RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000219302.7

NME3-201, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NME3, Length 1,069 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3-201ENST00000219302 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa22.13■■□□□ 1.13
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NME3-201ENST00000219302 MEGF6O75095 1541 aa22.12■■□□□ 1.13
NME3-201ENST00000219302 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
NME3-201ENST00000219302 GGNBP2Q9H3C7 697 aa22.12■■□□□ 1.13
NME3-201ENST00000219302 RTL1A6NKG5 1358 aa22.12■■□□□ 1.13
NME3-201ENST00000219302 TMF1P82094 1093 aa22.11■■□□□ 1.13
NME3-201ENST00000219302 RGPD2P0DJD1 1756 aa22.1■■□□□ 1.13
NME3-201ENST00000219302 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa22.09■■□□□ 1.13
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NME3-201ENST00000219302 QSER1Q2KHR3 1735 aa22.08■■□□□ 1.12
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NME3-201ENST00000219302 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa22.07■■□□□ 1.12
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NME3-201ENST00000219302 COL24A1Q17RW2 1714 aa22.06■■□□□ 1.12
NME3-201ENST00000219302 USP47Q96K76 1375 aa22.06■■□□□ 1.12
NME3-201ENST00000219302 LY75O60449 1722 aa22.06■■□□□ 1.12
NME3-201ENST00000219302 DOT1LQ8TEK3 1739 aa22.06■■□□□ 1.12
NME3-201ENST00000219302 POLD1P28340 1107 aa22.05■■□□□ 1.12
NME3-201ENST00000219302 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa22.05■■□□□ 1.12
NME3-201ENST00000219302 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
NME3-201ENST00000219302 INSRP06213 1382 aa22.04■■□□□ 1.12
NME3-201ENST00000219302 CARD14Q9BXL6 1004 aa22.04■■□□□ 1.12
NME3-201ENST00000219302 TATP17735 454 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
NME3-201ENST00000219302 CHD4Q14839 1912 aa22.03■■□□□ 1.12
NME3-201ENST00000219302 GPR162Q16538 588 aa22.02■■□□□ 1.12
NME3-201ENST00000219302 CDCA8Q53HL2 280 aa22.02■■□□□ 1.12
NME3-201ENST00000219302 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
NME3-201ENST00000219302 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa22.01■■□□□ 1.11
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NME3-201ENST00000219302 FLT4P35916 1363 aa21.99■■□□□ 1.11
NME3-201ENST00000219302 CYP27B1O15528 508 aa21.99■■□□□ 1.11
NME3-201ENST00000219302 KLHL34Q8N239 644 aa21.99■■□□□ 1.11
NME3-201ENST00000219302 NLGN2Q8NFZ4 835 aa21.99■■□□□ 1.11
NME3-201ENST00000219302 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa21.98■■□□□ 1.11
NME3-201ENST00000219302 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa21.98■■□□□ 1.11
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NME3-201ENST00000219302 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
NME3-201ENST00000219302 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa21.96■■□□□ 1.11
NME3-201ENST00000219302 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa21.95■■□□□ 1.1
NME3-201ENST00000219302 MSH5O43196 834 aa21.94■■□□□ 1.1
NME3-201ENST00000219302 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
NME3-201ENST00000219302 PALLDQ8WX93 1383 aa21.93■■□□□ 1.1
NME3-201ENST00000219302 KIF20BQ96Q89 1820 aa21.92■■□□□ 1.1
NME3-201ENST00000219302 NCAPD2Q15021 1401 aa21.92■■□□□ 1.1
NME3-201ENST00000219302 NSD3Q9BZ95 1437 aa21.92■■□□□ 1.1
NME3-201ENST00000219302 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
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NME3-201ENST00000219302 FLAD1Q8NFF5 587 aa21.91■■□□□ 1.1
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NME3-201ENST00000219302 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP21.87■■□□□ 1.09
NME3-201ENST00000219302 POLKQ9UBT6 870 aa21.87■■□□□ 1.09
NME3-201ENST00000219302 SPG7Q9UQ90 795 aa21.87■■□□□ 1.09
NME3-201ENST00000219302 CD2APQ9Y5K6 639 aa21.87■■□□□ 1.09
NME3-201ENST00000219302 TAF1LQ8IZX4 1826 aa21.87■■□□□ 1.09
NME3-201ENST00000219302 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa21.86■■□□□ 1.09
NME3-201ENST00000219302 PKD1L3Q7Z443 1732 aa21.86■■□□□ 1.09
NME3-201ENST00000219302 ITGB4P16144 1822 aa21.85■■□□□ 1.09
NME3-201ENST00000219302 SMIM5Q71RC9 77 aa21.84■■□□□ 1.09
NME3-201ENST00000219302 AK7Q96M32 723 aa21.83■■□□□ 1.09
NME3-201ENST00000219302 C4BP0C0L5 1744 aa21.83■■□□□ 1.08
NME3-201ENST00000219302 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa21.82■■□□□ 1.08
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NME3-201ENST00000219302 ATG3Q9NT62 314 aa21.78■■□□□ 1.08
NME3-201ENST00000219302 CLSPNQ9HAW4 1339 aa21.76■■□□□ 1.07
NME3-201ENST00000219302 ATP6V1AP38606 617 aa21.75■■□□□ 1.07
NME3-201ENST00000219302 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
NME3-201ENST00000219302 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa21.74■■□□□ 1.07
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NME3-201ENST00000219302 IGSF1Q8N6C5 1336 aa21.73■■□□□ 1.07
NME3-201ENST00000219302 GNPATO15228 680 aa21.72■■□□□ 1.07
NME3-201ENST00000219302 SLC4A9Q96Q91 983 aa21.72■■□□□ 1.07
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