RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430445.1

RAB17-208, Transcript of RAB17, member RAS oncogene family, human

TSL 5

Gene RAB17, Length 421 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAB17-208	ENST00000430445	SEMA5A	Q13591	1074 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	DNASE1L3	Q13609	305 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	ANKRD20A8P	Q5CZ79	823 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	ZNF571	Q7Z3V5	609 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	TRIM48	Q8IWZ4	208 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	AOPEP	Q8N6M6	819 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	ARRDC2	Q8TBH0	407 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	CPT1C	Q8TCG5	803 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	CT55	Q8WUE5	264 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	MAML1	Q92585	1016 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	TRIM55	Q9BYV6	548 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	HAUS4	Q9H6D7	363 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	PCDH9	Q9HC56	1237 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	ARFGAP3	Q9NP61	516 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	PKD2L2	Q9NZM6	624 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	ZNF624	Q9P2J8	865 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	PADI1	Q9ULC6	663 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	TTLL3	Q9Y4R7	772 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	ADGRG1	Q9Y653	693 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	RGSL1	A5PLK6	1076 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	LRRC53	A6NM62	1247 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	DDX3X	O00571	662 aa	Known RBP eCLIP	13.56	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	MATN3	O15232	486 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	KIF1C	O43896	1103 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	MFSD11	O43934	449 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	MT-ND3	P03897	115 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	CA4	P22748	312 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	IL4R	P24394	825 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	CASP14	P31944	242 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	ZNF165	P49910	485 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	RPL26	P61254	145 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	NIPAL4	Q0D2K0	466 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	ESPL1	Q14674	2120 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	ASIC2	Q16515	512 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	ZNF648	Q5T619	568 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	PRSS42	Q7Z5A4	293 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	PPP1R3B	Q86XI6	285 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	CCHCR1	Q8TD31	782 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	SSC4D	Q8WTU2	575 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	TEKT4	Q8WW24	435 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	RSC1A1	Q92681	617 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	OR2AG1	Q9H205	316 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	LHX9	Q9NQ69	397 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	RBM22	Q9NW64	420 aa	Known RBP eCLIP	13.56	□□□□□ -0.24	5e-9	■■■□□ 16.3
RAB17-208	ENST00000430445	RCOR3	Q9P2K3	495 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	RPL26L1	Q9UNX3	145 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	ITPR2	Q14571	2701 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	C21orf140	B9A014	251 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	MTA2	O94776	668 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	TIAF1	O95411	115 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	CD48	P09326	243 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	RNF224	P0DH78	156 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	MYBL1	P10243	752 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	CAPZB	P47756	277 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	SLC25A11	Q02978	314 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	GALNT2	Q10471	571 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	MMRN1	Q13201	1228 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	PIGH	Q14442	188 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	KRT81	Q14533	505 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	SEPT7	Q16181	437 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	QPCT	Q16769	361 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	INSC	Q1MX18	579 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	PLA2G4E	Q3MJ16	856 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	LARP7	Q4G0J3	582 aa	Known RBP eCLIP	13.55	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	NADK2	Q4G0N4	442 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	TDRD12	Q587J7	1177 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	ZNF569	Q5MCW4	686 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	CACHD1	Q5VU97	1274 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	TIGD7	Q6NT04	549 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	CRTC3	Q6UUV7	619 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	FAM92B	Q6ZTR7	304 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	KLHL6	Q8WZ60	621 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	TRIM11	Q96F44	468 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	RUFY1	Q96T51	708 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	MLPH	Q9BV36	600 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	BRD8	Q9H0E9	1235 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	ACTL8	Q9H568	366 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	TRIM39	Q9HCM9	518 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	POT1	Q9NUX5	634 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	HAUS2	Q9NVX0	235 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	DTL	Q9NZJ0	730 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	SLC23A2	Q9UGH3	650 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	AMACR	Q9UHK6	382 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	CACNA1D	Q01668	2161 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	CRYBG3	Q68DQ2	2970 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	MED13	Q9UHV7	2174 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	PDZK1P1	A8MUH7	402 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	ANKRD66	B4E2M5	251 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	GPR89A	B7ZAQ6	455 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	CHUK	O15111	745 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	SEMA7A	O75326	666 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	SLC25A14	O95258	325 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	HLA-DQB2	P05538	268 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	GPR89B	P0CG08	455 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	PAFAH1B3	Q15102	231 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	IFI16	Q16666	785 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	CCDC122	Q5T0U0	273 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	E4F1	Q66K89	784 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	NCBP2-AS2	Q69YL0	99 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAB17-208	ENST00000430445	IRGC	Q6NXR0	463 aa		13.54	□□□□□ -0.24

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