RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491139.5

NELFE-210, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-210ENST00000491139 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP20.53■□□□□ 0.88
NELFE-210ENST00000491139 CT55Q8WUE5 264 aa20.53■□□□□ 0.88
NELFE-210ENST00000491139 SEC14L1Q92503 715 aa20.53■□□□□ 0.88
NELFE-210ENST00000491139 ERGIC2Q96RQ1 377 aa20.53■□□□□ 0.88
NELFE-210ENST00000491139 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
NELFE-210ENST00000491139 LHX9Q9NQ69 397 aa20.53■□□□□ 0.88
NELFE-210ENST00000491139 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP20.53■□□□□ 0.88
NELFE-210ENST00000491139 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
NELFE-210ENST00000491139 ATXN10Q9UBB4 475 aa20.53■□□□□ 0.88
NELFE-210ENST00000491139 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa20.53■□□□□ 0.88
NELFE-210ENST00000491139 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa20.53■□□□□ 0.88
NELFE-210ENST00000491139 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
NELFE-210ENST00000491139 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa20.52■□□□□ 0.88
NELFE-210ENST00000491139 CA4P22748 312 aa20.52■□□□□ 0.88
NELFE-210ENST00000491139 RPL26P61254 145 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
NELFE-210ENST00000491139 DSC2Q02487 901 aa20.52■□□□□ 0.88
NELFE-210ENST00000491139 CACHD1Q5VU97 1274 aa20.52■□□□□ 0.88
NELFE-210ENST00000491139 CYB5D1Q6P9G0 228 aa20.52■□□□□ 0.88
NELFE-210ENST00000491139 LPCAT1Q8NF37 534 aa20.52■□□□□ 0.88
NELFE-210ENST00000491139 LYSMD1Q96S90 227 aa20.52■□□□□ 0.88
NELFE-210ENST00000491139 ACTL8Q9H568 366 aa20.52■□□□□ 0.88
NELFE-210ENST00000491139 PKD2L2Q9NZM6 624 aa20.52■□□□□ 0.88
NELFE-210ENST00000491139 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
NELFE-210ENST00000491139 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
NELFE-210ENST00000491139 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
NELFE-210ENST00000491139 SCINQ9Y6U3 715 aa20.52■□□□□ 0.88
NELFE-210ENST00000491139 A1L4Q6 167 aa20.51■□□□□ 0.87
NELFE-210ENST00000491139 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
NELFE-210ENST00000491139 PRLP01236 227 aa20.51■□□□□ 0.87
NELFE-210ENST00000491139 FTLP02792 175 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
NELFE-210ENST00000491139 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
NELFE-210ENST00000491139 SLC19A1P41440 591 aa20.51■□□□□ 0.87
NELFE-210ENST00000491139 IHHQ14623 411 aa20.51■□□□□ 0.87
NELFE-210ENST00000491139 NADK2Q4G0N4 442 aa20.51■□□□□ 0.87
NELFE-210ENST00000491139 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa20.51■□□□□ 0.87
NELFE-210ENST00000491139 ALG1LQ6GMV1 187 aa20.51■□□□□ 0.87
NELFE-210ENST00000491139 PRSS42Q7Z5A4 293 aa20.51■□□□□ 0.87
NELFE-210ENST00000491139 CCHCR1Q8TD31 782 aa20.51■□□□□ 0.87
NELFE-210ENST00000491139 THAP4Q8WY91 577 aa20.51■□□□□ 0.87
NELFE-210ENST00000491139 ZDHHC12Q96GR4 267 aa20.51■□□□□ 0.87
NELFE-210ENST00000491139 SLC25A23Q9BV35 468 aa20.51■□□□□ 0.87
NELFE-210ENST00000491139 BRD8Q9H0E9 1235 aa20.51■□□□□ 0.87
NELFE-210ENST00000491139 OR2AG1Q9H205 316 aa20.51■□□□□ 0.87
NELFE-210ENST00000491139 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
NELFE-210ENST00000491139 TTLL3Q9Y4R7 772 aa20.51■□□□□ 0.87
NELFE-210ENST00000491139 MED13Q9UHV7 2174 aa20.51■□□□□ 0.87
NELFE-210ENST00000491139 RGSL1A5PLK6 1076 aa20.5■□□□□ 0.87
