RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229379.2

COX6A1-201, Transcript of cytochrome c oxidase subunit 6A1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene COX6A1, Length 572 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6A1-201ENST00000229379 PAPPAQ13219 1627 aa22.13■■□□□ 1.13
COX6A1-201ENST00000229379 KCNQ4P56696 695 aa22.11■■□□□ 1.13
COX6A1-201ENST00000229379 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.1■■□□□ 1.13
COX6A1-201ENST00000229379 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa22.1■■□□□ 1.13
COX6A1-201ENST00000229379 INSRP06213 1382 aa22.1■■□□□ 1.13
COX6A1-201ENST00000229379 LY75O60449 1722 aa22.09■■□□□ 1.13
COX6A1-201ENST00000229379 ITGB4P16144 1822 aa22.09■■□□□ 1.13
COX6A1-201ENST00000229379 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
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COX6A1-201ENST00000229379 FLT4P35916 1363 aa22.09■■□□□ 1.13
COX6A1-201ENST00000229379 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
COX6A1-201ENST00000229379 NSD2O96028 1365 aa22.08■■□□□ 1.12
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COX6A1-201ENST00000229379 PKD1L3Q7Z443 1732 aa22.06■■□□□ 1.12
COX6A1-201ENST00000229379 ZNF827Q17R98 1081 aa22.05■■□□□ 1.12
COX6A1-201ENST00000229379 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
COX6A1-201ENST00000229379 SLC15A2Q16348 729 aa22.04■■□□□ 1.12
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COX6A1-201ENST00000229379 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
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COX6A1-201ENST00000229379 STK32BQ9NY57 414 aa22.02■■□□□ 1.12
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COX6A1-201ENST00000229379 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa22■■□□□ 1.11
COX6A1-201ENST00000229379 TAF1LQ8IZX4 1826 aa22■■□□□ 1.11
COX6A1-201ENST00000229379 NCAPD2Q15021 1401 aa21.99■■□□□ 1.11
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COX6A1-201ENST00000229379 EYA1Q99502 592 aa21.99■■□□□ 1.11
COX6A1-201ENST00000229379 QSER1Q2KHR3 1735 aa21.99■■□□□ 1.11
COX6A1-201ENST00000229379 KIF24Q5T7B8 1368 aa21.99■■□□□ 1.11
COX6A1-201ENST00000229379 PTGER2P43116 358 aa21.98■■□□□ 1.11
COX6A1-201ENST00000229379 WASHC2AQ641Q2 1341 aa21.98■■□□□ 1.11
COX6A1-201ENST00000229379 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
COX6A1-201ENST00000229379 AKT1S1Q96B36 256 aa21.95■■□□□ 1.1
COX6A1-201ENST00000229379 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
COX6A1-201ENST00000229379 KIF7Q2M1P5 1343 aa21.94■■□□□ 1.1
COX6A1-201ENST00000229379 C5P01031 1676 aa21.94■■□□□ 1.1
COX6A1-201ENST00000229379 UTRNP46939 3433 aa21.93■■□□□ 1.1
COX6A1-201ENST00000229379 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa21.92■■□□□ 1.1
COX6A1-201ENST00000229379 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa21.92■■□□□ 1.1
COX6A1-201ENST00000229379 COL24A1Q17RW2 1714 aa21.92■■□□□ 1.1
COX6A1-201ENST00000229379 SGIP1Q9BQI5 828 aa21.91■■□□□ 1.1
COX6A1-201ENST00000229379 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
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COX6A1-201ENST00000229379 SLC27A3Q5K4L6 730 aa21.88■■□□□ 1.09
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COX6A1-201ENST00000229379 MTFR1LQ9H019 292 aa21.87■■□□□ 1.09
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COX6A1-201ENST00000229379 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
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COX6A1-201ENST00000229379 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
COX6A1-201ENST00000229379 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa21.83■■□□□ 1.09
COX6A1-201ENST00000229379 PHKG2P15735 406 aa21.82■■□□□ 1.08
COX6A1-201ENST00000229379 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
COX6A1-201ENST00000229379 SPG7Q9UQ90 795 aa21.82■■□□□ 1.08
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COX6A1-201ENST00000229379 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
COX6A1-201ENST00000229379 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
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COX6A1-201ENST00000229379 ASAP1Q9ULH1 1129 aa21.8■■□□□ 1.08
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COX6A1-201ENST00000229379 IL13P35225 146 aa21.77■■□□□ 1.08
COX6A1-201ENST00000229379 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
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COX6A1-201ENST00000229379 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP21.76■■□□□ 1.07
COX6A1-201ENST00000229379 MSH5O43196 834 aa21.75■■□□□ 1.07
COX6A1-201ENST00000229379 ITPK1Q13572 414 aa21.75■■□□□ 1.07
COX6A1-201ENST00000229379 LINC00116Q8NCU8 138 aa21.75■■□□□ 1.07
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COX6A1-201ENST00000229379 SULT6B1Q6IMI4 303 aa21.74■■□□□ 1.07
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COX6A1-201ENST00000229379 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
COX6A1-201ENST00000229379 SLC4A9Q96Q91 983 aa21.73■■□□□ 1.07
COX6A1-201ENST00000229379 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
COX6A1-201ENST00000229379 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa21.71■■□□□ 1.07
COX6A1-201ENST00000229379 SIK1P57059 783 aa21.71■■□□□ 1.07
COX6A1-201ENST00000229379 NLGN2Q8NFZ4 835 aa21.71■■□□□ 1.07
COX6A1-201ENST00000229379 PHF14O94880 888 aa21.7■■□□□ 1.06
COX6A1-201ENST00000229379 HMOX1P09601 288 aa21.7■■□□□ 1.06
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