
TTLL4-201ENST00000258398 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
TTLL4-201ENST00000258398 CASTP20810 708 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
TTLL4-201ENST00000258398 AK7Q96M32 723 aa10.67□□□□□ -0.7
TTLL4-201ENST00000258398 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa10.67□□□□□ -0.7
TTLL4-201ENST00000258398 KLHL34Q8N239 644 aa10.67□□□□□ -0.7
TTLL4-201ENST00000258398 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa10.67□□□□□ -0.7
TTLL4-201ENST00000258398 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.9 ms