RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622362.1

FAM200B-223, Transcript of family with sequence similarity 200 member B, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM200B, Length 4,377 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM200B-223	ENST00000622362	SNAPC2	Q13487	334 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	HERC3	Q15034	1050 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	TPSAB1	Q15661	275 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	CYP2A13	Q16696	494 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	RAP1GAP2	Q684P5	730 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	GPR153	Q6NV75	609 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	SYCE2	Q6PIF2	218 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	TXNDC11	Q6PKC3	985 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	DET1	Q7L5Y6	550 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	ZNF572	Q7Z3I7	529 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	PHC2	Q8IXK0	858 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	CHPF	Q8IZ52	775 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	GAD1	Q99259	594 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	CNPPD1	Q9BV87	410 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	ELOVL4	Q9GZR5	314 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	AASDHPPT	Q9NRN7	309 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	BRWD1	Q9NSI6	2320 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	STX16	O14662	325 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	SLC30A4	O14863	429 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	ZNF182	P17025	639 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	ALDH3A2	P51648	485 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	GDF10	P55107	478 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	TEX44	Q53QW1	395 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	FAM182A	Q5T1J6	154 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	TTC29	Q8NA56	475 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	POP5	Q969H6	163 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	SLC39A3	Q9BRY0	314 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	CDT1	Q9H211	546 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	TRIT1	Q9H3H1	467 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	ZFYVE1	Q9HBF4	777 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	CD320	Q9NPF0	282 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	COMMD3	Q9UBI1	195 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	NAV1	Q8NEY1	1877 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	CHURC1-FNTB	B4DL54	471 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	hCG_2039718	K7EN88	272 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	SGTA	O43765	313 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	MTHFD1	P11586	935 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	CDK18	Q07002	472 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	SLC9B1	Q4ZJI4	515 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	GPAT3	Q53EU6	434 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	XKR6	Q5GH73	641 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	RAB11FIP1	Q6WKZ4	1283 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	LAPTM4B	Q86VI4	370 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	ANKRD46	Q86W74	232 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	NT5DC4	Q86YG4	428 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	CENPS	Q8N2Z9	138 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	OR4L1	Q8NH43	312 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	TEFM	Q96QE5	360 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	BCL2L14	Q9BZR8	327 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	RSPH9	Q9H1X1	276 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	MAGEE1	Q9HCI5	957 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	NEMP2	A6NFY4	417 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	CCL22	O00626	93 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	KDM4B	O94953	1096 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	LRG1	P02750	347 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	ERBB2	P04626	1255 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	PSKH1	P11801	424 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	GTF2E2	P29084	291 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	RPL4	P36578	427 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	NRL	P54845	237 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	MAZ	P56270	477 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	ASTE1	Q2TB18	679 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	HECTD2	Q5U5R9	776 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	EEF1DP3	Q658K8	133 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	SLC22A16	Q86VW1	577 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	PKP2	Q99959	881 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	HIPK3	Q9H422	1215 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	SLC35C2	Q9NQQ7	365 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	VPS51	Q9UID3	782 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	HACL1	Q9UJ83	578 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	PCDHB5	Q9Y5E4	795 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	GSAP	A4D1B5	854 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	TNFRSF11B	O00300	401 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	SERPINB7	O75635	380 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	CPT1A	P50416	773 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	PSMD5	Q16401	504 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	CXorf57	Q6NSI4	855 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	KLHL24	Q6TFL4	600 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	ZYG11A	Q6WRX3	759 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	OTOP3	Q7RTS5	596 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	SPATA19	Q7Z5L4	167 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	FAM35A	Q86V20	835 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	CLIP4	Q8N3C7	705 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	VANGL1	Q8TAA9	524 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	ESAM	Q96AP7	390 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	MAGEB10	Q96LZ2	347 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	ZFP3	Q96NJ6	502 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	S100A13	Q99584	98 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	CCDC3	Q9BQI4	270 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	PRDM8	Q9NQV8	689 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	ST14	Q9Y5Y6	855 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	CLIC3	O95833	236 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	PGR	P06401	933 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	POLR2E	P19388	210 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	CYP2C18	P33260	490 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	MNDA	P41218	407 aa		11.63	□□□□□ -0.55

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