RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534284.1

CYCSP28-201, Transcript of cytochrome c, somatic pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene CYCSP28, Length 321 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYCSP28-201ENST00000534284 RAD23BP54727 409 aa4.75□□□□□ -1.65
CYCSP28-201ENST00000534284 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
CYCSP28-201ENST00000534284 CDH6P55285 790 aa4.75□□□□□ -1.65
CYCSP28-201ENST00000534284 SOX10P56693 466 aa4.75□□□□□ -1.65
CYCSP28-201ENST00000534284 RPL26P61254 145 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
CYCSP28-201ENST00000534284 XIAPP98170 497 aa4.75□□□□□ -1.65
CYCSP28-201ENST00000534284 SP2Q02086 613 aa4.75□□□□□ -1.65
CYCSP28-201ENST00000534284 OGDHQ02218 1023 aa4.75□□□□□ -1.65
CYCSP28-201ENST00000534284 HGFACQ04756 655 aa4.75□□□□□ -1.65
CYCSP28-201ENST00000534284 KLC1Q07866 573 aa4.75□□□□□ -1.65
CYCSP28-201ENST00000534284 WASHC5Q12768 1159 aa4.75□□□□□ -1.65
CYCSP28-201ENST00000534284 RIN1Q13671 783 aa4.75□□□□□ -1.65
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CYCSP28-201ENST00000534284 TMEM132DQ14C87 1099 aa4.75□□□□□ -1.65
CYCSP28-201ENST00000534284 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
CYCSP28-201ENST00000534284 SLC1A5Q15758 541 aa4.75□□□□□ -1.65
CYCSP28-201ENST00000534284 RNF151Q2KHN1 245 aa4.75□□□□□ -1.65
CYCSP28-201ENST00000534284 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
CYCSP28-201ENST00000534284 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
CYCSP28-201ENST00000534284 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
CYCSP28-201ENST00000534284 FNBP1LQ5T0N5 605 aa4.75□□□□□ -1.65
CYCSP28-201ENST00000534284 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
CYCSP28-201ENST00000534284 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
CYCSP28-201ENST00000534284 FAXCQ5TGI0 409 aa4.75□□□□□ -1.65
CYCSP28-201ENST00000534284 SLC9A4Q6AI14 798 aa4.75□□□□□ -1.65
CYCSP28-201ENST00000534284 PLAG1Q6DJT9 500 aa4.75□□□□□ -1.65
CYCSP28-201ENST00000534284 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
CYCSP28-201ENST00000534284 EFCAB12Q6NXP0 572 aa4.75□□□□□ -1.65
CYCSP28-201ENST00000534284 FAM180BQ6P0A1 224 aa4.75□□□□□ -1.65
CYCSP28-201ENST00000534284 DENND1BQ6P3S1 775 aa4.75□□□□□ -1.65
CYCSP28-201ENST00000534284 C4orf50Q6ZRC1 276 aa4.75□□□□□ -1.65
CYCSP28-201ENST00000534284 SEPT14Q6ZU15 432 aa4.75□□□□□ -1.65
CYCSP28-201ENST00000534284 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
CYCSP28-201ENST00000534284 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
CYCSP28-201ENST00000534284 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa4.75□□□□□ -1.65
CYCSP28-201ENST00000534284 LRRTM4Q86VH4 590 aa4.75□□□□□ -1.65
CYCSP28-201ENST00000534284 ZNF410Q86VK4 478 aa4.75□□□□□ -1.65
CYCSP28-201ENST00000534284 CCDC28AQ8IWP9 274 aa4.75□□□□□ -1.65
CYCSP28-201ENST00000534284 KIRREL3Q8IZU9 778 aa4.75□□□□□ -1.65
CYCSP28-201ENST00000534284 ARHGAP18Q8N392 663 aa4.75□□□□□ -1.65
CYCSP28-201ENST00000534284 KIF2BQ8N4N8 673 aa4.75□□□□□ -1.65
CYCSP28-201ENST00000534284 WDTC1Q8N5D0 677 aa4.75□□□□□ -1.65
CYCSP28-201ENST00000534284 LRRC52Q8N7C0 313 aa4.75□□□□□ -1.65
CYCSP28-201ENST00000534284 FAM71DQ8N9W8 422 aa4.75□□□□□ -1.65
CYCSP28-201ENST00000534284 RNF169Q8NCN4 708 aa4.75□□□□□ -1.65
CYCSP28-201ENST00000534284 SHCBP1Q8NEM2 672 aa4.75□□□□□ -1.65
CYCSP28-201ENST00000534284 GSDMBQ8TAX9 411 aa4.75□□□□□ -1.65
CYCSP28-201ENST00000534284 PPP4R1Q8TF05 950 aa4.75□□□□□ -1.65
