RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540501.1

STIP1-208, Transcript of stress induced phosphoprotein 1, humanhuman

TSL 3

Gene STIP1, Length 880 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STIP1-208ENST00000540501 RMI1Q9H9A7 625 aa25.45■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 PILRBQ9UKJ0 227 aa25.45■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa25.45■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa25.44■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 A0A1W2PR77 199 aa25.44■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 TNFRSF10CO14798 259 aa25.44■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 TCF15Q12870 199 aa25.44■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 SLC29A2Q14542 456 aa25.44■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 DBN1Q16643 649 aa25.44■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 PACS1Q6VY07 963 aa25.44■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 UNC5BQ8IZJ1 945 aa25.44■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 PRSS33Q8NF86 280 aa25.44■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 WDR92Q96MX6 357 aa25.44■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 PPCSQ9HAB8 311 aa25.44■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa25.44■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 RABGEF1Q9UJ41 708 aa25.44■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa25.44■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 OR1A2Q9Y585 309 aa25.44■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 R4GN57 208 aa25.44■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa25.43■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 VILLO15195 856 aa25.43■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 ASMTLO95671 621 aa25.43■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 AKT1P31749 480 aa25.43■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 ADARP55265 1226 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 DUOXA1Q1HG43 343 aa25.43■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa25.43■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 MACC1Q6ZN28 852 aa25.43■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 CTAGE3PQ8IX95 158 aa25.43■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 PIGKQ92643 395 aa25.43■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 CPNE1Q99829 537 aa25.43■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 GPR27Q9NS67 375 aa25.43■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 FETUBQ9UGM5 382 aa25.43■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 CA5BQ9Y2D0 317 aa25.43■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa25.43■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 CACNA1EQ15878 2313 aa25.43■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 UQCRHLA0A096LP55 91 aa25.42■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 H0Y8X5 98 aa25.42■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 TLR4O00206 839 aa25.42■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 AP2A2O94973 939 aa25.42■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 UQCRHP07919 91 aa25.42■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP25.42■■□□□ 1.662e-7■■□□□ 13.1
STIP1-208ENST00000540501 HSD17B3P37058 310 aa25.42■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 SLC1A2P43004 574 aa25.42■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 C21orf59P57076 290 aa25.42■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 CTBP1Q13363 440 aa25.42■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 LAIR1Q6GTX8 287 aa25.42■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 OR13H1Q8NG92 308 aa25.42■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 CLPBQ9H078 707 aa25.42■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 ARFGAP3Q9NP61 516 aa25.42■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 COMMD10Q9Y6G5 202 aa25.42■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 IKBKGQ9Y6K9 419 aa25.42■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 WDFY4Q6ZS81 3184 aa25.41■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 H3BMM5 538 aa25.41■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 CDK14O94921 469 aa25.41■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 EPN2O95208 641 aa25.41■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 S1PR4O95977 384 aa25.41■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 IVLP07476 585 aa25.41■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 SEMA3AQ14563 771 aa25.41■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 DENND6AQ8IWF6 608 aa25.41■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 PPM1NQ8N819 430 aa25.41■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 OR56A4Q8NGH8 313 aa25.41■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 LGR4Q9BXB1 951 aa25.41■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 CCDC68Q9H2F9 335 aa25.41■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 GPR34Q9UPC5 381 aa25.41■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa25.41■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 KNL1Q8NG31 2342 aa25.4■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa25.4■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa25.4■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 GPR39O43194 453 aa25.4■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 C1QAP02745 245 aa25.4■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 PRSS56P0CW18 603 aa25.4■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 GP5P40197 560 aa25.4■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 CD151P48509 253 aa25.4■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 BLKP51451 505 aa25.4■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 GRTP1Q5TC63 336 aa25.4■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 ENPP7Q6UWV6 458 aa25.4■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa25.4■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 TSSK1BQ9BXA7 367 aa25.4■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 EPB41L4BQ9H329 900 aa25.4■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 GNPTGQ9UJJ9 305 aa25.4■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 KLHL33A6NCF5 533 aa25.39■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 NUAK1O60285 661 aa25.39■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 ESR1P03372 595 aa25.39■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 GSTM1P09488 218 aa25.39■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 NUDT17P0C025 328 aa25.39■■□□□ 1.66
STIP1-208ENST00000540501 OR56A5P0C7T3 313 aa25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms