RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541770.1

CLSTN3-212, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 3

Gene CLSTN3, Length 568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-212ENST00000541770 ZNF148Q9UQR1 794 aa8.66□□□□□ -1.02
CLSTN3-212ENST00000541770 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa8.66□□□□□ -1.02
CLSTN3-212ENST00000541770 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
CLSTN3-212ENST00000541770 OR1A2Q9Y585 309 aa8.66□□□□□ -1.02
CLSTN3-212ENST00000541770 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-212ENST00000541770 TOR1BO14657 336 aa8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-212ENST00000541770 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-212ENST00000541770 PDHA1P08559 390 aa8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-212ENST00000541770 CCL4P13236 92 aa8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-212ENST00000541770 LIFP15018 202 aa8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-212ENST00000541770 CD82P27701 267 aa8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-212ENST00000541770 MMP12P39900 470 aa8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-212ENST00000541770 CASRP41180 1078 aa8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-212ENST00000541770 PAFAH1B1P43034 410 aa8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-212ENST00000541770 FNTAP49354 379 aa8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-212ENST00000541770 GEMP55040 296 aa8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-212ENST00000541770 CDK18Q07002 472 aa8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-212ENST00000541770 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-212ENST00000541770 BIRC2Q13490 618 aa8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-212ENST00000541770 SNX1Q13596 522 aa8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-212ENST00000541770 PRPSAP1Q14558 356 aa8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-212ENST00000541770 INPP5AQ14642 412 aa8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-212ENST00000541770 NFATC4Q14934 902 aa8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-212ENST00000541770 C16orf72Q14CZ0 275 aa8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-212ENST00000541770 PARP6Q2NL67 630 aa8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-212ENST00000541770 FAM182AQ5T1J6 154 aa8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-212ENST00000541770 KDELC1Q6UW63 502 aa8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-212ENST00000541770 C4orf22Q6V702 233 aa8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-212ENST00000541770 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-212ENST00000541770 USP45Q70EL2 814 aa8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-212ENST00000541770 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-212ENST00000541770 SPRED1Q7Z699 444 aa8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-212ENST00000541770 PIM3Q86V86 326 aa8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-212ENST00000541770 SFTPA2Q8IWL1 248 aa8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-212ENST00000541770 FAM26EQ8N5C1 309 aa8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-212ENST00000541770 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-212ENST00000541770 RCBTB1Q8NDN9 531 aa8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-212ENST00000541770 GPR156Q8NFN8 814 aa8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-212ENST00000541770 ATL2Q8NHH9 583 aa8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-212ENST00000541770 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-212ENST00000541770 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-212ENST00000541770 SCRN2Q96FV2 425 aa8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-212ENST00000541770 PDXPQ96GD0 296 aa8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-212ENST00000541770 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-212ENST00000541770 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-212ENST00000541770 WDR92Q96MX6 357 aa8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-212ENST00000541770 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-212ENST00000541770 LYSMD1Q96S90 227 aa8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-212ENST00000541770 APOOQ9BUR5 198 aa8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-212ENST00000541770 SLC12A9Q9BXP2 914 aa8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-212ENST00000541770 AP1M1Q9BXS5 423 aa8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-212ENST00000541770 ADGRE3Q9BY15 652 aa8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-212ENST00000541770 ZMYND15Q9H091 742 aa8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-212ENST00000541770 PCDH12Q9NPG4 1184 aa8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-212ENST00000541770 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-212ENST00000541770 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-212ENST00000541770 PAK5Q9P286 719 aa8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-212ENST00000541770 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-212ENST00000541770 ANAPC2Q9UJX6 822 aa8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-212ENST00000541770 CHKBQ9Y259 395 aa8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-212ENST00000541770 A0A0J9YYE9 177 aa8.64□□□□□ -1.03
CLSTN3-212ENST00000541770 GOLGA6CA6NDK9 693 aa8.64□□□□□ -1.03
CLSTN3-212ENST00000541770 GOLGA6BA6NDN3 693 aa8.64□□□□□ -1.03
CLSTN3-212ENST00000541770 ANKRD66B4E2M5 251 aa8.64□□□□□ -1.03
CLSTN3-212ENST00000541770 PSMD11O00231 422 aa8.64□□□□□ -1.03
CLSTN3-212ENST00000541770 PSMD3O43242 534 aa8.64□□□□□ -1.03
CLSTN3-212ENST00000541770 PHF2O75151 1096 aa8.64□□□□□ -1.03
CLSTN3-212ENST00000541770 NDST3O95803 873 aa8.64□□□□□ -1.03
CLSTN3-212ENST00000541770 IFNB1P01574 187 aa8.64□□□□□ -1.03
CLSTN3-212ENST00000541770 TRBC1P01850 177 aa8.64□□□□□ -1.03
CLSTN3-212ENST00000541770 GOLGA6DP0CG33 693 aa8.64□□□□□ -1.03
CLSTN3-212ENST00000541770 PRKAR1AP10644 381 aa8.64□□□□□ -1.03
CLSTN3-212ENST00000541770 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
CLSTN3-212ENST00000541770 ZNF30P17039 623 aa8.64□□□□□ -1.03
CLSTN3-212ENST00000541770 HLA-DPA1P20036 260 aa8.64□□□□□ -1.03
CLSTN3-212ENST00000541770 PSMB4P28070 264 aa8.64□□□□□ -1.03
CLSTN3-212ENST00000541770 ALDH4A1P30038 563 aa8.64□□□□□ -1.03
CLSTN3-212ENST00000541770 VIPR1P32241 457 aa8.64□□□□□ -1.03
CLSTN3-212ENST00000541770 FDFT1P37268 417 aa8.64□□□□□ -1.03
CLSTN3-212ENST00000541770 COILP38432 576 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
CLSTN3-212ENST00000541770 KCNJ1P48048 391 aa8.64□□□□□ -1.03
CLSTN3-212ENST00000541770 EPHB1P54762 984 aa8.64□□□□□ -1.03
CLSTN3-212ENST00000541770 WNT3AP56704 352 aa8.64□□□□□ -1.03
CLSTN3-212ENST00000541770 AGERQ15109 404 aa8.64□□□□□ -1.03
CLSTN3-212ENST00000541770 C14orf28Q4W4Y0 310 aa8.64□□□□□ -1.03
CLSTN3-212ENST00000541770 CERCAMQ5T4B2 595 aa8.64□□□□□ -1.03
CLSTN3-212ENST00000541770 KCTD11Q693B1 232 aa8.64□□□□□ -1.03
CLSTN3-212ENST00000541770 TTC27Q6P3X3 843 aa8.64□□□□□ -1.03
CLSTN3-212ENST00000541770 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
CLSTN3-212ENST00000541770 DPPA4Q7L190 304 aa8.64□□□□□ -1.03
CLSTN3-212ENST00000541770 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
CLSTN3-212ENST00000541770 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
CLSTN3-212ENST00000541770 PAF1Q8N7H5 531 aa8.64□□□□□ -1.03
CLSTN3-212ENST00000541770 CCDC89Q8N998 374 aa8.64□□□□□ -1.03
CLSTN3-212ENST00000541770 LPCAT1Q8NF37 534 aa8.64□□□□□ -1.03
CLSTN3-212ENST00000541770 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
CLSTN3-212ENST00000541770 GRK7Q8WTQ7 553 aa8.64□□□□□ -1.03
CLSTN3-212ENST00000541770 NKD1Q969G9 470 aa8.64□□□□□ -1.03
CLSTN3-212ENST00000541770 MRGPRX2Q96LB1 330 aa8.64□□□□□ -1.03
CLSTN3-212ENST00000541770 RUNDC3BQ96NL0 473 aa8.64□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms