RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596282.5

ZNF548-205, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

TSL 5

Gene ZNF548, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-205ENST00000596282 PDK1Q15118 436 aa11□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 C16orf46Q6P387 395 aa11□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 NT5DC3Q86UY8 548 aa11□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 LRRTM4Q86VH4 590 aa11□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 RFX6Q8HWS3 928 aa11□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 PQLC3Q8N755 202 aa11□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 CXorf40BQ96DE9 158 aa11□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 RTP4Q96DX8 246 aa11□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 AGAP3Q96P47 875 aa11□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 RNF157Q96PX1 679 aa11□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa11□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 TRIM39Q9HCM9 518 aa11□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 PRDM8Q9NQV8 689 aa11□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 FBXO8Q9NRD0 319 aa11□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 ATXN10Q9UBB4 475 aa11□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa11□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 TENM4Q6N022 2769 aa11□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 MYO18BQ8IUG5 2567 aa11□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 LILRA5A6NI73 299 aa10.99□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 KMOO15229 486 aa10.99□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 SUV39H1O43463 412 aa10.99□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 TYRP1P17643 537 aa10.99□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 ITGB6P18564 788 aa10.99□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 TCN2P20062 427 aa10.99□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 PBX1P40424 430 aa10.99□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 HALP42357 657 aa10.99□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 SEPHS1P49903 392 aa10.99□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 ARSDP51689 593 aa10.99□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 ABHD18Q0P651 414 aa10.99□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 CDC20Q12834 499 aa10.99□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 ZBTB17Q13105 803 aa10.99□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 TRIM14Q14142 442 aa10.99□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 SLC18A3Q16572 532 aa10.99□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 PDPK2PQ6A1A2 396 aa10.99□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 CYB5D1Q6P9G0 228 aa10.99□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa10.99□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 CPNE8Q86YQ8 564 aa10.99□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 RASGRP3Q8IV61 690 aa10.99□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 UNC5BQ8IZJ1 945 aa10.99□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 TRAM1L1Q8N609 369 aa10.99□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 ESX1Q8N693 406 aa10.99□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 RAPGEF5Q92565 580 aa10.99□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 GLYATL1Q969I3 302 aa10.99□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 FAF2Q96CS3 445 aa10.99□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 SLC45A3Q96JT2 553 aa10.99□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 TGM7Q96PF1 710 aa10.99□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 PACSIN1Q9BY11 444 aa10.99□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 ULBP3Q9BZM4 244 aa10.99□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 PDP2Q9P2J9 529 aa10.99□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 PILRAQ9UKJ1 303 aa10.99□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 ZNF711Q9Y462 761 aa10.99□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa10.98□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 TERTO14746 1132 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 NKX2-8O15522 239 aa10.98□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 CBFA2T2O43439 604 aa10.98□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 PMPCBO75439 489 aa10.98□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 UBXN7O94888 489 aa10.98□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 CDK14O94921 469 aa10.98□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 MMP2P08253 660 aa10.98□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 TMEM253P0C7T8 217 aa10.98□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 IDSP22304 550 aa10.98□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 DCDC1P59894 354 aa10.98□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 TLE1Q04724 770 aa10.98□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 CDK18Q07002 472 aa10.98□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 IHHQ14623 411 aa10.98□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 DEFB109BQ30KR1 87 aa10.98□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 TMEM26Q6ZUK4 368 aa10.98□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa10.98□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 BMPERQ8N8U9 685 aa10.98□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 GPR26Q8NDV2 337 aa10.98□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 OR8K1Q8NGG5 319 aa10.98□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 STARD8Q92502 1023 aa10.98□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa10.98□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 CCDC42Q96M95 316 aa10.98□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa10.98□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 WDR24Q96S15 920 aa10.98□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 SLC25A51Q9H1U9 297 aa10.98□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 MAGEE1Q9HCI5 957 aa10.98□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 APMAPQ9HDC9 416 aa10.98□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 TRIM10Q9UDY6 481 aa10.98□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 TUBD1Q9UJT1 453 aa10.98□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 NAV2Q8IVL1 2488 aa10.97□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP10.97□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 SPOPO43791 374 aa10.97□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 VEGFDO43915 354 aa10.97□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 MTX2O75431 263 aa10.97□□□□□ -0.65
ZNF548-205ENST00000596282 KATNA1O75449 491 aa10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.3 ms