RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000211413.9

PRRT1-201, Transcript of proline rich transmembrane protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRT1, Length 1,909 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT1-201ENST00000211413 TRIM35Q9UPQ4 493 aa24.47■■□□□ 1.51
PRRT1-201ENST00000211413 NFE2L2Q16236 605 aa24.46■■□□□ 1.51
PRRT1-201ENST00000211413 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa24.46■■□□□ 1.51
PRRT1-201ENST00000211413 CDCA7LQ96GN5 454 aa24.46■■□□□ 1.51
PRRT1-201ENST00000211413 ZBED9Q6R2W3 1325 aa24.45■■□□□ 1.5
PRRT1-201ENST00000211413 NWD2Q9ULI1 1742 aa24.45■■□□□ 1.5
PRRT1-201ENST00000211413 WWC1Q8IX03 1113 aa24.43■■□□□ 1.5
PRRT1-201ENST00000211413 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
PRRT1-201ENST00000211413 TATP17735 454 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
PRRT1-201ENST00000211413 MCM10Q7L590 875 aa24.42■■□□□ 1.5
PRRT1-201ENST00000211413 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa24.42■■□□□ 1.5
PRRT1-201ENST00000211413 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa24.4■■□□□ 1.5
PRRT1-201ENST00000211413 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa24.4■■□□□ 1.5
PRRT1-201ENST00000211413 IL2RBP14784 551 aa24.4■■□□□ 1.5
PRRT1-201ENST00000211413 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
PRRT1-201ENST00000211413 ZNF521Q96K83 1311 aa24.39■■□□□ 1.5
PRRT1-201ENST00000211413 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
PRRT1-201ENST00000211413 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
PRRT1-201ENST00000211413 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
PRRT1-201ENST00000211413 VPS72Q15906 364 aa24.37■■□□□ 1.49
PRRT1-201ENST00000211413 LGR6Q9HBX8 967 aa24.37■■□□□ 1.49
PRRT1-201ENST00000211413 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa24.36■■□□□ 1.49
PRRT1-201ENST00000211413 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
PRRT1-201ENST00000211413 GAS2L2Q8NHY3 880 aa24.36■■□□□ 1.49
PRRT1-201ENST00000211413 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
PRRT1-201ENST00000211413 CYP27B1O15528 508 aa24.35■■□□□ 1.49
PRRT1-201ENST00000211413 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa24.35■■□□□ 1.49
PRRT1-201ENST00000211413 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
PRRT1-201ENST00000211413 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
PRRT1-201ENST00000211413 AMOTQ4VCS5 1084 aa24.33■■□□□ 1.49
PRRT1-201ENST00000211413 IL17REQ8NFR9 667 aa24.33■■□□□ 1.49
PRRT1-201ENST00000211413 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
PRRT1-201ENST00000211413 GNAT3A8MTJ3 354 aa24.33■■□□□ 1.49
PRRT1-201ENST00000211413 DISP2A7MBM2 1401 aa24.32■■□□□ 1.48
PRRT1-201ENST00000211413 CCDC27Q2M243 656 aa24.32■■□□□ 1.48
PRRT1-201ENST00000211413 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
PRRT1-201ENST00000211413 SPG7Q9UQ90 795 aa24.32■■□□□ 1.48
PRRT1-201ENST00000211413 GOLGA2Q08379 1002 aa24.31■■□□□ 1.48
PRRT1-201ENST00000211413 MAP3K5Q99683 1374 aa24.31■■□□□ 1.48
PRRT1-201ENST00000211413 C1orf141Q5JVX7 400 aa24.31■■□□□ 1.48
PRRT1-201ENST00000211413 MIS18AQ9NYP9 233 aa24.31■■□□□ 1.48
PRRT1-201ENST00000211413 SHANK3Q9BYB0 1731 aa24.31■■□□□ 1.48
PRRT1-201ENST00000211413 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
PRRT1-201ENST00000211413 PKD1L3Q7Z443 1732 aa24.3■■□□□ 1.48
PRRT1-201ENST00000211413 A0A0G2JS52 829 aa24.3■■□□□ 1.48
PRRT1-201ENST00000211413 PHKG2P15735 406 aa24.3■■□□□ 1.48
PRRT1-201ENST00000211413 AKAP4Q5JQC9 854 aa24.3■■□□□ 1.48
PRRT1-201ENST00000211413 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
