RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 OR10H5Q8NGA6 315 aa10.94□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 CLPTM1LQ96KA5 538 aa10.94□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 MNTQ99583 582 aa10.94□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa10.94□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 MUC13Q9H3R2 512 aa10.94□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 ELOVL7A1L3X0 281 aa10.93□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 MAGEB3O15480 346 aa10.93□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP10.93□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 SIN3BO75182 1162 aa10.93□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 STK16O75716 305 aa10.93□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP10.93□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 CCNE2O96020 404 aa10.93□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 ITGB5P18084 799 aa10.93□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 TPSB2P20231 275 aa10.93□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 RPS9P46781 194 aaKnown RBP10.93□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 TPSAB1Q15661 275 aa10.93□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 KCNA10Q16322 511 aa10.93□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 SNAPC1Q16533 368 aa10.93□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP10.93□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP10.93□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 GALNT5Q7Z7M9 940 aa10.93□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 RIOX2Q8IUF8 465 aa10.93□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 CRYBG2Q8N1P7 616 aa10.93□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP10.93□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 ERLEC1Q96DZ1 483 aa10.93□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 DUSP16Q9BY84 665 aa10.93□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP10.93□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 CXorf21Q9HAI6 301 aa10.93□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 SEMA3GQ9NS98 782 aa10.93□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP10.93□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP10.93□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP10.93□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF221Q9UK13 617 aa10.93□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 IRS2Q9Y4H2 1338 aa10.93□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP10.93□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa10.93□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 PRODHO43272 600 aa10.93□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 METTL18O95568 372 aa10.93□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 ASMTP46597 345 aa10.93□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 SCN1BQ07699 218 aa10.93□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 PSMD5Q16401 504 aa10.93□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 NOMO2Q5JPE7 1267 aa10.93□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP10.93□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 ZFPM1Q8IX07 1006 aa10.93□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 RASGEF1CQ8N431 466 aa10.93□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 CBR4Q8N4T8 237 aa10.93□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 CSPG4P5Q96PW8 444 aa10.93□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP10.93□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 LHX5Q9H2C1 402 aa10.93□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP10.93□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 ERVK-5Q9HDB9 667 aa10.93□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 NECTIN3Q9NQS3 549 aa10.93□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP10.93□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP10.93□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 RAB26Q9ULW5 256 aa10.93□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 GPSM3Q9Y4H4 160 aa10.93□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM172BPA6NC97 362 aa10.93□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 GPIP06744 558 aa10.93□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 SAGP10523 405 aaPredicted RBP10.93□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP10.93□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 AP1S2P56377 157 aa10.93□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 GBE1Q04446 702 aa10.93□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 ITGA7Q13683 1181 aa10.93□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP10.93□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM46CQ5VWP2 391 aa10.93□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 OR4K2Q8NGD2 314 aa10.93□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 OR4A15Q8NGL6 344 aa10.93□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 HEXDCQ8WVB3 486 aa10.93□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 DPF3Q92784 378 aa10.93□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP10.93□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 PFDN2Q9UHV9 154 aa10.93□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 QSER1Q2KHR3 1735 aa10.93□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 CLDN5O00501 218 aa10.92□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 CHST10O43529 356 aa10.92□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 SCGNO76038 276 aa10.92□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 AP2A2O94973 939 aa10.92□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 SDC2P34741 201 aa10.92□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 CYP4F8P98187 520 aa10.92□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP10.92□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 HSF2Q03933 536 aa10.92□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 IL18Q14116 193 aa10.92□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 SULT1C3Q6IMI6 304 aa10.92□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP10.92□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 CERS6Q6ZMG9 384 aa10.92□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 ATCAYQ86WG3 371 aa10.92□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 C11orf65Q8NCR3 313 aa10.92□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP10.92□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa10.92□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa10.92□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 NODALQ96S42 347 aa10.92□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 CORO1BQ9BR76 489 aa10.92□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 UNC93B1Q9H1C4 597 aa10.92□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 TNKS2Q9H2K2 1166 aa10.92□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 SP140LQ9H930 580 aa10.92□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP10.92□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa10.92□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 CLDN25C9JDP6 229 aa10.92□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC30A4O14863 429 aa10.92□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 MT-ND1P03886 318 aa10.92□□□□□ -0.66
EFTUD2-202ENST00000426333 LIPEQ05469 1076 aa10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms