RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533557.5

BBS1-222, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 1,043 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-222	ENST00000533557	ETNK2	Q9NVF9	386 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	AP4E1	Q9UPM8	1137 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	FARSA	Q9Y285	508 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	ATP6V1D	Q9Y5K8	247 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	MDC1	Q14676	2089 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	ANKUB1	A6NFN9	424 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	TOX3	O15405	576 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	DPM1	O60762	260 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	RASSF9	O75901	435 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	CLDN7	O95471	211 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	PRL	P01236	227 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF8	P17098	575 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	XRCC1	P18887	633 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	LPO	P22079	712 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	CA5A	P35218	305 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	RENBP	P51606	427 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	GPS2	Q13227	327 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	CLEC16A	Q2KHT3	1053 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF517	Q6ZMY9	492 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF765	Q7L2R6	523 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	SYVN1	Q86TM6	617 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF677	Q86XU0	584 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	SLC41A2	Q96JW4	573 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	TUBGCP2	Q9BSJ2	902 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	CNPY3	Q9BT09	278 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	SNRNP25	Q9BV90	132 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	SLC29A3	Q9BZD2	475 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	KLC4	Q9NSK0	619 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	CWC15	Q9P013	229 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	VPS18	Q9P253	973 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	SEMA5B	Q9P283	1151 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	ATXN10	Q9UBB4	475 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	ENTPD4	Q9Y227	616 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	MASP2	O00187	686 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	HNRNPR	O43390	633 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	GRID2	O43424	1007 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	NUAK1	O60285	661 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	MAFK	O60675	156 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	CAPN1	P07384	714 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	EBLN1	P0CF75	366 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	SPTB	P11277	2137 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	AMD1	P17707	334 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	AIF1	P55008	147 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	JAM2	P57087	298 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	DPYS	Q14117	519 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	ARMC12	Q5T9G4	340 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	MCEMP1	Q8IX19	187 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	SLC34A3	Q8N130	599 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	ZBTB2	Q8N680	514 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	SMAD5	Q99717	465 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	TRIM7	Q9C029	511 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	CHST8	Q9H2A9	424 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	STN1	Q9H668	368 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	FAM207A	Q9NSI2	230 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	PCSK1N	Q9UHG2	260 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	PCDHGB7	Q9Y5F8	929 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557		A0A0J9YYE9	177 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557		A0A1W2PQ67	120 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	OR5K4	A6NMS3	321 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	OR52A4P	A6NMU1	304 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557		F5H423	210 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	LRCH4	O75427	683 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	TMEM63A	O94886	807 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	TRBC1	P01850	177 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	MT-ND3	P03897	115 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	PRKCSH	P14314	528 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	HTR7	P34969	479 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	CAPZB	P47756	277 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	CLCNKA	P51800	687 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	CDK18	Q07002	472 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	TUBB3	Q13509	450 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	GPR18	Q14330	331 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF235	Q14590	738 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	HENMT1	Q5T8I9	393 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	IRGC	Q6NXR0	463 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	USP45	Q70EL2	814 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	ZC3H18	Q86VM9	953 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	TMEM151B	Q8IW70	566 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	RHOT1	Q8IXI2	618 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	AOPEP	Q8N6M6	819 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	GLIS1	Q8NBF1	620 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	EID2B	Q96D98	161 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF599	Q96NL3	588 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	ZBTB20	Q9HC78	741 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	SLC40A1	Q9NP59	571 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	EPHA6	Q9UF33	1036 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	RARRES3	Q9UL19	164 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	SSU72P8	A0A1W2PR75	194 aa		11.92	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	DDX3Y	O15523	660 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	DAPK3	O43293	454 aa		11.92	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	LRRTM2	O43300	516 aa		11.92	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	ZG16	O60844	167 aa		11.92	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	VIP	P01282	170 aa		11.92	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	AMPD1	P23109	780 aa		11.92	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	IL4R	P24394	825 aa		11.92	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	RPL10	P27635	214 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	SOX5	P35711	763 aa		11.92	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	NSF	P46459	744 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	RPS15	P62841	145 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	SEPT7	Q16181	437 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5

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