RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519057.5

COPS5-208, Transcript of COP9 signalosome subunit 5, human

TSL 4

Gene COPS5, Length 566 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COPS5-208	ENST00000519057	SCPEP1	Q9HB40	452 aa		4.06	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	PCDHB16	Q9NRJ7	776 aa		4.06	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		4.06	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	KLHL9	Q9P2J3	617 aa		4.06	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	ACAD8	Q9UKU7	415 aa		4.06	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	SYNJ1	O43426	1573 aa		4.06	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		4.05	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057		A0A1W2PPI3	338 aa		4.05	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	TMEM178B	H3BS89	294 aa		4.05	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	TGFB1I1	O43294	461 aa		4.05	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	MLYCD	O95822	493 aa		4.05	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	TSHB	P01222	138 aa		4.05	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	CD48	P09326	243 aa		4.05	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF182	P17025	639 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	CHRNB4	P30926	498 aa		4.05	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	EIF3B	P55884	814 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	KIR2DS3	Q14952	304 aa		4.05	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	PLXDC2	Q6UX71	529 aa		4.05	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	RBMS3	Q6XE24	437 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	PLEKHM3	Q6ZWE6	761 aa		4.05	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	DBF4B	Q8NFT6	615 aa		4.05	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	SAAL1	Q96ER3	474 aa		4.05	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	SENP5	Q96HI0	755 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	ASCL2	Q99929	193 aa		4.05	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	LRMDA	Q9H2I8	198 aa		4.05	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	LUZP4	Q9P127	313 aa		4.05	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	CAMK2A	Q9UQM7	478 aa		4.05	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		4.05	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	4.04	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	HHLA1	C9JL84	531 aa		4.04	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	NR5A2	O00482	541 aa		4.04	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	PDE9A	O76083	593 aa		4.04	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	NKX2-2	O95096	273 aa		4.04	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	ICAM3	P32942	547 aa		4.04	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	TUB	P50607	506 aa		4.04	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	RAB6C	Q53S08	254 aa		4.04	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	CDC73	Q6P1J9	531 aa		4.04	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF599	Q96NL3	588 aa		4.04	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	STRA6	Q9BX79	667 aa		4.04	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		4.04	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	RAB6C	Q9H0N0	254 aa		4.04	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	OR14J1	Q9UGF5	321 aa		4.04	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	TOP2B	Q02880	1626 aa		4.03	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057		A0A087X002	238 aa		4.03	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057		A0A1W2PQF6	199 aa		4.03	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	C1orf226	A1L170	272 aa		4.03	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	KRTAP16-1	A8MUX0	517 aa		4.03	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	PAGE4	O60829	102 aa		4.03	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	MCC	P23508	829 aa		4.03	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	ELF1	P32519	619 aa		4.03	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	NR2C2	P49116	596 aa		4.03	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	DRG2	P55039	364 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	MBTD1	Q05BQ5	628 aa		4.03	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	SPOCK1	Q08629	439 aa		4.03	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	ACVR2B	Q13705	512 aa		4.03	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	TSSK4	Q6SA08	328 aa		4.03	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	MMAB	Q96EY8	250 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	ABHD8	Q96I13	439 aa		4.03	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	HARBI1	Q96MB7	349 aa		4.03	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	TMEM68	Q96MH6	324 aa		4.03	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	PIP5K1A	Q99755	562 aa		4.03	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	C2CD2	Q9Y426	696 aa		4.03	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	CLIC4	Q9Y696	253 aa		4.03	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		4.02	□□□□□ -1.77
COPS5-208	ENST00000519057	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		4.02	□□□□□ -1.77
COPS5-208	ENST00000519057		A0A0G2JNG1	304 aa		4.02	□□□□□ -1.77
COPS5-208	ENST00000519057	KCNK5	O95279	499 aa		4.02	□□□□□ -1.77
COPS5-208	ENST00000519057	IGLV1-44	P01699	117 aa		4.02	□□□□□ -1.77
COPS5-208	ENST00000519057	HARS2	P49590	506 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
COPS5-208	ENST00000519057	BIRC3	Q13489	604 aa		4.02	□□□□□ -1.77
COPS5-208	ENST00000519057	KIR2DS5	Q14953	304 aa		4.02	□□□□□ -1.77
COPS5-208	ENST00000519057	NSUN5P2	Q63ZY6	315 aa		4.02	□□□□□ -1.77
COPS5-208	ENST00000519057	OR1J2	Q8NGS2	313 aa		4.02	□□□□□ -1.77
COPS5-208	ENST00000519057	WDR20	Q8TBZ3	569 aa		4.02	□□□□□ -1.77
COPS5-208	ENST00000519057	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		4.02	□□□□□ -1.77
COPS5-208	ENST00000519057	WASH6P	Q9NQA3	447 aa		4.02	□□□□□ -1.77
COPS5-208	ENST00000519057	C2orf42	Q9NWW7	574 aa		4.02	□□□□□ -1.77
COPS5-208	ENST00000519057	ADPRHL2	Q9NX46	363 aa		4.02	□□□□□ -1.77
COPS5-208	ENST00000519057	COPG2	Q9UBF2	871 aa		4.02	□□□□□ -1.77
COPS5-208	ENST00000519057	STK39	Q9UEW8	545 aa		4.02	□□□□□ -1.77
COPS5-208	ENST00000519057	CNOT8	Q9UFF9	292 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
COPS5-208	ENST00000519057	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
COPS5-208	ENST00000519057	EEA1	Q15075	1411 aa		4.02	□□□□□ -1.77
COPS5-208	ENST00000519057	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		4.01	□□□□□ -1.77
COPS5-208	ENST00000519057		A0A1W2PRG0	241 aa		4.01	□□□□□ -1.77
COPS5-208	ENST00000519057	ATP2A1	O14983	1001 aa		4.01	□□□□□ -1.77
COPS5-208	ENST00000519057	JRK	O75564	520 aa		4.01	□□□□□ -1.77
COPS5-208	ENST00000519057	PYGL	P06737	847 aa		4.01	□□□□□ -1.77
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF26	P17031	533 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
COPS5-208	ENST00000519057	MSH3	P20585	1137 aa		4.01	□□□□□ -1.77
COPS5-208	ENST00000519057	MAPK9	P45984	424 aa		4.01	□□□□□ -1.77
COPS5-208	ENST00000519057	F2RL1	P55085	397 aa		4.01	□□□□□ -1.77
COPS5-208	ENST00000519057	MLLT10	P55197	1068 aa		4.01	□□□□□ -1.77
COPS5-208	ENST00000519057	DCTN2	Q13561	401 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
COPS5-208	ENST00000519057	LPAL2	Q16609	132 aa		4.01	□□□□□ -1.77
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF805	Q5CZA5	627 aa		4.01	□□□□□ -1.77
COPS5-208	ENST00000519057	HEATR4	Q86WZ0	1026 aa		4.01	□□□□□ -1.77
COPS5-208	ENST00000519057	ESX1	Q8N693	406 aa		4.01	□□□□□ -1.77

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