RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469947.5

SH3BP1-206, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,612 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-206ENST00000469947 A0A1W2PP18 115 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 CCDC154A6NI56 674 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 AP3B1O00203 1094 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 PRKACGP22612 351 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 TGFBR1P36897 503 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 MTHFRP42898 656 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 PCYT1AP49585 367 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 TAF6P49848 677 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 WNT3AP56704 352 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 VBP1P61758 197 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 LINC00299Q6ZSB3 139 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 DTWD1Q8N5C7 304 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 FBXO30Q8TB52 745 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 GLMNQ92990 594 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 SLC9A7Q96T83 725 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 SLC39A8Q9C0K1 460 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 MUC13Q9H3R2 512 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 TXNRD2Q9NNW7 524 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 ANKMY1Q9P2S6 941 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 SUN2Q9UH99 717 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 ENPP5Q9UJA9 477 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 INVSQ9Y283 1065 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 GPR45Q9Y5Y3 372 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 NADKO95544 446 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 PTPN2P17706 415 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 IL12AP29459 219 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 GEMP55040 296 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 CD47Q08722 323 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 ITKQ08881 620 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 SLC13A2Q13183 592 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 SELENBP1Q13228 472 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 DGCR6Q14129 220 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 C6orf141Q5SZD1 244 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 KANK2Q63ZY3 851 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 TAF2Q6P1X5 1199 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 SLC27A1Q6PCB7 646 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 SLC22A16Q86VW1 577 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 CILP2Q8IUL8 1156 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 OR13J1Q8NGT2 312 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 BPIFB1Q8TDL5 484 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 HTRA1Q92743 480 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 TSPAN17Q96FV3 270 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 SMOQ99835 787 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 HPS4Q9NQG7 708 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF229Q9UJW7 825 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 ERVK-11Q9UQG0 969 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 PSMD3O43242 534 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 MAFKO60675 156 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 CYBBP04839 570 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 UMPSP11172 480 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 DNAJB2P25686 324 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 HCAR3P49019 387 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 LAIR2Q6ISS4 152 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 ENPP6Q6UWR7 440 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 ZMIZ2Q8NF64 920 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 CNIH3Q8TBE1 160 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 MBOAT4Q96T53 435 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 SCUBE2Q9NQ36 999 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 CRTAC1Q9NQ79 661 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 CEP350Q5VT06 3117 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 SUPT3HB4E1H0 165 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 PSMD11O00231 422 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 MSI1O43347 362 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 CACNG3O60359 315 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 UGT2B11O75310 529 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 MATN4O95460 622 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 CD1DP15813 335 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 MAGP20916 626 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 MAP2K4P45985 399 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 LILRA4P59901 499 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 FOXM1Q08050 763 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 RCAN2Q14206 197 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 ADPRMQ3LIE5 342 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 RANBP10Q6VN20 620 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 ARMCX2Q7L311 632 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 RIMKLAQ8IXN7 391 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 OR7A2PQ8NGA2 310 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 MUL1Q969V5 352 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 NSMCE3Q96MG7 304 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 EHD1Q9H4M9 534 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 FAM118AQ9NWS6 357 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 MPP6Q9NZW5 540 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 KLHL3Q9UH77 587 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 NUDT5Q9UKK9 219 aa13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.8 ms