RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438929.5

BDNF-210, Transcript of brain derived neurotrophic factor, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene BDNF, Length 4,059 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BDNF-210ENST00000438929 TRMOQ9BU70 441 aa6.12□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 DPY30Q9C005 99 aa6.12□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 ABCG8Q9H221 673 aa6.12□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 GBA3Q9H227 469 aa6.12□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 ASB7Q9H672 318 aa6.12□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 SNTG2Q9NY99 539 aa6.12□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 MAP10Q9P2G4 905 aa6.12□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 POLG2Q9UHN1 485 aa6.12□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa6.12□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 NUP98P52948 1817 aa6.12□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 CCDC182A6NF36 153 aa6.12□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 UBXN8O00124 270 aa6.12□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 CLDN5O00501 218 aa6.12□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 B4GALT4O60513 344 aa6.12□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 GUCA1CO95843 209 aa6.12□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 SLC35E2BP0CK96 405 aa6.12□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 GRK3P35626 688 aa6.12□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 CHRNA4P43681 627 aa6.12□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 CCT3P49368 545 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 CD83Q01151 205 aa6.12□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 PWP1Q13610 501 aa6.12□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 ZNF235Q14590 738 aa6.12□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 CCDC142Q17RM4 750 aa6.12□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 TYSND1Q2T9J0 566 aa6.12□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 SLC36A3Q495N2 470 aa6.12□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 ZNF544Q6NX49 715 aa6.12□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 BTLAQ7Z6A9 289 aa6.12□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa6.12□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 PROSER1Q86XN7 944 aa6.12□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 RAB43Q86YS6 212 aa6.12□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 TAGAPQ8N103 731 aa6.12□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 FAM110BQ8TC76 370 aa6.12□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 LRCH3Q96II8 777 aa6.12□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 KCNS3Q9BQ31 491 aa6.12□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 LATS2Q9NRM7 1088 aa6.12□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 ADPRHL2Q9NX46 363 aa6.12□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 GMIPQ9P107 970 aa6.12□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa6.12□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 VPS28Q9UK41 221 aa6.12□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa6.12□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 IFT52Q9Y366 437 aa6.12□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 SPO11Q9Y5K1 396 aa6.12□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 SNX10Q9Y5X0 201 aa6.12□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 NHSQ6T4R5 1651 aa6.12□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa6.12□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 M0QX08 132 aa6.12□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 GPR25O00155 361 aa6.12□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 DYRK3O43781 588 aa6.12□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 PLA2G6O60733 806 aa6.12□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 TMCC2O75069 709 aa6.12□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 RAP2AP10114 183 aa6.12□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 AGXTP21549 392 aa6.12□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 FMO4P31512 558 aa6.12□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 NOS2P35228 1153 aa6.12□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 RAD51Q06609 339 aa6.12□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 TPRG1LQ5T0D9 272 aa6.12□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 BTBD8Q5XKL5 378 aa6.12□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 HMBOX1Q6NT76 420 aa6.12□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 ZNF534Q76KX8 674 aa6.12□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 BTN2A1Q7KYR7 527 aa6.12□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 NECAB2Q7Z6G3 386 aa6.12□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 KBTBD8Q8NFY9 601 aa6.12□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 NDNFQ8TB73 568 aa6.12□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 ARNTL2Q8WYA1 636 aa6.12□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 TEKT5Q96M29 485 aa6.12□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 ULBP1Q9BZM6 244 aa6.12□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 ZNF556Q9HAH1 456 aa6.12□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa6.12□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 PKP3Q9Y446 797 aa6.12□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 NOX1Q9Y5S8 564 aa6.12□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 BTAF1O14981 1849 aa6.12□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 TAF1LQ8IZX4 1826 aa6.12□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 COL24A1Q17RW2 1714 aa6.11□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 M0QZ92 97 aa6.11□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 ZNF195O14628 629 aa6.11□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 FFAR3O14843 346 aa6.11□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 GPR42O15529 346 aa6.11□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 ALDH1A2O94788 518 aa6.11□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 CYBBP04839 570 aa6.11□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 USP17L7P0C7H9 530 aa6.11□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 AKAP5P24588 427 aa6.11□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 GNG2P59768 71 aa6.11□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 FCHO2Q0JRZ9 810 aa6.11□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 ZNF404Q494X3 552 aa6.11□□□□□ -1.43
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