RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000041055.8

Atg2b-201, Transcript of Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Atg2b, Length 7,546 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2b-201ENSMUST00000041055 PrxO55103 1391 aa14.71□□□□□ -0.05
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Cfap58B2RW38 873 aa14.71□□□□□ -0.05
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Sugp2Q8CH09 1067 aa14.71□□□□□ -0.05
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Spty2d1Q68FG3 682 aa14.71□□□□□ -0.05
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Ptpdc1Q6NZK8 747 aa14.71□□□□□ -0.05
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Ccdc39Q9D5Y1 937 aa14.71□□□□□ -0.05
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Stk11ipQ3TAA7 1072 aa14.71□□□□□ -0.06
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Jmjd4Q8BFT6 427 aa14.71□□□□□ -0.06
Atg2b-201ENSMUST00000041055 OvosQ3UU35 1456 aa14.71□□□□□ -0.06
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Ipo4Q8VI75 1082 aa14.71□□□□□ -0.06
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Vps37dQ810I0 261 aa14.7□□□□□ -0.06
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Samd1D3YXK1 519 aa14.7□□□□□ -0.06
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Babam1Q3UI43 333 aa14.7□□□□□ -0.06
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Larp1Q6ZQ58 1072 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
Atg2b-201ENSMUST00000041055 AidaQ8C4Q6 305 aa14.7□□□□□ -0.06
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Pde4dQ01063 747 aa14.7□□□□□ -0.06
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Fam13aQ8BGI4 693 aa14.7□□□□□ -0.06
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Aldh1l1Q8R0Y6 902 aa14.7□□□□□ -0.06
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Fam50bQ9WTJ8 334 aa14.7□□□□□ -0.06
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Abcd1P48410 736 aa14.7□□□□□ -0.06
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Ccdc172Q810N9 267 aa14.7□□□□□ -0.06
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Pms1Q8K119 917 aa14.7□□□□□ -0.06
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Neo1P97798 1493 aa14.69□□□□□ -0.06
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Fnbp4Q6ZQ03 1031 aa14.69□□□□□ -0.06
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Dmrt2Q8BG36 561 aa14.69□□□□□ -0.06
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Dnajc2P54103 621 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Fez1Q8K0X8 392 aa14.69□□□□□ -0.06
Atg2b-201ENSMUST00000041055 CenpqQ9CPQ5 267 aa14.68□□□□□ -0.06
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Galntl5Q9D4M9 431 aa14.68□□□□□ -0.06
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Mlh3A0A1Y7VMP7 1443 aa14.68□□□□□ -0.06
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Slc7a3P70423 618 aa14.68□□□□□ -0.06
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Fam184aE9PW83 1143 aa14.68□□□□□ -0.06
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Egfem1Q8C088 590 aa14.68□□□□□ -0.06
Atg2b-201ENSMUST00000041055 TnikP83510 1323 aa14.68□□□□□ -0.06
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Rfx7F8VPJ6 1459 aa14.68□□□□□ -0.06
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Ddx58Q6Q899 926 aa14.68□□□□□ -0.06
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Rbm27Q5SFM8 1060 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Nol11Q8BJW5 723 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Slc5a1Q8C3K6 665 aa14.67□□□□□ -0.06
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Nap1l2P51860 460 aa14.67□□□□□ -0.06
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Mctp1E9PV86 951 aa14.67□□□□□ -0.06
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Znf704Q9ERQ3 566 aa14.67□□□□□ -0.06
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Pmfbp1Q9WVQ0 1022 aa14.67□□□□□ -0.06
Atg2b-201ENSMUST00000041055 DroshaQ5HZJ0 1373 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Ppip5k2Q6ZQB6 1129 aa14.67□□□□□ -0.06
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Maco1Q7TQE6 664 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Nup88Q8CEC0 753 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
Atg2b-201ENSMUST00000041055 MycnP03966 462 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Klc3Q91W40 508 aa14.66□□□□□ -0.06
