RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-206ENST00000436282 MIA3Q5JRA6 1907 aa14.83□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 B3GAT3O94766 335 aa14.83□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 ALPLP05186 524 aa14.83□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 CDH1P12830 882 aa14.83□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 CD1DP15813 335 aa14.83□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 BRCC3P46736 316 aa14.83□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 DIO3P55073 304 aa14.83□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 WNT3AP56704 352 aa14.83□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 CD300CQ08708 224 aa14.83□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 GRIK2Q13002 908 aa14.83□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 SPCS2Q15005 226 aa14.83□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 BCL2A1Q16548 175 aa14.83□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 PCSK7Q16549 785 aa14.83□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 PAGE3Q5JUK9 113 aa14.83□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 LDLRAP1Q5SW96 308 aa14.83□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 BHLHA9Q7RTU4 235 aa14.83□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa14.83□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 TAC4Q86UU9 113 aa14.83□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 KIAA2013Q8IYS2 634 aa14.83□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 PARP8Q8N3A8 854 aa14.83□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 SCAIQ8N9R8 606 aa14.83□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 OR52K2Q8NGK3 314 aa14.83□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 SLC22A17Q8WUG5 538 aa14.83□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 MYLPFQ96A32 169 aa14.83□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 YIPF2Q9BWQ6 316 aa14.83□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 SLC39A8Q9C0K1 460 aa14.83□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 ARNT2Q9HBZ2 717 aa14.83□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 BTRCQ9Y297 605 aa14.83□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 AQP9O43315 295 aa14.83□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 FKBP1BP68106 108 aa14.83□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 AQP6Q13520 282 aa14.83□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 IL31Q6EBC2 164 aa14.83□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 SPATA19Q7Z5L4 167 aa14.83□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 MINDY2Q8NBR6 621 aa14.83□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 OR13J1Q8NGT2 312 aa14.83□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 TMEM74Q96NL1 305 aa14.83□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 CCDC162PA2VCL2 907 aa14.82□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 LRRC14BA6NHZ5 514 aa14.82□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 UPK1AO00322 258 aa14.82□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 SLC7A4O43246 635 aa14.82□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 PRSS23O95084 383 aa14.82□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 S1PR4O95977 384 aa14.82□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 CYP2C18P33260 490 aa14.82□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 CRTC3Q6UUV7 619 aa14.82□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 KDELC1Q6UW63 502 aa14.82□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 AGMOQ6ZNB7 445 aa14.82□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 NSMCE2Q96MF7 247 aa14.82□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 PSD2Q9BQI7 771 aa14.82□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 FUNDC2Q9BWH2 189 aa14.82□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 RGS18Q9NS28 235 aa14.82□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 AIG1Q9NVV5 245 aa14.82□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 USP22Q9UPT9 525 aa14.82□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 TRPV2Q9Y5S1 764 aa14.82□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 TULP3O75386 442 aa14.82□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 CYBBP04839 570 aa14.82□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 HPCAL1P37235 193 aa14.82□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 GABARAPL2P60520 117 aa14.82□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa14.82□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 BTLAQ7Z6A9 289 aa14.82□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 CLEC4FQ8N1N0 589 aa14.82□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 TMEM86AQ8N2M4 240 aa14.82□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 TMEM199Q8N511 208 aa14.82□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 SH3RF2Q8TEC5 729 aa14.82□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 TMBIM1Q969X1 311 aa14.82□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 SMARCD1Q96GM5 515 aa14.82□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 TEX37Q96LM6 180 aa14.82□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 MFSD1Q9H3U5 465 aa14.82□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 ENPP5Q9UJA9 477 aa14.82□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 GIT1Q9Y2X7 761 aa14.82□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 DGKBQ9Y6T7 804 aa14.82□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 CCDC154A6NI56 674 aa14.81□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 KPNA6O60684 536 aa14.81□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 C1RP00736 705 aa14.81□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 HPRP00739 348 aa14.81□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 CHRNA1P02708 482 aa14.81□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 UGT2B4P06133 528 aa14.81□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 PRR35P0CG20 571 aa14.81□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 IL7RP16871 459 aa14.81□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 TRIM32Q13049 653 aa14.81□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 PFKFB4Q16877 469 aa14.81□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 OR6P1Q8NGX9 317 aa14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.3 ms