RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464518.1

SLC13A3-208, Transcript of solute carrier family 13 member 3, human

TSL 5

Gene SLC13A3, Length 792 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SLC13A3-208	ENST00000464518	ZNF451	Q9Y4E5	1061 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	ADGRG1	Q9Y653	693 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	TCRBV5S1A1T	A0A578	114 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518		A1L4Q6	167 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	PIPSL	A2A3N6	862 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	NPIPB15	A6NHN6	443 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	DPM1	O60762	260 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	KATNA1	O75449	491 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	KIAA0754	O94854	1291 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	PGLS	O95336	258 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	LDLR	P01130	860 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	ZNF28	P17035	718 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	LEPR	P48357	1165 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	HCAR3	P49019	387 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	ETF1	P62495	437 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	INPP5J	Q15735	1006 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	CHRNA6	Q15825	494 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	DENND2C	Q68D51	928 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	ZNF787	Q6DD87	383 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	DNAJC24	Q6P3W2	148 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	RFX8	Q6ZV50	586 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	MON1B	Q7L1V2	547 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	BPHL	Q86WA6	291 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	PPP1R3B	Q86XI6	285 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	RASGRP3	Q8IV61	690 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	PDCD6IP	Q8WUM4	868 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	SLC20A1	Q8WUM9	679 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	NSMCE3	Q96MG7	304 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	OR6C1	Q96RD1	312 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	ABCG8	Q9H221	673 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	RCOR3	Q9P2K3	495 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	CPNE7	Q9UBL6	633 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	TBC1D29	Q9UFV1	150 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	G3BP2	Q9UN86	482 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	PLEKHM1	Q9Y4G2	1056 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	PCDHGC4	Q9Y5F7	938 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	NOTCH2	Q04721	2471 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	SHANK1	Q9Y566	2161 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	UQCRHL	A0A096LP55	91 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	GPR89A	B7ZAQ6	455 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	DFFA	O00273	331 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	SPAG6	O75602	509 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	CLDN1	O95832	211 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	EML2	O95834	649 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	UQCRH	P07919	91 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	GPR89B	P0CG08	455 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	CHRNB2	P17787	502 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	ERCC2	P18074	760 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	XRCC1	P18887	633 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	LPO	P22079	712 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	CYLC1	P35663	651 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	SOX5	P35711	763 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	UBE2I	P63279	158 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	NADK2	Q4G0N4	442 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	ARMC12	Q5T9G4	340 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	SYT10	Q6XYQ8	523 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	PHYKPL	Q8IUZ5	450 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	RBM12B	Q8IXT5	1001 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	CCDC170	Q8IYT3	715 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	MCEE	Q96PE7	176 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	DESI2	Q9BSY9	194 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	TRIM55	Q9BYV6	548 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	RAB33B	Q9H082	229 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	ACTL8	Q9H568	366 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	CASS4	Q9NQ75	786 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	ACSS2	Q9NR19	701 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	FAM207A	Q9NSI2	230 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	EPHA6	Q9UF33	1036 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	KLHL3	Q9UH77	587 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	TMEM98	Q9Y2Y6	226 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	EPN1	Q9Y6I3	576 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	CREBBP	Q92793	2442 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	TRBV23OR9-2	A0A075B6M9	112 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	FAM170A	A1A519	330 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	TCP11X1	B4DZS4	312 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	DAPK3	O43293	454 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	CEACAM4	O75871	244 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	GFPT2	O94808	682 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	UBXN7	O94888	489 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	PTPN4	P29074	926 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	HNRNPH3	P31942	346 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	JAM2	P57087	298 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	SLC10A7	Q0GE19	358 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	TRAF2	Q12933	501 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	CLEC16A	Q2KHT3	1053 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	ERMARD	Q5T6L9	678 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	LRRC66	Q68CR7	880 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	PPP1R2P3	Q6NXS1	205 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	JMJD6	Q6NYC1	403 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	MARK2	Q7KZI7	788 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	CHST15	Q7LFX5	561 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	TMEM135	Q86UB9	458 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	TSPAN33	Q86UF1	283 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	NPW	Q8N729	165 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	CT55	Q8WUE5	264 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	PIH1D2	Q8WWB5	315 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	KLHL6	Q8WZ60	621 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	PNPLA2	Q96AD5	504 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	CHP1	Q99653	195 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SLC13A3-208	ENST00000464518	TBC1D10A	Q9BXI6	508 aa		12.47	□□□□□ -0.41

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