RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584538.1

USP22-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 22, human

TSL 4

Gene USP22, Length 554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP22-211	ENST00000584538	SPTBN4	Q9H254	2564 aa		11.73	□□□□□ -0.53
USP22-211	ENST00000584538	CACNA1A	O00555	2505 aa		11.73	□□□□□ -0.53
USP22-211	ENST00000584538	PTPRB	P23467	1997 aa		11.72	□□□□□ -0.53
USP22-211	ENST00000584538		A6NCN8	305 aa		11.72	□□□□□ -0.53
USP22-211	ENST00000584538	GPR89A	B7ZAQ6	455 aa		11.72	□□□□□ -0.53
USP22-211	ENST00000584538	AP3B1	O00203	1094 aa		11.72	□□□□□ -0.53
USP22-211	ENST00000584538	TPP1	O14773	563 aa		11.72	□□□□□ -0.53
USP22-211	ENST00000584538	SIGLEC6	O43699	453 aa		11.72	□□□□□ -0.53
USP22-211	ENST00000584538	VEGFD	O43915	354 aa		11.72	□□□□□ -0.53
USP22-211	ENST00000584538	BANF1	O75531	89 aa		11.72	□□□□□ -0.53
USP22-211	ENST00000584538	DKK1	O94907	266 aa		11.72	□□□□□ -0.53
USP22-211	ENST00000584538	SLC25A14	O95258	325 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
USP22-211	ENST00000584538	KCNK5	O95279	499 aa		11.72	□□□□□ -0.53
USP22-211	ENST00000584538	GPR89B	P0CG08	455 aa		11.72	□□□□□ -0.53
USP22-211	ENST00000584538	ITGAL	P20701	1170 aa		11.72	□□□□□ -0.53
USP22-211	ENST00000584538	AK4	P27144	223 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
USP22-211	ENST00000584538	ADCY8	P40145	1251 aa		11.72	□□□□□ -0.53
USP22-211	ENST00000584538	NOVA1	P51513	510 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
USP22-211	ENST00000584538	CTSC	P53634	463 aa		11.72	□□□□□ -0.53
USP22-211	ENST00000584538	SEMA3A	Q14563	771 aa		11.72	□□□□□ -0.53
USP22-211	ENST00000584538	PUM1	Q14671	1186 aa	Known RBP eCLIP	11.72	□□□□□ -0.53
USP22-211	ENST00000584538	MORF4L2	Q15014	288 aa		11.72	□□□□□ -0.53
USP22-211	ENST00000584538	SUZ12	Q15022	739 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
USP22-211	ENST00000584538	DBN1	Q16643	649 aa		11.72	□□□□□ -0.53
USP22-211	ENST00000584538	DEFB133	Q30KQ1	61 aa		11.72	□□□□□ -0.53
USP22-211	ENST00000584538	INAVA	Q3KP66	663 aa		11.72	□□□□□ -0.53
USP22-211	ENST00000584538	MSS51	Q4VC12	460 aa		11.72	□□□□□ -0.53
USP22-211	ENST00000584538	LDLRAP1	Q5SW96	308 aa		11.72	□□□□□ -0.53
USP22-211	ENST00000584538	C6orf132	Q5T0Z8	1188 aa		11.72	□□□□□ -0.53
USP22-211	ENST00000584538	DUPD1	Q68J44	220 aa		11.72	□□□□□ -0.53
USP22-211	ENST00000584538	AFTPH	Q6ULP2	937 aa		11.72	□□□□□ -0.53
USP22-211	ENST00000584538	MARK2	Q7KZI7	788 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
USP22-211	ENST00000584538	NLRP9	Q7RTR0	991 aa		11.72	□□□□□ -0.53
USP22-211	ENST00000584538	RD3	Q7Z3Z2	195 aa		11.72	□□□□□ -0.53
USP22-211	ENST00000584538	SFTPA2	Q8IWL1	248 aa		11.72	□□□□□ -0.53
USP22-211	ENST00000584538	NOA1	Q8NC60	698 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
USP22-211	ENST00000584538	ZNF398	Q8TD17	642 aa		11.72	□□□□□ -0.53
USP22-211	ENST00000584538	NAT14	Q8WUY8	206 aa		11.72	□□□□□ -0.53
USP22-211	ENST00000584538	SNF8	Q96H20	258 aa		11.72	□□□□□ -0.53
USP22-211	ENST00000584538	SGSM3	Q96HU1	749 aa		11.72	□□□□□ -0.53
USP22-211	ENST00000584538	SIGLEC10	Q96LC7	697 aa		11.72	□□□□□ -0.53
USP22-211	ENST00000584538	BOC	Q9BWV1	1114 aa		11.72	□□□□□ -0.53
USP22-211	ENST00000584538	FAM96A	Q9H5X1	160 aa		11.72	□□□□□ -0.53
USP22-211	ENST00000584538	ASB8	Q9H765	288 aa		11.72	□□□□□ -0.53
USP22-211	ENST00000584538	RMI1	Q9H9A7	625 aa		11.72	□□□□□ -0.53
USP22-211	ENST00000584538	BFAR	Q9NZS9	450 aa		11.72	□□□□□ -0.53
USP22-211	ENST00000584538	PRKAB1	Q9Y478	270 aa		11.72	□□□□□ -0.53
USP22-211	ENST00000584538	PCNX2	A6NKB5	2137 aa		11.72	□□□□□ -0.53
USP22-211	ENST00000584538	ZCWPW2	A0A1B0GU75	182 aa		11.71	□□□□□ -0.53
USP22-211	ENST00000584538	EFCAB8	A8MWE9	144 aa		11.71	□□□□□ -0.53
