RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508338.1

SH3BP2-212, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 491 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-212ENST00000508338 NXPE1Q8N323 547 aa26.53■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 GPBAR1Q8TDU6 330 aa26.53■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 DCUN1D1Q96GG9 259 aa26.53■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 TRIM51Q9BSJ1 452 aa26.53■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 UGT1A7Q9HAW7 530 aa26.53■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 UGT1A10Q9HAW8 530 aa26.53■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 UGT1A8Q9HAW9 530 aa26.53■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 CHRAC1Q9NRG0 131 aa26.53■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 SYBUQ9NX95 663 aa26.53■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa26.53■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 GPSM3Q9Y4H4 160 aa26.53■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa26.52■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 CTAGE15A4D2H0 777 aa26.52■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 KLHL33A6NCF5 533 aa26.52■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 GRID2O43424 1007 aa26.52■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 KCNJ13O60928 360 aa26.52■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 CTAGE8P0CG41 777 aa26.52■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 MSH3P20585 1137 aa26.52■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 CALCOCO2Q13137 446 aa26.52■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa26.52■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 CERS6Q6ZMG9 384 aa26.52■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 TAF8Q7Z7C8 310 aa26.52■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 CTAGE6Q86UF2 777 aa26.52■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 CTAGE4Q8IX94 777 aa26.52■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 PDIK1LQ8N165 341 aa26.52■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 CEP112Q8N8E3 955 aa26.52■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 DEFB124Q8NES8 71 aa26.52■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 COPS8Q99627 209 aa26.52■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 NAT9Q9BTE0 207 aa26.52■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 CLPBQ9H078 707 aa26.52■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 TMEM168Q9H0V1 697 aa26.52■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 TREX1Q9NSU2 369 aa26.52■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 WHRNQ9P202 907 aa26.52■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 ANAPC5Q9UJX4 755 aa26.52■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa26.52■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 GPR34Q9UPC5 381 aa26.52■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 BTBD3Q9Y2F9 522 aa26.52■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa26.51■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 GOLGA8MH3BSY2 632 aa26.51■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 KMOO15229 486 aa26.51■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 YY2O15391 372 aa26.51■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 FFAR2O15552 330 aa26.51■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 RAD51CO43502 376 aa26.51■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 TNFSF14O43557 240 aa26.51■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 AKT1P31749 480 aa26.51■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 RPIAP49247 311 aa26.51■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 C1orf61Q13536 156 aa26.51■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa26.51■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 LRRTM4Q86VH4 590 aa26.51■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 HDAC10Q969S8 669 aa26.51■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa26.51■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 F8W8V4 182 aa26.5■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 FUCA1P04066 466 aa26.5■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 VCLP18206 1134 aa26.5■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 CRADDP78560 199 aa26.5■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 ITIH4Q14624 930 aa26.5■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 C8orf74Q6P047 294 aa26.5■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 TAS2R42Q7RTR8 314 aa26.5■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 CCNJLQ8IV13 435 aa26.5■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 OR6P1Q8NGX9 317 aa26.5■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 OR4L1Q8NH43 312 aa26.5■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 LRRC39Q96DD0 335 aa26.5■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa26.5■■□□□ 1.83
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SH3BP2-212ENST00000508338 CCDC162PA2VCL2 907 aa26.49■■□□□ 1.83
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SH3BP2-212ENST00000508338 KCNK5O95279 499 aa26.49■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 GIMD1P0DJR0 217 aa26.49■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 ACRV1P26436 265 aa26.49■■□□□ 1.83
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SH3BP2-212ENST00000508338 ITGA8P53708 1063 aa26.49■■□□□ 1.83
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SH3BP2-212ENST00000508338 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 KCTD16Q68DU8 428 aa26.49■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 MPP5Q8N3R9 675 aa26.49■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 MMGT1Q8N4V1 131 aa26.49■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 TIMM29Q9BSF4 260 aa26.49■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 BOCQ9BWV1 1114 aa26.49■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 TRIM31Q9BZY9 425 aa26.49■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 ARFGAP3Q9NP61 516 aa26.49■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa26.49■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 CCDC78A2IDD5 438 aa26.48■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 QSOX1O00391 747 aa26.48■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 CCL22O00626 93 aa26.48■■□□□ 1.83
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