RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487186.5

FAAP20-213, Transcript of FA core complex associated protein 20, human

TSL 2

Gene FAAP20, Length 3,576 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAAP20-213	ENST00000487186	OTUD3	Q5T2D3	398 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	ZNF773	Q6PK81	442 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	PIGZ	Q86VD9	579 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	CLYBL	Q8N0X4	340 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	PGAM4	Q8N0Y7	254 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	PNPT1	Q8TCS8	783 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	PHF21A	Q96BD5	680 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	C9orf16	Q9BUW7	83 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	ATXN3L	Q9H3M9	355 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	SIRPG	Q9P1W8	387 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	CNTN3	Q9P232	1028 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	DNMT3B	Q9UBC3	853 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	CDY2A	Q9Y6F7	541 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	RNF103	O00237	685 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	AMH	P03971	560 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	PLEKHG6	Q3KR16	790 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	PIGG	Q5H8A4	983 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	UNC5B	Q8IZJ1	945 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	ARFGAP1	Q8N6T3	406 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	REXO5	Q96IC2	774 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	PHOX2B	Q99453	314 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	DCAF16	Q9NXF7	216 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	CNOT6	Q9ULM6	557 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	CDY1	Q9Y6F8	540 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	SHOX	O15266	292 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	PAPSS1	O43252	624 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	KLRC2	P26717	231 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	CDC20	Q12834	499 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	CRHR2	Q13324	411 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	GALE	Q14376	348 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	PRPSAP1	Q14558	356 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	SOWAHA	Q2M3V2	549 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	NOXA1	Q86UR1	476 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	OR10Z1	Q8NGY1	313 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	TESC	Q96BS2	214 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	NUAK2	Q9H093	628 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	COG4	Q9H9E3	785 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	DDIT4	Q9NX09	232 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	HEATR9	A2RTY3	570 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	NT5C1B-RDH14	C9J2C7	533 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	APOL1	O14791	398 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	ZBTB14	O43829	449 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	BEST1	O76090	585 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	NTRK1	P04629	796 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	SPN	P16150	400 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	FAS	P25445	335 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	ELK4	P28324	431 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	TAF6	P49848	677 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	HLCS	P50747	726 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	SQLE	Q14534	574 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	STEAP3	Q658P3	488 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	PID1	Q7Z2X4	250 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	SVOP	Q8N4V2	548 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	SLC44A1	Q8WWI5	657 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	KHSRP	Q92945	711 aa	Known RBP eCLIP	13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	SPOCK3	Q9BQ16	436 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	BTBD2	Q9BX70	525 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	GON7	Q9BXV9	100 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	SLCO3A1	Q9UIG8	710 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	NOSIP	Q9Y314	301 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	GON4L	Q3T8J9	2241 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	NUPL2	O15504	423 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	SNAP29	O95721	258 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	SERPINE1	P05121	402 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	PGR	P06401	933 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	TPH1	P17752	444 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	PGGT1B	P53609	377 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	SRP54	P61011	504 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	VBP1	P61758	197 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	PTP4A2	Q12974	167 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	TARDBP	Q13148	414 aa	Known RBP eCLIP	13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	MAP2K5	Q13163	448 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	LYSMD2	Q8IV50	215 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	TBC1D21	Q8IYX1	336 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	OR6F1	Q8NGZ6	308 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	ASB7	Q9H672	318 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	WDR55	Q9H6Y2	383 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	LRRC40	Q9H9A6	602 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	LIN7B	Q9HAP6	207 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	GABRQ	Q9UN88	632 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	YKT6	O15498	198 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	DNAJB5	O75953	348 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	TMEM63A	O94886	807 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	PIGR	P01833	764 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	IL7	P13232	177 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	TKTL1	P51854	596 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	ARMC4	Q5T2S8	1044 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	HEATR6	Q6AI08	1181 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	HFE2	Q6ZVN8	426 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	RP9	Q8TA86	221 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-213	ENST00000487186	C1orf74	Q96LT6	269 aa		13.56	□□□□□ -0.24

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