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Gm1043A0A140LJC2 1431 aa14.66□□□□□ -0.06
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Sptbn5F6UCX4 1208 aa14.66□□□□□ -0.06
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Nol7Q9D7Z3 254 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Cavin1O54724 392 aa14.66□□□□□ -0.06
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Slc26a8Q8R0C3 999 aa14.66□□□□□ -0.06
Atg2b-201ENSMUST00000041055 EappQ5BU09 281 aa14.66□□□□□ -0.06
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Golim4Q8BXA1 655 aa14.66□□□□□ -0.06
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Map9Q3TRR0 646 aa14.65□□□□□ -0.06
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Iqca1Q9CUL5 857 aa14.65□□□□□ -0.06
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Dnaaf4Q8R368 420 aa14.65□□□□□ -0.06
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Lrrfip2Q91WK0 415 aa14.65□□□□□ -0.06
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Rrs1Q9CYH6 365 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Lamc3Q9R0B6 1581 aa14.65□□□□□ -0.06
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Mctp2Q5RJH2 878 aa14.65□□□□□ -0.06
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Brf1Q8CFK2 676 aa14.65□□□□□ -0.06
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Pcf11G3X9Z4 1553 aa14.64□□□□□ -0.07
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Olfml1Q8BSH2 233 aa14.64□□□□□ -0.07
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Olr1Q9EQ09 363 aa14.64□□□□□ -0.07
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Naip2Q9QUK4 1447 aa14.64□□□□□ -0.07
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Abcc5Q9R1X5 1436 aa14.64□□□□□ -0.07
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Gm10563F6WIE4 79 aa14.64□□□□□ -0.07
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Cers3Q1A3B0 383 aa14.64□□□□□ -0.07
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Ccdc178Q8CDV0 866 aa14.64□□□□□ -0.07
Atg2b-201ENSMUST00000041055 PtprkP35822 1457 aa14.64□□□□□ -0.07
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Bicdl1A0JNT9 577 aa14.64□□□□□ -0.07
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Cep55Q8BT07 462 aa14.64□□□□□ -0.07
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Polr3aB2RXC6 1390 aa14.63□□□□□ -0.07
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Top2bQ64511 1612 aa14.63□□□□□ -0.07
Atg2b-201ENSMUST00000041055 NapbP28663 298 aa14.63□□□□□ -0.07
Atg2b-201ENSMUST00000041055 CastP51125 788 aa14.63□□□□□ -0.07
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Slc5a4bQ91ZP4 660 aa14.63□□□□□ -0.07
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Trim11Q99PQ2 467 aa14.63□□□□□ -0.07
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Mipol1Q9D9F8 279 aa14.63□□□□□ -0.07
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Spg7Q3ULF4 781 aa14.63□□□□□ -0.07
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Nup133Q8R0G9 1155 aa14.63□□□□□ -0.07
Atg2b-201ENSMUST00000041055 GpkowQ56A08 488 aa14.63□□□□□ -0.07
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Rnf41Q8BH75 317 aa14.63□□□□□ -0.07
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Lamb3Q61087 1168 aa14.62□□□□□ -0.07
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Wdr62Q3U3T8 1523 aa14.62□□□□□ -0.07
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Idi2Q8BFZ6 227 aa14.62□□□□□ -0.07
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Fam135aQ6NS59 1506 aa14.62□□□□□ -0.07
Atg2b-201ENSMUST00000041055 ArsiQ32KI9 573 aa14.62□□□□□ -0.07
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Pafah1b1P63005 410 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
Atg2b-201ENSMUST00000041055 TxlnaQ6PAM1 554 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Brms1Q99N20 246 aa14.61□□□□□ -0.07
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa14.61□□□□□ -0.07
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Rapgef6Q5NCJ1 1609 aa14.61□□□□□ -0.07
Atg2b-201ENSMUST00000041055 SrrtQ99MR6 875 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Cetn2Q9R1K9 172 aa14.61□□□□□ -0.07
Atg2b-201ENSMUST00000041055 TimelessQ9R1X4 1197 aa14.61□□□□□ -0.07
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Bag3Q9JLV1 577 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 15.8 ms