RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466971.1

NFX1-206, Transcript of nuclear transcription factor, X-box binding 1, human

TSL 5

Gene NFX1, Length 566 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NFX1-206	ENST00000466971	TRMT6	Q9UJA5	497 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	INTS6	Q9UL03	887 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	PLA2G4C	Q9UP65	541 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	CRYL1	Q9Y2S2	319 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	HCN4	Q9Y3Q4	1203 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	TNPO3	Q9Y5L0	923 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	CENPF	P49454	3210 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	PCNT	O95613	3336 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	ZNF106	Q9H2Y7	1883 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	TRBV5-4	A0A0C4DH59	114 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971		A8MT66	165 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971		H0Y858	1186 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971		K7ERQ8	282 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	MATN2	O00339	956 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	FCHO1	O14526	889 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	GIPC1	O14908	333 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	AURKA	O14965	403 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	SMAD6	O43541	496 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	KLK8	O60259	260 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	DLX3	O60479	287 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	SNX2	O60749	519 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	VPS4B	O75351	444 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	ZNF821	O75541	412 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	GJB3	O75712	270 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	RASSF9	O75901	435 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	WFS1	O76024	890 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	PIGN	O95427	931 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	PRAMEF1	O95521	474 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	PRAMEF12	O95522	483 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	MLYCD	O95822	493 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	MT-CO1	P00395	513 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	LMNA	P02545	664 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	PDGFA	P04085	211 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	PRNP	P04156	253 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	S100B	P04271	92 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	FGF4	P08620	206 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	ENO2	P09104	434 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	GSTM1	P09488	218 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	OR56A5	P0C7T3	313 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	ENO3	P13929	434 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	NQO1	P15559	274 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	ZNF16	P17020	682 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	CEBPB	P17676	345 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	TFEB	P19484	476 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	CHRM3	P20309	590 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	XPA	P23025	273 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	DGKA	P23743	735 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	ACRV1	P26436	265 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	FMO4	P31512	558 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	VIPR1	P32241	457 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	SLC8A1	P32418	973 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	HNF1B	P35680	557 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	GLRB	P48167	497 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	DGKG	P49619	791 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	CCR3	P51677	355 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	NAGLU	P54802	743 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	INHBC	P55103	352 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	CDKN2D	P55273	166 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	GSTM4	Q03013	218 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	ELP6	Q0PNE2	266 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	NFATC2	Q13469	925 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	KCNC3	Q14003	757 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	LAPTM4A	Q15012	233 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	MAPRE2	Q15555	327 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	CDKN3	Q16667	212 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	TTC31	Q49AM3	519 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	ACCSL	Q4AC99	568 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	ZNF805	Q5CZA5	627 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	ARL13A	Q5H913	290 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	DGKK	Q5KSL6	1271 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	CDKL4	Q5MAI5	379 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	LY6G5C	Q5SRR4	150 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	ATXN7L2	Q5T6C5	722 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	C6orf163	Q5TEZ5	329 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	PTRHD1	Q6GMV3	140 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	ERAP2	Q6P179	960 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	CYB5D1	Q6P9G0	228 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	ZCCHC23	Q6ZST2	131 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	TAS2R42	Q7RTR8	314 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	DSG4	Q86SJ6	1040 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	GPR149	Q86SP6	731 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	ISCA2	Q86U28	154 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	ADIPOR2	Q86V24	386 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	ATCAY	Q86WG3	371 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	TREML1	Q86YW5	311 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	TMPRSS6	Q8IU80	811 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	CAMK1D	Q8IU85	385 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	MFSD6L	Q8IWD5	586 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	YAF2	Q8IY57	180 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	NRSN1	Q8IZ57	195 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	MYO1H	Q8N1T3	1032 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	FBXO39	Q8N4B4	442 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	CPA6	Q8N4T0	437 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	TTC16	Q8NEE8	873 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	ACVR1C	Q8NER5	493 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	MAGEC3	Q8TD91	643 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	MRPL38	Q96DV4	380 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	TCEAL4	Q96EI5	215 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFX1-206	ENST00000466971	PPP1R16A	Q96I34	528 aa		4.74	□□□□□ -1.65

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