RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000250495.9

NEDD8-201, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEDD8, Length 708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-201ENST00000250495 INSRP06213 1382 aa29.22■■■□□ 2.27
NEDD8-201ENST00000250495 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
NEDD8-201ENST00000250495 SLC27A3Q5K4L6 730 aa29.21■■■□□ 2.27
NEDD8-201ENST00000250495 MTFR1LQ9H019 292 aa29.21■■■□□ 2.27
NEDD8-201ENST00000250495 PTGER2P43116 358 aa29.2■■■□□ 2.26
NEDD8-201ENST00000250495 LRRC4BQ9NT99 713 aa29.2■■■□□ 2.26
NEDD8-201ENST00000250495 FLT4P35916 1363 aa29.2■■■□□ 2.26
NEDD8-201ENST00000250495 NSD3Q9BZ95 1437 aa29.2■■■□□ 2.26
NEDD8-201ENST00000250495 TATP17735 454 aaPredicted RBP29.19■■■□□ 2.26
NEDD8-201ENST00000250495 USHBP1Q8N6Y0 703 aa29.19■■■□□ 2.26
NEDD8-201ENST00000250495 MEGF6O75095 1541 aa29.19■■■□□ 2.26
NEDD8-201ENST00000250495 MYOM1P52179 1685 aa29.16■■■□□ 2.26
NEDD8-201ENST00000250495 PAPPAQ13219 1627 aa29.14■■■□□ 2.26
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF827Q17R98 1081 aa29.14■■■□□ 2.26
NEDD8-201ENST00000250495 AKT1S1Q96B36 256 aa29.13■■■□□ 2.25
NEDD8-201ENST00000250495 POLR3GLQ9BT43 218 aa29.13■■■□□ 2.25
NEDD8-201ENST00000250495 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa29.13■■■□□ 2.25
NEDD8-201ENST00000250495 SHANK3Q9BYB0 1731 aa29.12■■■□□ 2.25
NEDD8-201ENST00000250495 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP29.11■■■□□ 2.25
NEDD8-201ENST00000250495 DOT1LQ8TEK3 1739 aa29.11■■■□□ 2.25
NEDD8-201ENST00000250495 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP29.1■■■□□ 2.25
NEDD8-201ENST00000250495 SGIP1Q9BQI5 828 aa29.1■■■□□ 2.25
NEDD8-201ENST00000250495 SLC16A10Q8TF71 515 aa29.09■■■□□ 2.25
NEDD8-201ENST00000250495 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa29.09■■■□□ 2.25
NEDD8-201ENST00000250495 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa29.09■■■□□ 2.25
NEDD8-201ENST00000250495 NSD2O96028 1365 aa29.09■■■□□ 2.25
NEDD8-201ENST00000250495 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
NEDD8-201ENST00000250495 YY1P25490 414 aa29.07■■■□□ 2.24
NEDD8-201ENST00000250495 WASHC2AQ641Q2 1341 aa29.07■■■□□ 2.24
NEDD8-201ENST00000250495 SYT17Q9BSW7 474 aa29.07■■■□□ 2.24
NEDD8-201ENST00000250495 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
NEDD8-201ENST00000250495 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa29.07■■■□□ 2.24
NEDD8-201ENST00000250495 KCNQ4P56696 695 aa29.06■■■□□ 2.24
NEDD8-201ENST00000250495 ARXQ96QS3 562 aa29.06■■■□□ 2.24
NEDD8-201ENST00000250495 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
NEDD8-201ENST00000250495 LY75O60449 1722 aa29.04■■■□□ 2.24
NEDD8-201ENST00000250495 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
NEDD8-201ENST00000250495 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
NEDD8-201ENST00000250495 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
NEDD8-201ENST00000250495 POLKQ9UBT6 870 aa29.02■■■□□ 2.24
NEDD8-201ENST00000250495 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa29.01■■■□□ 2.23
NEDD8-201ENST00000250495 QSER1Q2KHR3 1735 aa29.01■■■□□ 2.23
NEDD8-201ENST00000250495 CYP27B1O15528 508 aa29.01■■■□□ 2.23
NEDD8-201ENST00000250495 SPG7Q9UQ90 795 aa29■■■□□ 2.23
NEDD8-201ENST00000250495 POLD1P28340 1107 aa28.99■■■□□ 2.23
NEDD8-201ENST00000250495 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa28.99■■■□□ 2.23
NEDD8-201ENST00000250495 EYA1Q99502 592 aa28.99■■■□□ 2.23
NEDD8-201ENST00000250495 NCAPD2Q15021 1401 aa28.98■■■□□ 2.23
