RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243082.4

HOXC11-201, Transcript of homeobox C11, humanhuman

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Gene HOXC11, Length 2,039 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11-201ENST00000243082 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
HOXC11-201ENST00000243082 GCP02774 474 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXC11-201ENST00000243082 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
HOXC11-201ENST00000243082 SLIT3O75094 1523 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXC11-201ENST00000243082 KIF1AQ12756 1690 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXC11-201ENST00000243082 HSPA2P54652 639 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXC11-201ENST00000243082 FAM161AQ3B820 660 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXC11-201ENST00000243082 C8orf34Q49A92 452 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXC11-201ENST00000243082 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
HOXC11-201ENST00000243082 ABCC4O15439 1325 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXC11-201ENST00000243082 USHBP1Q8N6Y0 703 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXC11-201ENST00000243082 MIS18AQ9NYP9 233 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXC11-201ENST00000243082 MST1RQ04912 1400 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXC11-201ENST00000243082 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXC11-201ENST00000243082 GNAT3A8MTJ3 354 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXC11-201ENST00000243082 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
HOXC11-201ENST00000243082 NBPF6Q5VWK0 638 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXC11-201ENST00000243082 ARHGEF25Q86VW2 580 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXC11-201ENST00000243082 NBPF4Q96M43 638 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXC11-201ENST00000243082 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXC11-201ENST00000243082 USP19O94966 1318 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXC11-201ENST00000243082 ATF3P18847 181 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXC11-201ENST00000243082 MSH6P52701 1360 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXC11-201ENST00000243082 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
HOXC11-201ENST00000243082 DCCP43146 1447 aa23.46■■□□□ 1.35
HOXC11-201ENST00000243082 LRRC37A3O60309 1634 aa23.46■■□□□ 1.35
HOXC11-201ENST00000243082 ZBTB7CA1YPR0 619 aa23.46■■□□□ 1.35
HOXC11-201ENST00000243082 LMOD2Q6P5Q4 547 aa23.46■■□□□ 1.35
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HOXC11-201ENST00000243082 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
HOXC11-201ENST00000243082 TSPYL4Q9UJ04 414 aa23.46■■□□□ 1.35
HOXC11-201ENST00000243082 MAP3K5Q99683 1374 aa23.45■■□□□ 1.34
HOXC11-201ENST00000243082 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
HOXC11-201ENST00000243082 IL17REQ8NFR9 667 aa23.44■■□□□ 1.34
HOXC11-201ENST00000243082 PLEKHG5O94827 1062 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXC11-201ENST00000243082 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
HOXC11-201ENST00000243082 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
HOXC11-201ENST00000243082 SMC5Q8IY18 1101 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXC11-201ENST00000243082 ALS2Q96Q42 1657 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXC11-201ENST00000243082 RGPD2P0DJD1 1756 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXC11-201ENST00000243082 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXC11-201ENST00000243082 ANP32EQ9BTT0 268 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXC11-201ENST00000243082 RGS12O14924 1447 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXC11-201ENST00000243082 CADPS2Q86UW7 1296 aa23.39■■□□□ 1.34
HOXC11-201ENST00000243082 NCAPD2Q15021 1401 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXC11-201ENST00000243082 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
HOXC11-201ENST00000243082 AXIN2Q9Y2T1 843 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXC11-201ENST00000243082 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
HOXC11-201ENST00000243082 ANKRD24Q8TF21 1146 aa23.37■■□□□ 1.33
HOXC11-201ENST00000243082 BABAM1Q9NWV8 329 aa23.37■■□□□ 1.33
HOXC11-201ENST00000243082 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
HOXC11-201ENST00000243082 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
HOXC11-201ENST00000243082 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
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HOXC11-201ENST00000243082 SLC4A2P04920 1241 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXC11-201ENST00000243082 C1orf115Q9H7X2 142 aa23.35■■□□□ 1.33
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HOXC11-201ENST00000243082 SIRT2Q8IXJ6 389 aa23.32■■□□□ 1.32
HOXC11-201ENST00000243082 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
HOXC11-201ENST00000243082 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa23.32■■□□□ 1.32
HOXC11-201ENST00000243082 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
HOXC11-201ENST00000243082 LGR6Q9HBX8 967 aa23.32■■□□□ 1.32
HOXC11-201ENST00000243082 G2E3Q7L622 706 aa23.31■■□□□ 1.32
HOXC11-201ENST00000243082 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
HOXC11-201ENST00000243082 NUCB1Q02818 461 aa23.3■■□□□ 1.32
HOXC11-201ENST00000243082 AMOTQ4VCS5 1084 aa23.3■■□□□ 1.32
HOXC11-201ENST00000243082 AKAP4Q5JQC9 854 aa23.3■■□□□ 1.32
HOXC11-201ENST00000243082 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
HOXC11-201ENST00000243082 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
HOXC11-201ENST00000243082 ERBB3P21860 1342 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXC11-201ENST00000243082 LMO7Q8WWI1 1683 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXC11-201ENST00000243082 RGPD5Q99666 1765 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXC11-201ENST00000243082 PXDNQ92626 1479 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXC11-201ENST00000243082 TNS3Q68CZ2 1445 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXC11-201ENST00000243082 CCDC30Q5VVM6 783 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXC11-201ENST00000243082 GCC1Q96CN9 775 aa23.27■■□□□ 1.32
HOXC11-201ENST00000243082 STK31Q9BXU1 1019 aa23.27■■□□□ 1.32
HOXC11-201ENST00000243082 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXC11-201ENST00000243082 SEC24BO95487 1268 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXC11-201ENST00000243082 CHD1LQ86WJ1 897 aa23.25■■□□□ 1.31
HOXC11-201ENST00000243082 CABLES1Q8TDN4 633 aa23.25■■□□□ 1.31
HOXC11-201ENST00000243082 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
HOXC11-201ENST00000243082 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXC11-201ENST00000243082 BRINP3Q76B58 766 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXC11-201ENST00000243082 COL18A1P39060 1754 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXC11-201ENST00000243082 F6X3S4 739 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXC11-201ENST00000243082 RNMTO43148 476 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
HOXC11-201ENST00000243082 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
HOXC11-201ENST00000243082 NECTIN2Q92692 538 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXC11-201ENST00000243082 DDRGK1Q96HY6 314 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXC11-201ENST00000243082 LNPKQ9C0E8 428 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXC11-201ENST00000243082 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
HOXC11-201ENST00000243082 FLIIQ13045 1269 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXC11-201ENST00000243082 C1orf141Q5JVX7 400 aa23.22■■□□□ 1.31
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