RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564630.5

CCNDBP1-205, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 2,079 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-205ENST00000564630 FAM92AA1XBS5 289 aa20.17■□□□□ 0.82
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CCNDBP1-205ENST00000564630 FGF1P05230 155 aa20.17■□□□□ 0.82
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CCNDBP1-205ENST00000564630 DCKP27707 260 aa20.17■□□□□ 0.82
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CCNDBP1-205ENST00000564630 SH3BP2P78314 561 aa20.15■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 CTBSQ01459 385 aa20.15■□□□□ 0.82
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CCNDBP1-205ENST00000564630 BRSK1Q8TDC3 778 aa20.15■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 ROPN1LQ96C74 230 aa20.15■□□□□ 0.82
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CCNDBP1-205ENST00000564630 SLC45A3Q96JT2 553 aa20.15■□□□□ 0.82
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CCNDBP1-205ENST00000564630 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 GPX3P22352 226 aa20.15■□□□□ 0.82
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