USP22-211	ENST00000584538	YY2	O15391	372 aa		11.71	□□□□□ -0.53
USP22-211	ENST00000584538	NOBOX	O60393	691 aa		11.71	□□□□□ -0.53
USP22-211	ENST00000584538	ASMTL	O95671	621 aa		11.71	□□□□□ -0.53
USP22-211	ENST00000584538	GOT2	P00505	430 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
USP22-211	ENST00000584538	ACRV1	P26436	265 aa		11.71	□□□□□ -0.53
USP22-211	ENST00000584538	ID4	P47928	161 aa		11.71	□□□□□ -0.53
USP22-211	ENST00000584538	ACADVL	P49748	655 aa		11.71	□□□□□ -0.53
USP22-211	ENST00000584538	ITGA8	P53708	1063 aa		11.71	□□□□□ -0.53
USP22-211	ENST00000584538	CTBS	Q01459	385 aa		11.71	□□□□□ -0.53
USP22-211	ENST00000584538	CACNG1	Q06432	222 aa		11.71	□□□□□ -0.53
USP22-211	ENST00000584538	CBLB	Q13191	982 aa		11.71	□□□□□ -0.53
USP22-211	ENST00000584538	LAMB3	Q13751	1172 aa		11.71	□□□□□ -0.53
USP22-211	ENST00000584538	LRP8	Q14114	963 aa		11.71	□□□□□ -0.53
USP22-211	ENST00000584538	ELOC	Q15369	112 aa		11.71	□□□□□ -0.53
USP22-211	ENST00000584538	SKIDA1	Q1XH10	827 aa		11.71	□□□□□ -0.53
USP22-211	ENST00000584538	ZNF658B	Q4V348	819 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
USP22-211	ENST00000584538	FNBP1L	Q5T0N5	605 aa		11.71	□□□□□ -0.53
USP22-211	ENST00000584538	KIAA0930	Q6ICG6	404 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
USP22-211	ENST00000584538	ZCCHC8	Q6NZY4	707 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
USP22-211	ENST00000584538	CRTC3	Q6UUV7	619 aa		11.71	□□□□□ -0.53
USP22-211	ENST00000584538	CES3	Q6UWW8	571 aa		11.71	□□□□□ -0.53
USP22-211	ENST00000584538	SERPINA9	Q86WD7	417 aa		11.71	□□□□□ -0.53
USP22-211	ENST00000584538	GALNT13	Q8IUC8	556 aa		11.71	□□□□□ -0.53
USP22-211	ENST00000584538	SLC35F3	Q8IY50	421 aa		11.71	□□□□□ -0.53
USP22-211	ENST00000584538	SDR16C5	Q8N3Y7	309 aa		11.71	□□□□□ -0.53
USP22-211	ENST00000584538	MMGT1	Q8N4V1	131 aa		11.71	□□□□□ -0.53
USP22-211	ENST00000584538	PNPLA1	Q8N8W4	532 aa		11.71	□□□□□ -0.53
USP22-211	ENST00000584538	RASGEF1A	Q8N9B8	481 aa		11.71	□□□□□ -0.53
USP22-211	ENST00000584538	FAM181A	Q8N9Y4	354 aa		11.71	□□□□□ -0.53
USP22-211	ENST00000584538	KY	Q8NBH2	561 aa		11.71	□□□□□ -0.53
USP22-211	ENST00000584538	KIF18A	Q8NI77	898 aa		11.71	□□□□□ -0.53
USP22-211	ENST00000584538	SETD7	Q8WTS6	366 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
USP22-211	ENST00000584538	HDAC10	Q969S8	669 aa		11.71	□□□□□ -0.53
USP22-211	ENST00000584538	ULK4	Q96C45	1275 aa		11.71	□□□□□ -0.53
USP22-211	ENST00000584538	MFSD3	Q96ES6	412 aa		11.71	□□□□□ -0.53
USP22-211	ENST00000584538	CNDP2	Q96KP4	475 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
USP22-211	ENST00000584538	PWWP2A	Q96N64	755 aa		11.71	□□□□□ -0.53
USP22-211	ENST00000584538	ERP44	Q9BS26	406 aa		11.71	□□□□□ -0.53
USP22-211	ENST00000584538	TRIM31	Q9BZY9	425 aa		11.71	□□□□□ -0.53
USP22-211	ENST00000584538	MARCH4	Q9P2E8	410 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
USP22-211	ENST00000584538	FTSJ1	Q9UET6	329 aa		11.71	□□□□□ -0.53
USP22-211	ENST00000584538	CRLS1	Q9UJA2	301 aa		11.71	□□□□□ -0.53
USP22-211	ENST00000584538	MOSPD1	Q9UJG1	213 aa		11.71	□□□□□ -0.53
USP22-211	ENST00000584538	FAM237B	A0A1B0GVD1	139 aa		11.7	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	SPAAR	A0A1B0GVQ0	90 aa		11.7	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538		E7ESA3	106 aa		11.7	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	GRID2	O43424	1007 aa		11.7	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	EML2	O95834	649 aa		11.7	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	ACP5	P13686	325 aa		11.7	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	CEACAM1	P13688	526 aa		11.7	□□□□□ -0.54

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