RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578501.5

CSNK1D-208, Transcript of casein kinase 1 delta, human

TSL 2

Gene CSNK1D, Length 1,124 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSNK1D-208	ENST00000578501	LRRC40	Q9H9A6	602 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	LRIT1	Q9P2V4	623 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	RABGEF1	Q9UJ41	708 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	TMPRSS11E	Q9UL52	423 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	PLEKHM1	Q9Y4G2	1056 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	PCYT1B	Q9Y5K3	369 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	AK5	Q9Y6K8	562 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	RNF215	Q9Y6U7	377 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	KNTC1	P50748	2209 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	MAST4	O15021	2626 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	GLYATL1P3	A0A0U1RQE8	302 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	ERI2	A8K979	691 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	STX7	O15400	261 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	CS	O75390	466 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	ECEL1	O95672	775 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	AP2A1	O95782	977 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	GPR3	P46089	330 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	ITGA9	Q13797	1035 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	SPIDR	Q14159	915 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	SIX1	Q15475	284 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	CHRNA6	Q15825	494 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	CHST15	Q7LFX5	561 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	CCNJL	Q8IV13	435 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	SFTPA2	Q8IWL1	248 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	NAGS	Q8N159	534 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	ARL14	Q8N4G2	192 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	APOL2	Q9BQE5	337 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	LRRN3	Q9H3W5	708 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	SMOX	Q9NWM0	555 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	ZNF148	Q9UQR1	794 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	JRKL	Q9Y4A0	524 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	ARL5A	Q9Y689	179 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	SCN8A	Q9UQD0	1980 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501		A0A1W2PQM1	296 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	TMX2-CTNND1	H3BSU7	103 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	ERVH48-1	M5A8F1	160 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	GAPDHS	O14556	408 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	KMO	O15229	486 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	ZW10	O43264	779 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	USP12	O75317	370 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	ACTN2	P35609	894 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	FDFT1	P37268	417 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	FASLG	P48023	281 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	CCL7	P80098	99 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	TMEM115	Q12893	351 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	OLIG2	Q13516	323 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	SPARCL1	Q14515	664 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	CLPP	Q16740	277 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	LDLRAP1	Q5SW96	308 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	FAM151B	Q6UXP7	276 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	SPRED1	Q7Z699	444 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	LINC00523	Q86TU6	105 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	DDHD1	Q8NEL9	900 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	OR4K2	Q8NGD2	314 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	SNIP1	Q8TAD8	396 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	C1orf54	Q8WWF1	131 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	ANP32B	Q92688	251 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	WBP1	Q96G27	269 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	GFM1	Q96RP9	751 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	ZCCHC2	Q9C0B9	1178 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	HOMER3	Q9NSC5	361 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	PRKAB1	Q9Y478	270 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	ENTPD2	Q9Y5L3	495 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	MYLK	Q15746	1914 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501		A6NCN8	305 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	OR5K4	A6NMS3	321 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	RHPN2P1	A8MT19	583 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501		D6RAR5	112 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	ZSCAN12	O43309	604 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	LDB2	O43679	373 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	BUD23	O43709	281 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	KCNJ13	O60928	360 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	DXO	O77932	396 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	SUN1	O94901	812 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	CDK14	O94921	469 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	FGG	P02679	453 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	RPLP0	P05388	317 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	ACP5	P13686	325 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	SLC2A4	P14672	509 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	HADHA	P40939	763 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	LSS	P48449	732 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	ZNF140	P52738	457 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	MAZ	P56270	477 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	B4GALNT1	Q00973	533 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	KHDC1	Q4VXA5	237 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	TAF1B	Q53T94	588 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	ZNF648	Q5T619	568 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	IYD	Q6PHW0	289 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	IGF2-AS	Q6U949	168 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	C4orf22	Q6V702	233 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	LRRTM4	Q86VH4	590 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	ZNF547	Q8IVP9	402 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	REXO1L1P	Q8IX06	675 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	LSMEM2	Q8N112	164 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	SFRP1	Q8N474	314 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	ZNF398	Q8TD17	642 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	FGF11	Q92914	225 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	TIMM29	Q9BSF4	260 aa		13.46	□□□□□ -0.25

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