PRRT1-201ENST00000211413 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
PRRT1-201ENST00000211413 WNK3Q9BYP7 1800 aa24.3■■□□□ 1.48
PRRT1-201ENST00000211413 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
PRRT1-201ENST00000211413 GLI3P10071 1580 aa24.29■■□□□ 1.48
PRRT1-201ENST00000211413 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
PRRT1-201ENST00000211413 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
PRRT1-201ENST00000211413 ATRNO75882 1429 aa24.28■■□□□ 1.48
PRRT1-201ENST00000211413 SLFN5Q08AF3 891 aa24.27■■□□□ 1.48
PRRT1-201ENST00000211413 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
PRRT1-201ENST00000211413 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
PRRT1-201ENST00000211413 EXOC5O00471 708 aa24.27■■□□□ 1.48
PRRT1-201ENST00000211413 ERICH6BQ5W0A0 696 aa24.27■■□□□ 1.48
PRRT1-201ENST00000211413 IFNL2Q8IZJ0 200 aa24.27■■□□□ 1.48
PRRT1-201ENST00000211413 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP24.27■■□□□ 1.48
PRRT1-201ENST00000211413 BARGINQ6ZT62 677 aa24.26■■□□□ 1.47
PRRT1-201ENST00000211413 WDR63Q8IWG1 891 aa24.26■■□□□ 1.47
PRRT1-201ENST00000211413 RNMTO43148 476 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
PRRT1-201ENST00000211413 KAT6BQ8WYB5 2073 aa24.25■■□□□ 1.47
PRRT1-201ENST00000211413 LMOD3Q0VAK6 560 aa24.25■■□□□ 1.47
PRRT1-201ENST00000211413 DDB1Q16531 1140 aa24.25■■□□□ 1.47
PRRT1-201ENST00000211413 FAM182BQ5T319 152 aa24.25■■□□□ 1.47
PRRT1-201ENST00000211413 NGEFQ8N5V2 710 aa24.25■■□□□ 1.47
PRRT1-201ENST00000211413 DUSP27Q5VZP5 1158 aa24.24■■□□□ 1.47
PRRT1-201ENST00000211413 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
PRRT1-201ENST00000211413 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa24.23■■□□□ 1.47
PRRT1-201ENST00000211413 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa24.23■■□□□ 1.47
PRRT1-201ENST00000211413 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
PRRT1-201ENST00000211413 LRRC37A3O60309 1634 aa24.22■■□□□ 1.47
PRRT1-201ENST00000211413 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
PRRT1-201ENST00000211413 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
PRRT1-201ENST00000211413 PDE3BQ13370 1112 aa24.2■■□□□ 1.46
PRRT1-201ENST00000211413 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
PRRT1-201ENST00000211413 E9PSI1 815 aa24.2■■□□□ 1.46
PRRT1-201ENST00000211413 POTEAQ6S8J7 498 aa24.2■■□□□ 1.46
PRRT1-201ENST00000211413 MBIPQ9NS73 344 aa24.2■■□□□ 1.46
PRRT1-201ENST00000211413 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa24.19■■□□□ 1.46
PRRT1-201ENST00000211413 KRT24Q2M2I5 525 aa24.19■■□□□ 1.46
PRRT1-201ENST00000211413 FANCIQ9NVI1 1328 aa24.19■■□□□ 1.46
PRRT1-201ENST00000211413 TNS2Q63HR2 1409 aa24.18■■□□□ 1.46
PRRT1-201ENST00000211413 SCN11AQ9UI33 1791 aa24.18■■□□□ 1.46
PRRT1-201ENST00000211413 KCNQ3O43525 872 aa24.18■■□□□ 1.46
PRRT1-201ENST00000211413 ZNF853P0CG23 659 aa24.18■■□□□ 1.46
PRRT1-201ENST00000211413 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
PRRT1-201ENST00000211413 SEPT12Q8IYM1 358 aa24.18■■□□□ 1.46
PRRT1-201ENST00000211413 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa24.18■■□□□ 1.46
PRRT1-201ENST00000211413 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
PRRT1-201ENST00000211413 DCAF5Q96JK2 942 aa24.17■■□□□ 1.46
PRRT1-201ENST00000211413 CFAP44Q96MT7 982 aa24.17■■□□□ 1.46
PRRT1-201ENST00000211413 EP400Q96L91 3159 aa24.17■■□□□ 1.46
PRRT1-201ENST00000211413 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
PRRT1-201ENST00000211413 TEFQ10587 303 aa24.16■■□□□ 1.46
PRRT1-201ENST00000211413 ACSBG1Q96GR2 724 aa24.16■■□□□ 1.46
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