RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475912.1

PRKD3-208, Transcript of protein kinase D3, human

TSL 3

Gene PRKD3, Length 760 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKD3-208	ENST00000475912	ITM2C	Q9NQX7	267 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	PLSCR4	Q9NRQ2	329 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	OCIAD1	Q9NX40	245 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	RALY	Q9UKM9	306 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	DERA	Q9Y315	318 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	DDX49	Q9Y6V7	483 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	PARP14	Q460N5	1801 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	ATRX	P46100	2492 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	USP24	Q9UPU5	2620 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912		B9A039	149 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	FAM157A	C9JC47	383 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	MPHOSPH10	O00566	681 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	KCNJ13	O60928	360 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	TNNT1	P13805	278 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	HSD3B1	P14060	373 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	RXRA	P19793	462 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	C21orf33	P30042	268 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	DCTD	P32321	178 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	RFC2	P35250	354 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	GPR12	P47775	334 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	ACTR2	P61160	394 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	SEC61A1	P61619	476 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	BNC1	Q01954	994 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	GABPA	Q06546	454 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	GOLGA8F	Q08AF8	430 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	TRAF2	Q12933	501 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	NAPEPLD	Q6IQ20	393 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	GJB7	Q6PEY0	223 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912		Q6ZTC4	211 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	RPAIN	Q86UA6	219 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	GHDC	Q8N2G8	530 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	RASSF8	Q8NHQ8	419 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	RTP4	Q96DX8	246 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	FIZ1	Q96SL8	496 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	RAD9A	Q99638	391 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	MSTO1	Q9BUK6	570 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	MVB12B	Q9H7P6	319 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	VCPKMT	Q9H867	229 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	NOL12	Q9UGY1	213 aa	Known RBP eCLIP	4.85	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	CD207	Q9UJ71	328 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	TANC1	Q9C0D5	1861 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	FAM186A	A6NE01	2351 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	ACACB	O00763	2458 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	SPEG	Q15772	3267 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	CACNA1F	O60840	1977 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	COL11A1	P12107	1806 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	SI	P14410	1827 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	BTBD18	B2RXH4	712 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	LOC730098	B7Z3J9	87 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	WDR46	O15213	610 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	SLC25A17	O43808	307 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	TBX10	O75333	385 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	HNF1B	P35680	557 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	CNTN2	Q02246	1040 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	SIGLEC14	Q08ET2	396 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	HYAL1	Q12794	435 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	TAF5	Q15542	800 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	EPC2	Q52LR7	807 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	SNRNP48	Q6IEG0	339 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	DGLUCY	Q7Z3D6	616 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	PATL1	Q86TB9	770 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	SPATA3	Q8NHX4	192 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	TXNDC15	Q96J42	360 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	SLC25A33	Q9BSK2	321 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	NPL	Q9BXD5	320 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	CLK4	Q9HAZ1	481 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	FEM1B	Q9UK73	627 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	GTF2A1L	Q9UNN4	478 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	DNAJC16	Q9Y2G8	782 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	ZNFX1	Q9P2E3	1918 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
PRKD3-208	ENST00000475912	ANKRD11	Q6UB99	2663 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PRKD3-208	ENST00000475912	TPR	P12270	2363 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PRKD3-208	ENST00000475912	IGLV5-52	A0A0A0MRZ9	124 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PRKD3-208	ENST00000475912	SMTNL1	A8MU46	457 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PRKD3-208	ENST00000475912	LINC01565	O15544	149 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PRKD3-208	ENST00000475912	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PRKD3-208	ENST00000475912	SERPINI2	O75830	405 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PRKD3-208	ENST00000475912	ADA	P00813	363 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PRKD3-208	ENST00000475912	SERPINC1	P01008	464 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PRKD3-208	ENST00000475912	AKR1B1	P15121	316 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PRKD3-208	ENST00000475912	CTPS1	P17812	591 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PRKD3-208	ENST00000475912	COPB2	P35606	906 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PRKD3-208	ENST00000475912	MXI1	P50539	228 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PRKD3-208	ENST00000475912	ARL4C	P56559	192 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PRKD3-208	ENST00000475912	SLC18A2	Q05940	514 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PRKD3-208	ENST00000475912	POU5F1B	Q06416	359 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PRKD3-208	ENST00000475912	GRSF1	Q12849	480 aa	Known RBP eCLIP	4.83	□□□□□ -1.64
PRKD3-208	ENST00000475912	COASY	Q13057	564 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PRKD3-208	ENST00000475912	CAPS	Q13938	189 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PRKD3-208	ENST00000475912	CTXN3	Q4LDR2	81 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PRKD3-208	ENST00000475912	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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