RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490332.2

PTPRK-213, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 612 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-213ENST00000490332 PDP2Q9P2J9 529 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-213ENST00000490332 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-213ENST00000490332 IL17BQ9UHF5 180 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-213ENST00000490332 DPP7Q9UHL4 492 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-213ENST00000490332 SCOCQ9UIL1 159 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-213ENST00000490332 FBXO5Q9UKT4 447 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-213ENST00000490332 PLA2G4CQ9UP65 541 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-213ENST00000490332 CDYLQ9Y232 598 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-213ENST00000490332 TCAF1Q9Y4C2 921 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-213ENST00000490332 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-213ENST00000490332 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-213ENST00000490332 IRAK3Q9Y616 596 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-213ENST00000490332 NUMBLQ9Y6R0 609 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-213ENST00000490332 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-213ENST00000490332 ABCA2Q9BZC7 2435 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-213ENST00000490332 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-213ENST00000490332 A0A088AWK7 358 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-213ENST00000490332 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-213ENST00000490332 SERTM1A2A2V5 107 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-213ENST00000490332 CARNS1A5YM72 827 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-213ENST00000490332 A6NHS1 94 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-213ENST00000490332 DRGXA6NNA5 263 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-213ENST00000490332 UPK3BL1B0FP48 263 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-213ENST00000490332 UPK3BL2E5RIL1 263 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-213ENST00000490332 E9PAM4 449 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-213ENST00000490332 MAN2B1O00754 1011 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-213ENST00000490332 PFDN6O15212 129 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-213ENST00000490332 USP12O75317 370 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-213ENST00000490332 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-213ENST00000490332 TADA2AO75478 443 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-213ENST00000490332 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-213ENST00000490332 VAPBO95292 243 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-213ENST00000490332 TGFB1P01137 390 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-213ENST00000490332 POMCP01189 267 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-213ENST00000490332 PRKCGP05129 697 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-213ENST00000490332 LAMP2P13473 410 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-213ENST00000490332 EPCAMP16422 314 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-213ENST00000490332 GM2AP17900 193 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-213ENST00000490332 GLDCP23378 1020 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-213ENST00000490332 YWHAQP27348 245 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-213ENST00000490332 HOXA6P31267 233 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-213ENST00000490332 CPOXP36551 454 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-213ENST00000490332 BRCC3P46736 316 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-213ENST00000490332 GRIA4P48058 902 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-213ENST00000490332 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
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PTPRK-213ENST00000490332 MAPKAPK2P49137 400 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-213ENST00000490332 SLC5A3P53794 718 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-213ENST00000490332 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-213ENST00000490332 WNT3AP56704 352 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-213ENST00000490332 PLAURQ03405 335 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-213ENST00000490332 BTKQ06187 659 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-213ENST00000490332 IL10RBQ08334 325 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-213ENST00000490332 KLF10Q13118 480 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-213ENST00000490332 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-213ENST00000490332 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-213ENST00000490332 LPIN1Q14693 890 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-213ENST00000490332 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-213ENST00000490332 ACAP2Q15057 778 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-213ENST00000490332 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-213ENST00000490332 PARP15Q460N3 678 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-213ENST00000490332 NOMO2Q5JPE7 1267 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-213ENST00000490332 TSTD2Q5T7W7 516 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-213ENST00000490332 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-213ENST00000490332 DENND5AQ6IQ26 1287 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-213ENST00000490332 RFWD3Q6PCD5 774 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-213ENST00000490332 CD300LGQ6UXG3 332 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-213ENST00000490332 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-213ENST00000490332 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-213ENST00000490332 TPRG1Q6ZUI0 275 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-213ENST00000490332 MTSS1LQ765P7 747 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-213ENST00000490332 CMC1Q7Z7K0 106 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-213ENST00000490332 SCD5Q86SK9 330 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-213ENST00000490332 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-213ENST00000490332 TTC7BQ86TV6 843 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-213ENST00000490332 LRRTM3Q86VH5 581 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-213ENST00000490332 WDR5BQ86VZ2 330 aa5.05□□□□□ -1.6
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PTPRK-213ENST00000490332 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-213ENST00000490332 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-213ENST00000490332 TEX26Q8N6G2 289 aa5.05□□□□□ -1.6
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PTPRK-213ENST00000490332 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-213ENST00000490332 IPMKQ8NFU5 416 aa5.05□□□□□ -1.6
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PTPRK-213ENST00000490332 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-213ENST00000490332 SLC39A13Q96H72 371 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-213ENST00000490332 CRELD1Q96HD1 420 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-213ENST00000490332 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-213ENST00000490332 BTN2A3PQ96KV6 586 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-213ENST00000490332 SPATA17Q96L03 361 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-213ENST00000490332 ZNF558Q96NG5 402 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-213ENST00000490332 ZNF570Q96NI8 536 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-213ENST00000490332 AGAP2Q99490 1192 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-213ENST00000490332 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-213ENST00000490332 GORASP1Q9BQQ3 440 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-213ENST00000490332 EBF4Q9BQW3 602 aa5.05□□□□□ -1.6
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