CYCSP28-201ENST00000534284 DNAJC9Q8WXX5 260 aa4.75□□□□□ -1.65
CYCSP28-201ENST00000534284 TFAP2BQ92481 460 aa4.75□□□□□ -1.65
CYCSP28-201ENST00000534284 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
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CYCSP28-201ENST00000534284 HPDLQ96IR7 371 aa4.75□□□□□ -1.65
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CYCSP28-201ENST00000534284 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
CYCSP28-201ENST00000534284 CPXM1Q96SM3 734 aa4.75□□□□□ -1.65
CYCSP28-201ENST00000534284 PCYT2Q99447 389 aa4.75□□□□□ -1.65
CYCSP28-201ENST00000534284 SMOQ99835 787 aa4.75□□□□□ -1.65
CYCSP28-201ENST00000534284 GDF15Q99988 308 aa4.75□□□□□ -1.65
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CYCSP28-201ENST00000534284 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa4.75□□□□□ -1.65
CYCSP28-201ENST00000534284 CALN1Q9BXU9 219 aa4.75□□□□□ -1.65
CYCSP28-201ENST00000534284 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
CYCSP28-201ENST00000534284 FAM192AQ9GZU8 254 aa4.75□□□□□ -1.65
CYCSP28-201ENST00000534284 SPATC1LQ9H0A9 340 aa4.75□□□□□ -1.65
CYCSP28-201ENST00000534284 BRD8Q9H0E9 1235 aa4.75□□□□□ -1.65
CYCSP28-201ENST00000534284 SDCBP2Q9H190 292 aa4.75□□□□□ -1.65
CYCSP28-201ENST00000534284 CDT1Q9H211 546 aa4.75□□□□□ -1.65
CYCSP28-201ENST00000534284 MROH8Q9H579 483 aa4.75□□□□□ -1.65
CYCSP28-201ENST00000534284 EPS8L2Q9H6S3 715 aa4.75□□□□□ -1.65
CYCSP28-201ENST00000534284 ZWILCHQ9H900 591 aa4.75□□□□□ -1.65
CYCSP28-201ENST00000534284 MLXIPLQ9NP71 852 aa4.75□□□□□ -1.65
CYCSP28-201ENST00000534284 THAP1Q9NVV9 213 aa4.75□□□□□ -1.65
CYCSP28-201ENST00000534284 IRAK4Q9NWZ3 460 aa4.75□□□□□ -1.65
CYCSP28-201ENST00000534284 ERAP1Q9NZ08 941 aa4.75□□□□□ -1.65
CYCSP28-201ENST00000534284 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa4.75□□□□□ -1.65
CYCSP28-201ENST00000534284 HACD3Q9P035 362 aa4.75□□□□□ -1.65
CYCSP28-201ENST00000534284 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
CYCSP28-201ENST00000534284 MORF4L1Q9UBU8 362 aa4.75□□□□□ -1.65
CYCSP28-201ENST00000534284 BCAP29Q9UHQ4 241 aa4.75□□□□□ -1.65
CYCSP28-201ENST00000534284 HAO1Q9UJM8 370 aa4.75□□□□□ -1.65
CYCSP28-201ENST00000534284 ADAM28Q9UKQ2 775 aa4.75□□□□□ -1.65
CYCSP28-201ENST00000534284 GRID1Q9ULK0 1009 aa4.75□□□□□ -1.65
CYCSP28-201ENST00000534284 SUFUQ9UMX1 484 aa4.75□□□□□ -1.65
CYCSP28-201ENST00000534284 PLLPQ9Y342 182 aa4.75□□□□□ -1.65
CYCSP28-201ENST00000534284 COL4A5P29400 1685 aa4.75□□□□□ -1.65
CYCSP28-201ENST00000534284 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa4.74□□□□□ -1.65
CYCSP28-201ENST00000534284 A0A0G2JND7 137 aa4.74□□□□□ -1.65
CYCSP28-201ENST00000534284 FAM159BA6NKW6 160 aa4.74□□□□□ -1.65
CYCSP28-201ENST00000534284 AQP7P3A6NL99 342 aa4.74□□□□□ -1.65
CYCSP28-201ENST00000534284 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
CYCSP28-201ENST00000534284 TRIM49D1C9J1S8 452 aa4.74□□□□□ -1.65
CYCSP28-201ENST00000534284 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa4.74□□□□□ -1.65
CYCSP28-201ENST00000534284 GOLGA8MH3BSY2 632 aa4.74□□□□□ -1.65
CYCSP28-201ENST00000534284 SLC22A2O15244 555 aa4.74□□□□□ -1.65
CYCSP28-201ENST00000534284 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
CYCSP28-201ENST00000534284 GLRA3O75311 464 aa4.74□□□□□ -1.65
CYCSP28-201ENST00000534284 SOAT2O75908 522 aa4.74□□□□□ -1.65
CYCSP28-201ENST00000534284 PIAS2O75928 621 aa4.74□□□□□ -1.65
CYCSP28-201ENST00000534284 STC2O76061 302 aa4.74□□□□□ -1.65
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