RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472326.2

SGCE-210, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 2

Gene SGCE, Length 453 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-210ENST00000472326 CCDC190Q86UF4 302 aa6.52□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 SLC24A4Q8NFF2 622 aa6.52□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 LRRC8CQ8TDW0 803 aa6.52□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 ALG14Q96F25 216 aa6.52□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 LINGO1Q96FE5 620 aa6.52□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 SEMA3CQ99985 751 aa6.52□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 NEURL2Q9BR09 285 aa6.52□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP6.52□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 SIL1Q9H173 461 aa6.52□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 KAT14Q9H8E8 782 aa6.52□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 EPB41L5Q9HCM4 733 aa6.52□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa6.52□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 KLHL9Q9P2J3 617 aa6.52□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 MTMR6Q9Y217 621 aa6.52□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 TAF1P21675 1872 aa6.51□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa6.51□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 DVL1O14640 695 aa6.51□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 FGF17O60258 216 aa6.51□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 SCGB1D1O95968 90 aa6.51□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 CD53P19397 219 aa6.51□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 SREBF2Q12772 1141 aa6.51□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 ACCSLQ4AC99 568 aa6.51□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa6.51□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 ACSM2BQ68CK6 577 aa6.51□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 SLC26A9Q7LBE3 791 aa6.51□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa6.51□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 UHRF2Q96PU4 802 aa6.51□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 GAD1Q99259 594 aa6.51□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 VPS33BQ9H267 617 aa6.51□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 MAGIXQ9H6Y5 334 aa6.51□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 SH2D4AQ9H788 454 aa6.51□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa6.51□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa6.5□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 FRMD3A2A2Y4 597 aa6.5□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 ACADMP11310 421 aa6.5□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 ACADLP28330 430 aa6.5□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 PHEXP78562 749 aa6.5□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 TFAP4Q01664 338 aa6.5□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 PDSS1Q5T2R2 415 aa6.5□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 TSPAN33Q86UF1 283 aa6.5□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 TMEM255BQ8WV15 326 aa6.5□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 DNAAF4Q8WXU2 420 aa6.5□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 POMGNT1Q8WZA1 660 aa6.5□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 LRRC1Q9BTT6 524 aa6.5□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 PLK3Q9H4B4 646 aa6.5□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa6.5□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa6.49□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 FAM172BPA6NC97 362 aa6.49□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 OR5K3A6NET4 321 aa6.49□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 A8MZ25 164 aa6.49□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 MYO1GB0I1T2 1018 aa6.49□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 MAP2K7O14733 419 aa6.49□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 SCAMP1O15126 338 aa6.49□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 OGG1O15527 345 aa6.49□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 DAB1O75553 588 aa6.49□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 SLC22A3O75751 556 aa6.49□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 SP1P08047 785 aa6.49□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 LRMPQ12912 555 aa6.49□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 PMS2CLQ68D20 193 aa6.49□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 C19orf48Q6RUI8 117 aa6.49□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 SARM1Q6SZW1 724 aa6.49□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa6.49□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 NFE4Q86UQ8 179 aa6.49□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 EMC1Q8N766 993 aa6.49□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 PHF21AQ96BD5 680 aa6.49□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 SKA1Q96BD8 255 aa6.49□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 ZHX3Q9H4I2 956 aa6.49□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa6.49□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 CTAGE9A4FU28 777 aa6.48□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 F5H0A9 414 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 OR2C1O95371 312 aa6.48□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 PLGP00747 810 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 CTAGE8P0CG41 777 aa6.48□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 TMEM11P17152 192 aa6.48□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 MT3P25713 68 aa6.48□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 MSH2P43246 934 aa6.48□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 CD81P60033 236 aa6.48□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 JADE1Q6IE81 842 aa6.48□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 CFAP77Q6ZQR2 320 aa6.48□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 CTAGE4Q8IX94 777 aa6.48□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 PM20D2Q8IYS1 436 aa6.48□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 SCFD2Q8WU76 684 aa6.48□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 OR2A14Q96R47 310 aa6.48□□□□□ -1.37
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