NEDD8-201ENST00000250495 PANK3Q9H999 370 aa28.98■■■□□ 2.23
NEDD8-201ENST00000250495 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa28.97■■■□□ 2.23
NEDD8-201ENST00000250495 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
NEDD8-201ENST00000250495 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP28.96■■■□□ 2.236e-8■■□□□ 11.8
NEDD8-201ENST00000250495 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.22
NEDD8-201ENST00000250495 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.22
NEDD8-201ENST00000250495 MAP3K5Q99683 1374 aa28.95■■■□□ 2.22
NEDD8-201ENST00000250495 PKD1L3Q7Z443 1732 aa28.92■■■□□ 2.22
NEDD8-201ENST00000250495 PALLDQ8WX93 1383 aa28.92■■■□□ 2.22
NEDD8-201ENST00000250495 MSH5O43196 834 aa28.92■■■□□ 2.22
NEDD8-201ENST00000250495 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
NEDD8-201ENST00000250495 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa28.9■■■□□ 2.22
NEDD8-201ENST00000250495 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
NEDD8-201ENST00000250495 IFNL2Q8IZJ0 200 aa28.89■■■□□ 2.22
NEDD8-201ENST00000250495 PIGBQ92521 554 aa28.89■■■□□ 2.22
NEDD8-201ENST00000250495 ITGB4P16144 1822 aa28.88■■■□□ 2.21
NEDD8-201ENST00000250495 FLAD1Q8NFF5 587 aa28.88■■■□□ 2.21
NEDD8-201ENST00000250495 COL24A1Q17RW2 1714 aa28.87■■■□□ 2.21
NEDD8-201ENST00000250495 KLHL34Q8N239 644 aa28.87■■■□□ 2.21
NEDD8-201ENST00000250495 PHKG2P15735 406 aa28.85■■■□□ 2.21
NEDD8-201ENST00000250495 MORC1Q86VD1 984 aa28.85■■■□□ 2.21
NEDD8-201ENST00000250495 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa28.85■■■□□ 2.21
NEDD8-201ENST00000250495 C5P01031 1676 aa28.84■■■□□ 2.21
NEDD8-201ENST00000250495 TMOD3Q9NYL9 352 aa28.84■■■□□ 2.21
NEDD8-201ENST00000250495 KNSTRNQ9Y448 316 aa28.84■■■□□ 2.21
NEDD8-201ENST00000250495 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa28.84■■■□□ 2.21
NEDD8-201ENST00000250495 GPR162Q16538 588 aa28.82■■■□□ 2.2
NEDD8-201ENST00000250495 TAF1LQ8IZX4 1826 aa28.81■■■□□ 2.2
NEDD8-201ENST00000250495 IGSF1Q8N6C5 1336 aa28.81■■■□□ 2.2
NEDD8-201ENST00000250495 AK7Q96M32 723 aa28.8■■■□□ 2.2
NEDD8-201ENST00000250495 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa28.79■■■□□ 2.2
NEDD8-201ENST00000250495 SIK1P57059 783 aa28.79■■■□□ 2.2
NEDD8-201ENST00000250495 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP28.78■■■□□ 2.2
NEDD8-201ENST00000250495 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
NEDD8-201ENST00000250495 MSL1Q68DK7 614 aa28.77■■■□□ 2.2
NEDD8-201ENST00000250495 CHD4Q14839 1912 aa28.77■■■□□ 2.2
NEDD8-201ENST00000250495 ASAP1Q9ULH1 1129 aa28.76■■■□□ 2.19
NEDD8-201ENST00000250495 C4BP0C0L5 1744 aa28.75■■■□□ 2.19
NEDD8-201ENST00000250495 AMOTQ4VCS5 1084 aa28.75■■■□□ 2.19
NEDD8-201ENST00000250495 ERVV-2B6SEH9 535 aa28.74■■■□□ 2.19
NEDD8-201ENST00000250495 ATP6V1AP38606 617 aa28.73■■■□□ 2.19
NEDD8-201ENST00000250495 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
NEDD8-201ENST00000250495 NLGN2Q8NFZ4 835 aa28.73■■■□□ 2.19
NEDD8-201ENST00000250495 DCAF5Q96JK2 942 aa28.73■■■□□ 2.19
NEDD8-201ENST00000250495 ATG3Q9NT62 314 aa28.73■■■□□ 2.19
NEDD8-201ENST00000250495 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
NEDD8-201ENST00000250495 SSFA2P28290 1259 aa28.71■■■□□ 2.19
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP28.71■■■□□ 2.19
NEDD8-201ENST00000250495 LINC00116Q8NCU8 138 aa28.71■■■□□ 2.19
NEDD8-201ENST00000250495 PHF14O94880 888 aa28.7■■■□□ 2.18
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.18
NEDD8-201ENST00000250495 KIF7Q2M1P5 1343 aa28.69■■■□□ 2.18
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