RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531184.5

GSDMD-211, Transcript of gasdermin D, humanhuman

TSL 2

Gene GSDMD, Length 2,213 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMD-211ENST00000531184 ASNSD1Q9NWL6 643 aa20.61■□□□□ 0.89
GSDMD-211ENST00000531184 TCRBV5S2A0A599 114 aa20.6■□□□□ 0.89
GSDMD-211ENST00000531184 METTL15A6NJ78 407 aa20.6■□□□□ 0.89
GSDMD-211ENST00000531184 LEUTXA8MZ59 168 aa20.6■□□□□ 0.89
GSDMD-211ENST00000531184 ARIH2O95376 493 aa20.6■□□□□ 0.89
GSDMD-211ENST00000531184 HPRP00739 348 aa20.6■□□□□ 0.89
GSDMD-211ENST00000531184 ALPLP05186 524 aa20.6■□□□□ 0.89
GSDMD-211ENST00000531184 TGM2P21980 687 aa20.6■□□□□ 0.89
GSDMD-211ENST00000531184 MIPP30301 263 aa20.6■□□□□ 0.89
GSDMD-211ENST00000531184 NXNL2Q5VZ03 156 aa20.6■□□□□ 0.89
GSDMD-211ENST00000531184 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
GSDMD-211ENST00000531184 SPPL2BQ8TCT7 592 aa20.6■□□□□ 0.89
GSDMD-211ENST00000531184 BIRC7Q96CA5 298 aa20.6■□□□□ 0.89
GSDMD-211ENST00000531184 LGALS12Q96DT0 336 aa20.6■□□□□ 0.89
GSDMD-211ENST00000531184 NAT9Q9BTE0 207 aa20.6■□□□□ 0.89
GSDMD-211ENST00000531184 TAS2R9Q9NYW1 312 aa20.6■□□□□ 0.89
GSDMD-211ENST00000531184 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa20.6■□□□□ 0.89
GSDMD-211ENST00000531184 KRT87PA6NCN2 255 aa20.59■□□□□ 0.89
GSDMD-211ENST00000531184 SLC1A7O00341 560 aa20.59■□□□□ 0.89
GSDMD-211ENST00000531184 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
GSDMD-211ENST00000531184 ICAM2P13598 275 aa20.59■□□□□ 0.89
GSDMD-211ENST00000531184 ALOX12P18054 663 aa20.59■□□□□ 0.89
GSDMD-211ENST00000531184 EPS8Q12929 822 aa20.59■□□□□ 0.89
GSDMD-211ENST00000531184 SNTA1Q13424 505 aa20.59■□□□□ 0.89
GSDMD-211ENST00000531184 DSC3Q14574 896 aa20.59■□□□□ 0.89
GSDMD-211ENST00000531184 STARD3Q14849 445 aa20.59■□□□□ 0.89
GSDMD-211ENST00000531184 MEP1AQ16819 746 aa20.59■□□□□ 0.89
GSDMD-211ENST00000531184 PARP15Q460N3 678 aa20.59■□□□□ 0.89
GSDMD-211ENST00000531184 XRRA1Q6P2D8 792 aa20.59■□□□□ 0.89
GSDMD-211ENST00000531184 PARP16Q8N5Y8 322 aa20.59■□□□□ 0.89
GSDMD-211ENST00000531184 PLD5Q8N7P1 536 aa20.59■□□□□ 0.89
GSDMD-211ENST00000531184 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
GSDMD-211ENST00000531184 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
GSDMD-211ENST00000531184 MXRA8Q9BRK3 442 aa20.59■□□□□ 0.89
GSDMD-211ENST00000531184 ACSS2Q9NR19 701 aa20.59■□□□□ 0.89
GSDMD-211ENST00000531184 WDR70Q9NW82 654 aa20.59■□□□□ 0.89
GSDMD-211ENST00000531184 USP18Q9UMW8 372 aa20.59■□□□□ 0.89
GSDMD-211ENST00000531184 HES2Q9Y543 173 aa20.59■□□□□ 0.89
GSDMD-211ENST00000531184 A8MV72 311 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
GSDMD-211ENST00000531184 TBC1D4O60343 1298 aa20.59■□□□□ 0.89
GSDMD-211ENST00000531184 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
GSDMD-211ENST00000531184 PRPSAP1Q14558 356 aa20.59■□□□□ 0.89
GSDMD-211ENST00000531184 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
GSDMD-211ENST00000531184 SLC39A4Q6P5W5 647 aa20.59■□□□□ 0.89
GSDMD-211ENST00000531184 ZFAND1Q8TCF1 268 aa20.59■□□□□ 0.89
GSDMD-211ENST00000531184 CEP19Q96LK0 163 aa20.59■□□□□ 0.89
GSDMD-211ENST00000531184 RNF157Q96PX1 679 aa20.59■□□□□ 0.89
GSDMD-211ENST00000531184 MCMBPQ9BTE3 642 aa20.59■□□□□ 0.89
GSDMD-211ENST00000531184 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
GSDMD-211ENST00000531184 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
GSDMD-211ENST00000531184 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
GSDMD-211ENST00000531184 ITM2CQ9NQX7 267 aa20.59■□□□□ 0.89
GSDMD-211ENST00000531184 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
GSDMD-211ENST00000531184 LRRC37A2A6NM11 1700 aa20.59■□□□□ 0.89
GSDMD-211ENST00000531184 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
GSDMD-211ENST00000531184 H3BMM5 538 aa20.58■□□□□ 0.89
GSDMD-211ENST00000531184 H3BUI4 141 aa20.58■□□□□ 0.89
GSDMD-211ENST00000531184 VNN1O95497 513 aa20.58■□□□□ 0.89
GSDMD-211ENST00000531184 ARP10275 920 aa20.58■□□□□ 0.89
GSDMD-211ENST00000531184 TALDO1P37837 337 aa20.58■□□□□ 0.89
GSDMD-211ENST00000531184 CDH6P55285 790 aa20.58■□□□□ 0.89
GSDMD-211ENST00000531184 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
GSDMD-211ENST00000531184 FADDQ13158 208 aa20.58■□□□□ 0.89
GSDMD-211ENST00000531184 LY6KQ17RY6 165 aa20.58■□□□□ 0.89
GSDMD-211ENST00000531184 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
GSDMD-211ENST00000531184 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
GSDMD-211ENST00000531184 TMEM151AQ8N4L1 468 aa20.58■□□□□ 0.89
GSDMD-211ENST00000531184 WDTC1Q8N5D0 677 aa20.58■□□□□ 0.89
GSDMD-211ENST00000531184 MINDY1Q8N5J2 469 aa20.58■□□□□ 0.89
GSDMD-211ENST00000531184 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa20.58■□□□□ 0.89
GSDMD-211ENST00000531184 APPL2Q8NEU8 664 aa20.58■□□□□ 0.89
GSDMD-211ENST00000531184 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP20.58■□□□□ 0.89
GSDMD-211ENST00000531184 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa20.58■□□□□ 0.89
GSDMD-211ENST00000531184 PHOX2BQ99453 314 aa20.58■□□□□ 0.89
GSDMD-211ENST00000531184 SLC30A3Q99726 388 aa20.58■□□□□ 0.89
GSDMD-211ENST00000531184 KIFC1Q9BW19 673 aa20.58■□□□□ 0.89
GSDMD-211ENST00000531184 CHST12Q9NRB3 414 aa20.58■□□□□ 0.89
GSDMD-211ENST00000531184 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
GSDMD-211ENST00000531184 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
GSDMD-211ENST00000531184 INPP4BO15327 924 aa20.58■□□□□ 0.88
GSDMD-211ENST00000531184 C2P06681 752 aa20.58■□□□□ 0.88
GSDMD-211ENST00000531184 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.88
GSDMD-211ENST00000531184 UQCRC1P31930 480 aa20.58■□□□□ 0.88
GSDMD-211ENST00000531184 RARRES1P49788 294 aa20.58■□□□□ 0.88
GSDMD-211ENST00000531184 SP2Q02086 613 aa20.58■□□□□ 0.88
GSDMD-211ENST00000531184 TRAF3Q13114 568 aa20.58■□□□□ 0.88
GSDMD-211ENST00000531184 MTMR1Q13613 665 aa20.58■□□□□ 0.88
GSDMD-211ENST00000531184 HSDL1Q3SXM5 330 aa20.58■□□□□ 0.88
GSDMD-211ENST00000531184 LAIR2Q6ISS4 152 aa20.58■□□□□ 0.88
GSDMD-211ENST00000531184 FSTL4Q6MZW2 842 aa20.58■□□□□ 0.88
GSDMD-211ENST00000531184 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.88
GSDMD-211ENST00000531184 LIX1LQ8IVB5 337 aa20.58■□□□□ 0.88
GSDMD-211ENST00000531184 COPS5Q92905 334 aa20.58■□□□□ 0.88
GSDMD-211ENST00000531184 ZNF566Q969W8 418 aa20.58■□□□□ 0.88
GSDMD-211ENST00000531184 CCDC120Q96HB5 630 aa20.58■□□□□ 0.88
GSDMD-211ENST00000531184 FEM1AQ9BSK4 669 aa20.58■□□□□ 0.88
GSDMD-211ENST00000531184 TEKT3Q9BXF9 490 aa20.58■□□□□ 0.88
GSDMD-211ENST00000531184 CCDC90BQ9GZT6 254 aa20.58■□□□□ 0.88
GSDMD-211ENST00000531184 RNF208Q9H0X6 261 aa20.58■□□□□ 0.88
GSDMD-211ENST00000531184 EPS8L2Q9H6S3 715 aa20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.2 ms