RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391066.1

RNU6-1000P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1000, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1000P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1000P-201ENST00000391066 OGG1O15527 345 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-1000P-201ENST00000391066 ZNHIT1O43257 154 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-1000P-201ENST00000391066 WDR1O75083 606 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-1000P-201ENST00000391066 IGLV2-11P01706 119 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-1000P-201ENST00000391066 ACTN1P12814 892 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-1000P-201ENST00000391066 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
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RNU6-1000P-201ENST00000391066 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
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RNU6-1000P-201ENST00000391066 C9orf50Q5SZB4 431 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-1000P-201ENST00000391066 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
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RNU6-1000P-201ENST00000391066 TTC39CQ8N584 583 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-1000P-201ENST00000391066 SLC38A9Q8NBW4 561 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-1000P-201ENST00000391066 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
RNU6-1000P-201ENST00000391066 SLC38A5Q8WUX1 472 aa4.9□□□□□ -1.63
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RNU6-1000P-201ENST00000391066 HS6ST1O60243 411 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1000P-201ENST00000391066 ZBED4O75132 1171 aa4.89□□□□□ -1.63
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RNU6-1000P-201ENST00000391066 ACCSLQ4AC99 568 aa4.89□□□□□ -1.63
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RNU6-1000P-201ENST00000391066 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
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RNU6-1000P-201ENST00000391066 CHST9Q7L1S5 443 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1000P-201ENST00000391066 CTAGE4Q8IX94 777 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1000P-201ENST00000391066 OR13A1Q8NGR1 328 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1000P-201ENST00000391066 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1000P-201ENST00000391066 NEURL2Q9BR09 285 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1000P-201ENST00000391066 LRRC1Q9BTT6 524 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1000P-201ENST00000391066 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP4.89□□□□□ -1.63
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RNU6-1000P-201ENST00000391066 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa4.89□□□□□ -1.63
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RNU6-1000P-201ENST00000391066 ZNF112Q9UJU3 913 aa4.89□□□□□ -1.63
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RNU6-1000P-201ENST00000391066 AMPHP49418 695 aa4.88□□□□□ -1.63
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RNU6-1000P-201ENST00000391066 SMC6Q96SB8 1091 aa4.88□□□□□ -1.63
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RNU6-1000P-201ENST00000391066 TCF7L2Q9NQB0 619 aa4.88□□□□□ -1.63
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RNU6-1000P-201ENST00000391066 NOTCH4Q99466 2003 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-1000P-201ENST00000391066 OR5K3A6NET4 321 aa4.87□□□□□ -1.63
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RNU6-1000P-201ENST00000391066 LMX1BO60663 402 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-1000P-201ENST00000391066 CRYAAP02489 173 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-1000P-201ENST00000391066 GM2AP17900 193 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-1000P-201ENST00000391066 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
RNU6-1000P-201ENST00000391066 PLIN5Q00G26 463 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-1000P-201ENST00000391066 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
RNU6-1000P-201ENST00000391066 TMEM198Q66K66 360 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-1000P-201ENST00000391066 FAM171BQ6P995 826 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-1000P-201ENST00000391066 Q6ZTC4 211 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-1000P-201ENST00000391066 PM20D2Q8IYS1 436 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-1000P-201ENST00000391066 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
RNU6-1000P-201ENST00000391066 GCSAMQ8N6F7 178 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-1000P-201ENST00000391066 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
RNU6-1000P-201ENST00000391066 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-1000P-201ENST00000391066 TMEM255BQ8WV15 326 aa4.87□□□□□ -1.63
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