NELFE-210ENST00000491139 MTA2O94776 668 aa20.5■□□□□ 0.87
NELFE-210ENST00000491139 DDAH2O95865 285 aa20.5■□□□□ 0.87
NELFE-210ENST00000491139 RNF224P0DH78 156 aa20.5■□□□□ 0.87
NELFE-210ENST00000491139 RARAP10276 462 aa20.5■□□□□ 0.87
NELFE-210ENST00000491139 TCF4P15884 667 aa20.5■□□□□ 0.87
NELFE-210ENST00000491139 KLHL6Q8WZ60 621 aa20.5■□□□□ 0.87
NELFE-210ENST00000491139 ZNF653Q96CK0 615 aa20.5■□□□□ 0.87
NELFE-210ENST00000491139 GPR87Q9BY21 358 aa20.5■□□□□ 0.87
NELFE-210ENST00000491139 PCDH9Q9HC56 1237 aa20.5■□□□□ 0.87
NELFE-210ENST00000491139 TRIM39Q9HCM9 518 aa20.5■□□□□ 0.87
NELFE-210ENST00000491139 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
NELFE-210ENST00000491139 PDE7BQ9NP56 450 aa20.5■□□□□ 0.87
NELFE-210ENST00000491139 ARFGAP3Q9NP61 516 aa20.5■□□□□ 0.87
NELFE-210ENST00000491139 HAUS2Q9NVX0 235 aa20.5■□□□□ 0.87
NELFE-210ENST00000491139 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
NELFE-210ENST00000491139 ADGRG1Q9Y653 693 aa20.5■□□□□ 0.87
NELFE-210ENST00000491139 PDZK1P1A8MUH7 402 aa20.49■□□□□ 0.87
NELFE-210ENST00000491139 GPR89AB7ZAQ6 455 aa20.49■□□□□ 0.87
NELFE-210ENST00000491139 GPR89BP0CG08 455 aa20.49■□□□□ 0.87
NELFE-210ENST00000491139 GZMAP12544 262 aa20.49■□□□□ 0.87
NELFE-210ENST00000491139 NELFEP18615 380 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
NELFE-210ENST00000491139 CAPZBP47756 277 aa20.49■□□□□ 0.87
NELFE-210ENST00000491139 ZNF165P49910 485 aa20.49■□□□□ 0.87
NELFE-210ENST00000491139 UGT8Q16880 541 aa20.49■□□□□ 0.87
NELFE-210ENST00000491139 INSCQ1MX18 579 aa20.49■□□□□ 0.87
NELFE-210ENST00000491139 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
NELFE-210ENST00000491139 IRGCQ6NXR0 463 aa20.49■□□□□ 0.87
NELFE-210ENST00000491139 FAM92BQ6ZTR7 304 aa20.49■□□□□ 0.87
NELFE-210ENST00000491139 RSC1A1Q92681 617 aa20.49■□□□□ 0.87
NELFE-210ENST00000491139 PCDH18Q9HCL0 1135 aa20.49■□□□□ 0.87
NELFE-210ENST00000491139 MLXIPLQ9NP71 852 aa20.49■□□□□ 0.87
NELFE-210ENST00000491139 CASS4Q9NQ75 786 aa20.49■□□□□ 0.87
NELFE-210ENST00000491139 ACSS2Q9NR19 701 aa20.49■□□□□ 0.87
NELFE-210ENST00000491139 POT1Q9NUX5 634 aa20.49■□□□□ 0.87
NELFE-210ENST00000491139 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP20.49■□□□□ 0.87
NELFE-210ENST00000491139 MYO1AQ9UBC5 1043 aa20.49■□□□□ 0.87
NELFE-210ENST00000491139 MATN3O15232 486 aa20.48■□□□□ 0.87
NELFE-210ENST00000491139 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
NELFE-210ENST00000491139 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
NELFE-210ENST00000491139 TIAF1O95411 115 aa20.48■□□□□ 0.87
NELFE-210ENST00000491139 PTPN4P29074 926 aa20.48■□□□□ 0.87
NELFE-210ENST00000491139 CCL11P51671 97 aa20.48■□□□□ 0.87
NELFE-210ENST00000491139 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
NELFE-210ENST00000491139 CCDC183Q5T5S1 534 aa20.48■□□□□ 0.87
NELFE-210ENST00000491139 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
NELFE-210ENST00000491139 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
NELFE-210ENST00000491139 CRTC3Q6UUV7 619 aa20.48■□□□□ 0.87
NELFE-210ENST00000491139 ARRDC2Q8TBH0 407 aa20.48■□□□□ 0.87
NELFE-210ENST00000491139 TEKT4Q8WW24 435 aa20.48■□□□□ 0.87
NELFE-210ENST00000491139 MAML1Q92585 1016 aa20.48■□□□□ 0.87
NELFE-210ENST00000491139 FCRL4Q96PJ5 515 aa20.48■□□□□ 0.87
NELFE-210ENST00000491139 SPATA16Q9BXB7 569 aa20.48■□□□□ 0.87
NELFE-210ENST00000491139 SLC40A1Q9NP59 571 aa20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms