RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489406.1

UFD1-209, Transcript of ubiquitin recognition factor in ER associated degradation 1, humanhuman

TSL 2

Gene UFD1, Length 994 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFD1-209ENST00000489406 PAK1Q13153 545 aa14.77□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 GPR19Q15760 415 aa14.77□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 PTPN20Q4JDL3 420 aa14.77□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 FAM198BQ6UWH4 519 aa14.77□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa14.77□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 TRIM48Q8IWZ4 208 aa14.77□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 COG1Q8WTW3 980 aa14.77□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 UBXN4Q92575 508 aa14.77□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 TBC1D31Q96DN5 1066 aa14.77□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 CLIP3Q96DZ5 547 aa14.77□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 LRFN5Q96NI6 719 aa14.77□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 IP6K3Q96PC2 410 aa14.77□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 GBP5Q96PP8 586 aa14.77□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 TMEM121Q9BTD3 319 aa14.77□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 KCND1Q9NSA2 647 aa14.77□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 TRIM49BA6NDI0 452 aa14.76□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 LDB2O43679 373 aa14.76□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 UNC5CO95185 931 aa14.76□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 JCHAINP01591 159 aa14.76□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 SYT1P21579 422 aa14.76□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 FLT3P36888 993 aa14.76□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 SOX8P57073 446 aa14.76□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 NCF4Q15080 339 aa14.76□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 RABEP1Q15276 862 aa14.76□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 RAB6CQ53S08 254 aa14.76□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 RESP18Q5W5W9 173 aa14.76□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 FAAH2Q6GMR7 532 aa14.76□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 RFLNAQ6ZTI6 216 aa14.76□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 TTC30BQ8N4P2 665 aa14.76□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 CFAP57Q96MR6 1250 aa14.76□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 RAB6CQ9H0N0 254 aa14.76□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 TMEM51Q9NW97 253 aa14.76□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa14.76□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 EPHA6Q9UF33 1036 aa14.76□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 LHCGRP22888 699 aa14.75□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 SLC19A1P41440 591 aa14.75□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 CSNK1DP48730 415 aa14.75□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 SNX16P57768 344 aa14.75□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 DPTQ07507 201 aa14.75□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 TLR1Q15399 786 aa14.75□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 TRNP1Q6NT89 227 aa14.75□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 ACBD4Q8NC06 268 aa14.75□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 NUDT8Q8WV74 236 aa14.75□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 NR4A3Q92570 626 aa14.75□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 AP2M1Q96CW1 435 aa14.75□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 NSMCE3Q96MG7 304 aa14.75□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 AGAP2Q99490 1192 aa14.75□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 ABCG8Q9H221 673 aa14.75□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa14.75□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 P4HTMQ9NXG6 502 aa14.75□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 SEMA5BQ9P283 1151 aa14.75□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 BTRCQ9Y297 605 aa14.75□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 J3KR12 359 aa14.74□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 IGHEP01854 428 aa14.74□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 ADRA1BP35368 520 aa14.74□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 RORAP35398 523 aa14.74□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 TUBB4BP68371 445 aa14.74□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 TUBB2AQ13885 445 aa14.74□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 PTPRRQ15256 657 aa14.74□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 PTCHD3Q3KNS1 767 aa14.74□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 BNIPLQ7Z465 357 aa14.74□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 TMEM200AQ86VY9 491 aa14.74□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa14.74□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 SYTL1Q8IYJ3 562 aa14.74□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 EHBP1Q8NDI1 1231 aa14.74□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 CPT1BQ92523 772 aa14.74□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 SCAMP4Q969E2 229 aa14.74□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 MAP3K3Q99759 626 aa14.74□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 TUBB2BQ9BVA1 445 aa14.74□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa14.74□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 PCMTD2Q9NV79 361 aa14.74□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 SIK3Q9Y2K2 1263 aa14.74□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 FAM170AA1A519 330 aa14.73□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 YEATS4O95619 227 aa14.73□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 ATP11AP98196 1134 aa14.73□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 CETN1Q12798 172 aa14.73□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 SSPNQ14714 243 aa14.73□□□□□ -0.05
UFD1-209ENST00000489406 CEBPEQ15744 281 aa14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.6 ms