RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541134.5

HIVEP1-208, Transcript of human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 1, human

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene HIVEP1, Length 9,023 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HIVEP1-208	ENST00000541134	BST1	Q10588	318 aa		11.75	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	ZDHHC20	Q5W0Z9	365 aa		11.75	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	PPP3R2	Q96LZ3	170 aa		11.75	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	SFXN1	Q9H9B4	322 aa		11.75	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	SIX4	Q9UIU6	781 aa		11.75	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	AP2A1	O95782	977 aa		11.75	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	PAICS	P22234	425 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	MSX2	P35548	267 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	HCFC1R1	Q9NWW0	138 aa		11.75	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	SDC3	O75056	442 aa		11.75	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	CHIT1	Q13231	466 aa		11.75	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	TSN	Q15631	228 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	MCEMP1	Q8IX19	187 aa		11.75	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	CNPY4	Q8N129	248 aa		11.75	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	TXNDC5	Q8NBS9	432 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	HEXDC	Q8WVB3	486 aa		11.75	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	C5orf34	Q96MH7	638 aa		11.75	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	MYLK2	Q9H1R3	596 aa		11.75	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	SUCO	Q9UBS9	1254 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	WASF2	Q9Y6W5	498 aa		11.75	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134		M0R3G1	203 aa		11.75	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	GNB5	O14775	395 aa		11.75	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	LDB2	O43679	373 aa		11.75	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	BDKRB1	P46663	353 aa		11.75	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	PRKAA2	P54646	552 aa		11.75	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	FRG1	Q14331	258 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	MYLK3	Q32MK0	819 aa		11.75	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	EID3	Q8N140	333 aa		11.75	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	ACTRT2	Q8TDY3	377 aa		11.75	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	HNRNPLL	Q8WVV9	542 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	DNAJC9	Q8WXX5	260 aa		11.75	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	ANKRD7	Q92527	254 aa		11.75	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	EGFL7	Q9UHF1	273 aa		11.75	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	EIF2B4	Q9UI10	523 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		11.75	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	SHPRH	Q149N8	1683 aa		11.75	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134		A8MUI8	341 aa		11.75	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	VPS4B	O75351	444 aa		11.75	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	KCNE1	P15382	129 aa		11.75	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	NQO1	P15559	274 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	ATP6V0D1	P61421	351 aa		11.75	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	FAM171B	Q6P995	826 aa		11.75	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	SPATS2L	Q9NUQ6	558 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	SCML2	Q9UQR0	700 aa		11.75	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	PEX1	O43933	1283 aa		11.75	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	METTL18	O95568	372 aa		11.75	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	ZCCHC18	P0CG32	403 aa		11.75	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	OR5M3	Q8NGP4	307 aa		11.75	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	ASB2	Q96Q27	587 aa		11.75	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	MAF1	Q9H063	256 aa		11.75	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	ADAMTS10	Q9H324	1103 aa		11.75	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	TMEM245	Q9H330	911 aa		11.75	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	MAP4K5	Q9Y4K4	846 aa		11.75	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	ITGB1	P05556	798 aa		11.74	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	ZBTB17	Q13105	803 aa		11.74	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	DGKK	Q5KSL6	1271 aa		11.74	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	PRAMEF14	Q5SWL7	426 aa		11.74	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	DUPD1	Q68J44	220 aa		11.74	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	FAM110B	Q8TC76	370 aa		11.74	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	ADAMTS15	Q8TE58	950 aa		11.74	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	TP53INP1	Q96A56	240 aa		11.74	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	DEPDC7	Q96QD5	511 aa		11.74	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	MRPS30	Q9NP92	439 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	PTGES3L	E9PB15	166 aa		11.74	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	MYOG	P15173	224 aa		11.74	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	ZIK1	Q3SY52	487 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	TAS1R3	Q7RTX0	852 aa		11.74	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		11.74	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	OR10T2	Q8NGX3	314 aa		11.74	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	LRRC4C	Q9HCJ2	640 aa		11.74	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	CCDC162P	A2VCL2	907 aa		11.74	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	UQCRB	P14927	111 aa		11.74	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	FAS	P25445	335 aa		11.74	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	ACAP2	Q15057	778 aa		11.74	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	MS4A13	Q5J8X5	152 aa		11.74	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	PHC3	Q8NDX5	983 aa		11.74	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		11.74	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	ELL3	Q9HB65	397 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	KCTD3	Q9Y597	815 aa		11.74	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	PCDHB11	Q9Y5F2	797 aa		11.74	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	PSMB9	P28065	219 aa		11.74	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	HNRNPD	Q14103	355 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	SHISA4	Q96DD7	197 aa		11.74	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	NOD2	Q9HC29	1040 aa		11.74	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	MYOCOS	A0A1B0GUC4	107 aa		11.74	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	TRBC1	P01850	177 aa		11.74	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	PITRM1	Q5JRX3	1037 aa		11.74	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	ZMIZ2	Q8NF64	920 aa		11.74	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	CDK15	Q96Q40	435 aa		11.74	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	S100A5	P33763	92 aa		11.74	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	MFSD5	Q6N075	450 aa		11.74	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	TTC27	Q6P3X3	843 aa		11.74	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	GPRIN1	Q7Z2K8	1008 aa		11.74	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	KAT2A	Q92830	837 aa		11.74	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	DNASE1L2	Q92874	299 aa		11.74	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	MCIDAS	D6RGH6	385 aa		11.74	□□□□□ -0.53
HIVEP1-208	ENST00000541134	NIPSNAP2	O75323	286 aa		11.74	□□□□□ -0.53

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.7 ms