RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518916.5

MSC-AS1-204, MSC antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene MSC-AS1, Length 864 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSC-AS1-204ENST00000518916 NSG1P42857 185 aa14.62□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 ADARP55265 1226 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 RAB10P61026 200 aa14.62□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 GAS6Q14393 721 aa14.62□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 LDLRAP1Q5SW96 308 aa14.62□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 GPRC6AQ5T6X5 926 aa14.62□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 SEL1L3Q68CR1 1132 aa14.62□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 NLRP8Q86W28 1048 aa14.62□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 OR2T34Q8NGX1 318 aa14.62□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 GLYATL1Q969I3 302 aa14.62□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 SERAC1Q96JX3 654 aa14.62□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa14.62□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 VPS11Q9H270 941 aa14.62□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 CAB39LQ9H9S4 337 aa14.62□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 ITM2CQ9NQX7 267 aa14.62□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 MKS1Q9NXB0 559 aa14.62□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa14.62□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa14.62□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa14.62□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 A0A087X1B8 175 aa14.61□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 A0A096LPK6 155 aa14.61□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 FADS2P1A8MWK0 482 aa14.61□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 GLRA3O75311 464 aa14.61□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 RHOBTB1O94844 696 aa14.61□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 SEMA4FO95754 770 aa14.61□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 IGLV3-19P01714 112 aa14.61□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 PCCBP05166 539 aa14.61□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 MSH3P20585 1137 aa14.61□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 MAGEA12P43365 314 aa14.61□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 LRRC14Q15048 493 aa14.61□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 AGERQ15109 404 aa14.61□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 MAP7D1Q3KQU3 841 aa14.61□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 TMEM259Q4ZIN3 620 aa14.61□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 CMC1Q7Z7K0 106 aa14.61□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 TRIM69Q86WT6 500 aa14.61□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 TMEM105Q8N8V8 129 aa14.61□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 DDHD1Q8NEL9 900 aa14.61□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 PRSS33Q8NF86 280 aa14.61□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 BTN2A2Q8WVV5 523 aa14.61□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 TSSK1BQ9BXA7 367 aa14.61□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 POPDC3Q9HBV1 291 aa14.61□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 TAS2R13Q9NYV9 303 aa14.61□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 CYP8B1Q9UNU6 501 aa14.61□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 VWA7Q9Y334 891 aa14.61□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 VPS13AQ96RL7 3174 aa14.6□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa14.6□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa14.6□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 TMEM120BA0PK00 339 aa14.6□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 QSOX1O00391 747 aa14.6□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 INPP4BO15327 924 aa14.6□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 OR1I1O60431 355 aa14.6□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 SPAG7O75391 227 aa14.6□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 ZWINTO95229 277 aa14.6□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 DCNP07585 359 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 FDXRP22570 491 aa14.6□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 CCT5P48643 541 aa14.6□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 CCR3P51677 355 aa14.6□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 TAS2R39P59534 338 aa14.6□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 SLC18A2Q05940 514 aa14.6□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 TCF15Q12870 199 aa14.6□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 MTAPQ13126 283 aa14.6□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 GTF2H3Q13889 308 aa14.6□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 IRF4Q15306 451 aa14.6□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 UGT3A1Q6NUS8 523 aa14.6□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 KDM7AQ6ZMT4 941 aa14.6□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 LCA5Q86VQ0 697 aa14.6□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 CAMKK1Q8N5S9 505 aa14.6□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 PNPLA1Q8N8W4 532 aa14.6□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 ASB12Q8WXK4 309 aa14.6□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 KCNJ9Q92806 393 aa14.6□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 FAM122AQ96E09 287 aa14.6□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa14.6□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 SLC17A9Q9BYT1 436 aa14.6□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 P2RY12Q9H244 342 aa14.6□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa14.6□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 TRPM6Q9BX84 2022 aa14.59□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 TM9SF1O15321 606 aa14.59□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 C2P06681 752 aa14.59□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 GSTA1P08263 222 aa14.59□□□□□ -0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 OR56A5P0C7T3 313 aa14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms