RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 CBWD6Q4V339 395 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRC-212ENST00000491302 CBWD3Q5JTY5 395 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRC-212ENST00000491302 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRC-212ENST00000491302 LCN10Q6JVE6 187 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRC-212ENST00000491302 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
PTPRC-212ENST00000491302 FOXRED2Q8IWF2 684 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRC-212ENST00000491302 EMC1Q8N766 993 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRC-212ENST00000491302 OR10S1Q8NGN2 331 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRC-212ENST00000491302 OR14A16Q8NHC5 309 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRC-212ENST00000491302 SMC6Q96SB8 1091 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRC-212ENST00000491302 SEMA3CQ99985 751 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRC-212ENST00000491302 SLC25A33Q9BSK2 321 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRC-212ENST00000491302 ELOVL5Q9NYP7 299 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRC-212ENST00000491302 TINAGQ9UJW2 476 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRC-212ENST00000491302 LOXL2Q9Y4K0 774 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRC-212ENST00000491302 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRC-212ENST00000491302 WDR91A4D1P6 747 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRC-212ENST00000491302 INAFM1C9JVW0 142 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRC-212ENST00000491302 NDUFS4O43181 175 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRC-212ENST00000491302 MOSPD3O75425 235 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRC-212ENST00000491302 BCL10O95999 233 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRC-212ENST00000491302 FBLP22087 321 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
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PTPRC-212ENST00000491302 CLCNKAP51800 687 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRC-212ENST00000491302 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
PTPRC-212ENST00000491302 TAS2R38P59533 333 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRC-212ENST00000491302 TRAF2Q12933 501 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRC-212ENST00000491302 MEP1AQ16819 746 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRC-212ENST00000491302 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
PTPRC-212ENST00000491302 CAMKMTQ7Z624 323 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRC-212ENST00000491302 RASGEF1CQ8N431 466 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRC-212ENST00000491302 NRACQ8N912 160 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRC-212ENST00000491302 OR6J1Q8NGC5 347 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRC-212ENST00000491302 RND1Q92730 232 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRC-212ENST00000491302 ARSGQ96EG1 525 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRC-212ENST00000491302 TTC14Q96N46 770 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRC-212ENST00000491302 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
PTPRC-212ENST00000491302 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
PTPRC-212ENST00000491302 PFDN4Q9NQP4 134 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRC-212ENST00000491302 TAS2R14Q9NYV8 317 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF541Q9H0D2 1346 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRC-212ENST00000491302 A0A1B0GVT2 93 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRC-212ENST00000491302 hDV102S1A0JD36 115 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRC-212ENST00000491302 SOCS6O14544 535 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRC-212ENST00000491302 PRAMEF11O60813 436 aa7.59□□□□□ -1.19
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PTPRC-212ENST00000491302 PPP2R2BQ00005 443 aa7.59□□□□□ -1.19
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PTPRC-212ENST00000491302 LETM2Q2VYF4 491 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRC-212ENST00000491302 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
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PTPRC-212ENST00000491302 SLC38A9Q8NBW4 561 aa7.59□□□□□ -1.19
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PTPRC-212ENST00000491302 NEK1Q96PY6 1258 aa7.59□□□□□ -1.19
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PTPRC-212ENST00000491302 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
PTPRC-212ENST00000491302 FBXL2Q9UKC9 423 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRC-212ENST00000491302 H3BNX3 289 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRC-212ENST00000491302 PLPP2O43688 288 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRC-212ENST00000491302 ZWINTO95229 277 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRC-212ENST00000491302 KCNK5O95279 499 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRC-212ENST00000491302 FYNP06241 537 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRC-212ENST00000491302 GLULP15104 373 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRC-212ENST00000491302 PGGT1BP53609 377 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRC-212ENST00000491302 COG2Q14746 738 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRC-212ENST00000491302 SYT16Q17RD7 645 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRC-212ENST00000491302 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRC-212ENST00000491302 KCNT1Q5JUK3 1230 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRC-212ENST00000491302 ARMC4Q5T2S8 1044 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRC-212ENST00000491302 C18orf63Q68DL7 685 aa7.58□□□□□ -1.2
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PTPRC-212ENST00000491302 BRAT1Q6PJG6 821 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRC-212ENST00000491302 IL27RAQ6UWB1 636 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRC-212ENST00000491302 GCSAMQ8N6F7 178 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRC-212ENST00000491302 HDAC11Q96DB2 347 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRC-212ENST00000491302 HMCESQ96FZ2 354 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRC-212ENST00000491302 ADPGKQ9BRR6 497 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRC-212ENST00000491302 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
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PTPRC-212ENST00000491302 MCM9Q9NXL9 1143 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRC-212ENST00000491302 SELENONQ9NZV5 590 aa7.58□□□□□ -1.2
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PTPRC-212ENST00000491302 A0A0U1RQJ8 604 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRC-212ENST00000491302 URADA6NGE7 173 aa7.57□□□□□ -1.2
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PTPRC-212ENST00000491302 ABATP80404 500 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRC-212ENST00000491302 FAM69BQ5VUD6 431 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRC-212ENST00000491302 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
PTPRC-212ENST00000491302 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
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PTPRC-212ENST00000491302 IQCHQ86VS3 1027 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRC-212ENST00000491302 CEP57Q86XR8 500 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRC-212ENST00000491302 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
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